MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 17518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_011004	CGGC	2	8	2247056	2247063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6502	NC_011004	CG	3	6	2247119	2247124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6503	NC_011004	ATGC	2	8	2247663	2247670	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6504	NC_011004	GAG	2	6	2247713	2247718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_011004	CAA	2	6	2249335	2249340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6506	NC_011004	TC	3	6	2250597	2250602	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6507	NC_011004	ACG	2	6	2250647	2250652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_011004	GGC	2	6	2250798	2250803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6509	NC_011004	TGC	2	6	2254591	2254596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6510	NC_011004	TGC	2	6	2254664	2254669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_011004	GCG	2	6	2254777	2254782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6512	NC_011004	GCC	2	6	2254802	2254807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6513	NC_011004	GTG	2	6	2254836	2254841	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6514	NC_011004	GGT	2	6	2254932	2254937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_011004	GTCA	2	8	2254942	2254949	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6516	NC_011004	GAC	2	6	2254957	2254962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6517	NC_011004	AGC	2	6	2254994	2254999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_011004	CGG	2	6	2255024	2255029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6519	NC_011004	CGA	2	6	2255055	2255060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6520	NC_011004	CTG	2	6	2255062	2255067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6521	NC_011004	AGG	2	6	2255167	2255172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_011004	CGA	2	6	2255225	2255230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6523	NC_011004	CCA	2	6	2255323	2255328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6524	NC_011004	CATG	2	8	2255375	2255382	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6525	NC_011004	CCG	2	6	2255421	2255426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6526	NC_011004	CGC	2	6	2255441	2255446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6527	NC_011004	TCG	2	6	2255449	2255454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6528	NC_011004	TGC	2	6	2255485	2255490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_011004	TGC	2	6	2255515	2255520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6530	NC_011004	ATC	2	6	2255547	2255552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6531	NC_011004	CAT	2	6	2255622	2255627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6532	NC_011004	AAT	2	6	2255637	2255642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6533	NC_011004	TTC	2	6	2255655	2255660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6534	NC_011004	AGC	2	6	2255833	2255838	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6535	NC_011004	GCC	2	6	2255864	2255869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6536	NC_011004	CGA	2	6	2255900	2255905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6537	NC_011004	TGG	2	6	2255914	2255919	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_011004	GTC	2	6	2255979	2255984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6539	NC_011004	TCG	2	6	2256016	2256021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_011004	GT	3	6	2256110	2256115	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6541	NC_011004	TCG	2	6	2256142	2256147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6542	NC_011004	CCTT	2	8	2256154	2256161	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6543	NC_011004	TCC	2	6	2256170	2256175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6544	NC_011004	CG	4	8	2256267	2256274	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6545	NC_011004	TGG	2	6	2257518	2257523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_011004	TGC	2	6	2257555	2257560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6547	NC_011004	GGGT	2	8	2258665	2258672	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6548	NC_011004	TTC	2	6	2258693	2258698	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_011004	AGT	2	6	2260486	2260491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_011004	TCGC	2	8	2261967	2261974	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6551	NC_011004	GAA	2	6	2262036	2262041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6552	NC_011004	CGG	2	6	2262267	2262272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6553	NC_011004	GCC	2	6	2262283	2262288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6554	NC_011004	GGGC	2	8	2262347	2262354	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6555	NC_011004	TCG	2	6	2262444	2262449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6556	NC_011004	CGC	2	6	2262452	2262457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6557	NC_011004	CTT	2	6	2262470	2262475	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_011004	TCG	2	6	2262502	2262507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6559	NC_011004	GTG	2	6	2264179	2264184	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6560	NC_011004	GCC	2	6	2264280	2264285	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6561	NC_011004	ACG	2	6	2264287	2264292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6562	NC_011004	CAA	2	6	2264348	2264353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6563	NC_011004	GAG	2	6	2264355	2264360	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_011004	GCC	2	6	2264540	2264545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6565	NC_011004	CGG	2	6	2264564	2264569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6566	NC_011004	TCTTG	2	10	2264573	2264582	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
6567	NC_011004	CG	3	6	2266466	2266471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6568	NC_011004	CG	3	6	2266477	2266482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6569	NC_011004	GCG	2	6	2266523	2266528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6570	NC_011004	ATT	2	6	2266542	2266547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_011004	CGC	2	6	2268178	2268183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6572	NC_011004	CCG	3	9	2268196	2268204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6573	NC_011004	TCGC	2	8	2268213	2268220	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6574	NC_011004	CAC	4	12	2268230	2268241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6575	NC_011004	GC	3	6	2269085	2269090	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6576	NC_011004	GAC	2	6	2269104	2269109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6577	NC_011004	T	6	6	2269110	2269115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6578	NC_011004	TCA	3	9	2269130	2269138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6579	NC_011004	AGCGC	2	10	2270410	2270419	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6580	NC_011004	TCTCCC	2	12	2270424	2270435	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6581	NC_011004	GAGG	2	8	2270446	2270453	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
6582	NC_011004	CGT	2	6	2270509	2270514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6583	NC_011004	CCG	2	6	2270518	2270523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6584	NC_011004	TCTCGA	2	12	2270565	2270576	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6585	NC_011004	GGGC	2	8	2270588	2270595	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
6586	NC_011004	TCG	2	6	2270611	2270616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_011004	CGT	2	6	2270645	2270650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6588	NC_011004	GAC	2	6	2270678	2270683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6589	NC_011004	ATG	2	6	2272002	2272007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6590	NC_011004	TGA	2	6	2272099	2272104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6591	NC_011004	TC	3	6	2273926	2273931	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6592	NC_011004	ATCG	2	8	2274017	2274024	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6593	NC_011004	ACA	2	6	2274031	2274036	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6594	NC_011004	CG	3	6	2274042	2274047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6595	NC_011004	CTC	2	6	2274077	2274082	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6596	NC_011004	GGC	2	6	2274100	2274105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6597	NC_011004	CGC	2	6	2274111	2274116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6598	NC_011004	GC	3	6	2275182	2275187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6599	NC_011004	ACC	2	6	2275193	2275198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6600	NC_011004	AGTGG	2	10	2276372	2276381	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6601	NC_011004	GGC	2	6	2276402	2276407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6602	NC_011004	GCG	2	6	2276421	2276426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6603	NC_011004	TGC	2	6	2276433	2276438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6604	NC_011004	CG	3	6	2276753	2276758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6605	NC_011004	CG	3	6	2276760	2276765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6606	NC_011004	GGC	2	6	2277076	2277081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6607	NC_011004	TAA	2	6	2277121	2277126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_011004	GGC	2	6	2277926	2277931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6609	NC_011004	CGC	3	9	2277942	2277950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6610	NC_011004	CAT	2	6	2277973	2277978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6611	NC_011004	CG	3	6	2280814	2280819	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6612	NC_011004	TCG	2	6	2280873	2280878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6613	NC_011004	TC	3	6	2281620	2281625	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6614	NC_011004	CGG	2	6	2281737	2281742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6615	NC_011004	CG	3	6	2281782	2281787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6616	NC_011004	ACG	2	6	2281817	2281822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6617	NC_011004	CCG	2	6	2283237	2283242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6618	NC_011004	GCC	2	6	2283328	2283333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6619	NC_011004	CAAT	2	8	2283344	2283351	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6620	NC_011004	AGC	2	6	2283367	2283372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6621	NC_011004	ATG	2	6	2283401	2283406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_011004	AGTGA	2	10	2283433	2283442	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_011004	GAC	2	6	2283486	2283491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6624	NC_011004	CGCA	2	8	2283566	2283573	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6625	NC_011004	TTCG	2	8	2284513	2284520	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6626	NC_011004	TGGTC	2	10	2284997	2285006	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6627	NC_011004	GC	4	8	2285478	2285485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6628	NC_011004	CAG	2	6	2285492	2285497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6629	NC_011004	GAC	2	6	2285503	2285508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6630	NC_011004	GCCG	2	8	2285993	2286000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6631	NC_011004	CGC	2	6	2286046	2286051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6632	NC_011004	GAG	2	6	2286080	2286085	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6633	NC_011004	GAC	2	6	2287079	2287084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6634	NC_011004	GCCG	2	8	2287642	2287649	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6635	NC_011004	CGG	2	6	2287679	2287684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6637	NC_011004	CCCA	2	8	2287767	2287774	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
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6641	NC_011004	CG	3	6	2293120	2293125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6642	NC_011004	GGCGC	2	10	2293180	2293189	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6643	NC_011004	GCGCC	2	10	2294595	2294604	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6644	NC_011004	CGC	3	9	2294627	2294635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6646	NC_011004	GCA	2	6	2297412	2297417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6651	NC_011004	GCCGG	2	10	2299084	2299093	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
6652	NC_011004	CTCG	2	8	2299124	2299131	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6660	NC_011004	GC	3	6	2303496	2303501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6664	NC_011004	ACGTC	2	10	2304704	2304713	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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6744	NC_011004	CGGGG	2	10	2331409	2331418	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
6745	NC_011004	CAGA	2	8	2332423	2332430	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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6756	NC_011004	GC	3	6	2335272	2335277	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6757	NC_011004	TC	3	6	2335288	2335293	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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