MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 17518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_011004	CGG	2	6	2431652	2431657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_011004	CGG	2	6	2431659	2431664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7003	NC_011004	CG	3	6	2432573	2432578	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7004	NC_011004	GCA	2	6	2432592	2432597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7005	NC_011004	GCC	2	6	2432599	2432604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7006	NC_011004	TTA	2	6	2432611	2432616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_011004	TCT	2	6	2432664	2432669	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7008	NC_011004	CG	3	6	2432704	2432709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7009	NC_011004	AGCCG	2	10	2432722	2432731	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7010	NC_011004	CCG	2	6	2432786	2432791	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7011	NC_011004	ACGG	2	8	2432817	2432824	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7012	NC_011004	T	6	6	2432850	2432855	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_011004	ACC	2	6	2432895	2432900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7014	NC_011004	GCTT	2	8	2434725	2434732	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7015	NC_011004	ACG	2	6	2434738	2434743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_011004	CATC	2	8	2434766	2434773	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7017	NC_011004	AGC	2	6	2435813	2435818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7018	NC_011004	CGGA	2	8	2435937	2435944	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7019	NC_011004	CGC	3	9	2436950	2436958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7020	NC_011004	CGGC	2	8	2437011	2437018	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7021	NC_011004	CGGG	2	8	2437039	2437046	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7022	NC_011004	GCC	2	6	2437051	2437056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7023	NC_011004	GCA	2	6	2438139	2438144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7024	NC_011004	CCG	2	6	2438329	2438334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7025	NC_011004	CTTG	3	12	2438339	2438350	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7026	NC_011004	CG	3	6	2439162	2439167	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7027	NC_011004	AAG	3	9	2439192	2439200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7028	NC_011004	CGC	2	6	2440455	2440460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7029	NC_011004	CG	3	6	2440471	2440476	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7030	NC_011004	TGGT	2	8	2441465	2441472	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_011004	CAG	2	6	2441496	2441501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7032	NC_011004	AGA	2	6	2441531	2441536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_011004	CGG	2	6	2441606	2441611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7034	NC_011004	CGG	2	6	2441723	2441728	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7035	NC_011004	GCC	2	6	2441745	2441750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7036	NC_011004	TTG	2	6	2441817	2441822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_011004	GTC	3	9	2441991	2441999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7038	NC_011004	GGA	2	6	2442000	2442005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7039	NC_011004	GCG	2	6	2443090	2443095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7040	NC_011004	AGC	2	6	2443169	2443174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7041	NC_011004	TCCGC	2	10	2443214	2443223	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
7042	NC_011004	GCA	2	6	2445568	2445573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7043	NC_011004	GCC	2	6	2445576	2445581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7044	NC_011004	GC	3	6	2446512	2446517	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7045	NC_011004	TGGGG	2	10	2446544	2446553	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_011004	CCCCCG	2	12	2446613	2446624	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
7047	NC_011004	GAGGGG	2	12	2446637	2446648	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
7048	NC_011004	AGA	2	6	2446649	2446654	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7049	NC_011004	CGG	2	6	2450425	2450430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7050	NC_011004	GAA	2	6	2450433	2450438	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_011004	CAGC	2	8	2450837	2450844	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7052	NC_011004	CG	3	6	2450857	2450862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7053	NC_011004	GCA	2	6	2452557	2452562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7054	NC_011004	GTT	2	6	2452563	2452568	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_011004	CGGGG	2	10	2452639	2452648	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
7056	NC_011004	TCT	2	6	2453782	2453787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7057	NC_011004	CGTT	2	8	2455744	2455751	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7058	NC_011004	AGG	2	6	2455857	2455862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7059	NC_011004	CGA	2	6	2456477	2456482	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7060	NC_011004	CGG	2	6	2456491	2456496	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7061	NC_011004	AGC	2	6	2456571	2456576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7062	NC_011004	GC	3	6	2456608	2456613	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7063	NC_011004	ATCGG	2	10	2456614	2456623	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
7064	NC_011004	CGC	2	6	2456701	2456706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7065	NC_011004	A	6	6	2456729	2456734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7066	NC_011004	GTC	2	6	2456735	2456740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7067	NC_011004	AGC	2	6	2456838	2456843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7068	NC_011004	CCA	2	6	2456886	2456891	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7069	NC_011004	CGC	2	6	2456934	2456939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7070	NC_011004	CGG	2	6	2457685	2457690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7071	NC_011004	GC	3	6	2457710	2457715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7072	NC_011004	CGG	2	6	2457742	2457747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7073	NC_011004	TC	3	6	2459125	2459130	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7074	NC_011004	ACG	2	6	2459204	2459209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7075	NC_011004	CAT	2	6	2459214	2459219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7076	NC_011004	ACG	2	6	2459230	2459235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7077	NC_011004	CAT	2	6	2459240	2459245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7078	NC_011004	ACG	2	6	2461608	2461613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7079	NC_011004	CAT	2	6	2461618	2461623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7080	NC_011004	CATC	2	8	2462167	2462174	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7081	NC_011004	ACG	2	6	2462214	2462219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7082	NC_011004	CAT	2	6	2462224	2462229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7083	NC_011004	GGT	2	6	2462266	2462271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7084	NC_011004	TGA	2	6	2462278	2462283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7085	NC_011004	GTC	2	6	2462326	2462331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7086	NC_011004	TGG	2	6	2462348	2462353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7087	NC_011004	CGC	2	6	2462451	2462456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7088	NC_011004	ACC	2	6	2462461	2462466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7089	NC_011004	CGCC	2	8	2462488	2462495	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7090	NC_011004	T	6	6	2463055	2463060	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7091	NC_011004	TG	3	6	2463188	2463193	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7092	NC_011004	TGA	2	6	2463223	2463228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_011004	CCA	2	6	2463249	2463254	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7094	NC_011004	GAC	2	6	2463256	2463261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7095	NC_011004	CGGGA	2	10	2463273	2463282	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
7096	NC_011004	CGG	2	6	2463288	2463293	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7097	NC_011004	CGCC	2	8	2463301	2463308	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7098	NC_011004	CG	3	6	2463318	2463323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7099	NC_011004	GCC	2	6	2463325	2463330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7100	NC_011004	CGT	2	6	2463337	2463342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7101	NC_011004	ATG	2	6	2463356	2463361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_011004	GCC	2	6	2463368	2463373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7103	NC_011004	TATT	2	8	2464067	2464074	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_011004	GCA	2	6	2464122	2464127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7105	NC_011004	GAAG	2	8	2464289	2464296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_011004	TGC	2	6	2464320	2464325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7107	NC_011004	GCCA	2	8	2464399	2464406	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7108	NC_011004	CAA	2	6	2464431	2464436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7109	NC_011004	GCG	2	6	2464537	2464542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7110	NC_011004	GC	3	6	2470900	2470905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7111	NC_011004	CTTCG	2	10	2470956	2470965	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
7112	NC_011004	CGC	2	6	2471007	2471012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7113	NC_011004	CG	4	8	2471022	2471029	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7114	NC_011004	GC	3	6	2471080	2471085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7115	NC_011004	GGCC	2	8	2471094	2471101	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7116	NC_011004	CCG	2	6	2471229	2471234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7117	NC_011004	CGGC	2	8	2471235	2471242	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7118	NC_011004	GCG	2	6	2471243	2471248	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7119	NC_011004	TTA	2	6	2471258	2471263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_011004	CGC	2	6	2471377	2471382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7121	NC_011004	GTC	2	6	2471383	2471388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7122	NC_011004	CG	3	6	2471433	2471438	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7123	NC_011004	GCGTC	2	10	2471448	2471457	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
7124	NC_011004	CGA	2	6	2471502	2471507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7125	NC_011004	CCG	2	6	2471542	2471547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7126	NC_011004	GCT	2	6	2471562	2471567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7127	NC_011004	CCA	2	6	2471570	2471575	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7128	NC_011004	GCG	2	6	2471607	2471612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7129	NC_011004	GGT	2	6	2471619	2471624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7130	NC_011004	CAT	2	6	2471649	2471654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7133	NC_011004	GAT	2	6	2471747	2471752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7135	NC_011004	ACCC	2	8	2471795	2471802	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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7144	NC_011004	GGCT	2	8	2472978	2472985	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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7250	NC_011004	GCC	2	6	2495410	2495415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7251	NC_011004	CTT	2	6	2495456	2495461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7252	NC_011004	GTCC	2	8	2495468	2495475	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7253	NC_011004	TGC	2	6	2495481	2495486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7254	NC_011004	CGC	2	6	2495589	2495594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7258	NC_011004	TGC	2	6	2495757	2495762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7259	NC_011004	CGC	2	6	2495764	2495769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7260	NC_011004	AGCCG	2	10	2495810	2495819	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
7261	NC_011004	TGC	2	6	2495930	2495935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7272	NC_011004	CAC	2	6	2496558	2496563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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