MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 17518

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_011004	ACT	2	6	1918655	1918660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5502	NC_011004	ACG	2	6	1918688	1918693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5503	NC_011004	GGCC	2	8	1918716	1918723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5504	NC_011004	CGG	2	6	1918727	1918732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_011004	GGC	2	6	1918734	1918739	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_011004	GCA	2	6	1918811	1918816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_011004	CGGC	2	8	1918850	1918857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5508	NC_011004	GCGCC	2	10	1918874	1918883	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5509	NC_011004	CGA	2	6	1918887	1918892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_011004	GCG	2	6	1918959	1918964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_011004	GCCG	2	8	1918972	1918979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5512	NC_011004	GC	3	6	1919055	1919060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5513	NC_011004	TTCT	2	8	1919086	1919093	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5514	NC_011004	TGC	2	6	1919137	1919142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_011004	AGCG	2	8	1921392	1921399	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5516	NC_011004	AGC	2	6	1921460	1921465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5517	NC_011004	CTA	2	6	1921545	1921550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_011004	GGA	2	6	1921591	1921596	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_011004	GCC	2	6	1922803	1922808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5520	NC_011004	TC	3	6	1923228	1923233	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5521	NC_011004	CGC	2	6	1923266	1923271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5522	NC_011004	GTG	2	6	1923283	1923288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_011004	GGC	2	6	1923353	1923358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_011004	CGA	2	6	1923361	1923366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_011004	GGA	2	6	1923370	1923375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_011004	CGG	2	6	1923620	1923625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_011004	CGG	2	6	1923645	1923650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_011004	GCC	2	6	1923656	1923661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5529	NC_011004	CGT	2	6	1924221	1924226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_011004	GGCG	2	8	1924361	1924368	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5531	NC_011004	TCG	2	6	1924395	1924400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_011004	CG	3	6	1924861	1924866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5533	NC_011004	CGG	2	6	1924876	1924881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_011004	GC	3	6	1925636	1925641	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5535	NC_011004	GCT	2	6	1925647	1925652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_011004	TGA	2	6	1926769	1926774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5537	NC_011004	GCGT	2	8	1926790	1926797	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5538	NC_011004	ACC	2	6	1926876	1926881	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5539	NC_011004	CGA	2	6	1926892	1926897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5540	NC_011004	GAC	2	6	1926909	1926914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5541	NC_011004	GCC	2	6	1926954	1926959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5542	NC_011004	CTGT	2	8	1927049	1927056	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5543	NC_011004	ATCC	2	8	1927063	1927070	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5544	NC_011004	TCC	2	6	1928085	1928090	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5545	NC_011004	CG	3	6	1928094	1928099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5546	NC_011004	TGG	2	6	1929391	1929396	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_011004	GCT	2	6	1929403	1929408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_011004	CGG	2	6	1929463	1929468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5549	NC_011004	AT	3	6	1929606	1929611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_011004	TGG	2	6	1929631	1929636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5551	NC_011004	GCCG	2	8	1929640	1929647	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5552	NC_011004	CGC	2	6	1929648	1929653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5553	NC_011004	CGC	2	6	1930545	1930550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5554	NC_011004	AGG	2	6	1930578	1930583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5555	NC_011004	GCG	2	6	1933527	1933532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_011004	GCAG	2	8	1933567	1933574	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5557	NC_011004	GGC	2	6	1933674	1933679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5558	NC_011004	CG	3	6	1933750	1933755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5559	NC_011004	GTC	2	6	1935786	1935791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_011004	GCGA	2	8	1935802	1935809	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5561	NC_011004	CGC	2	6	1935876	1935881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5562	NC_011004	TCT	2	6	1937125	1937130	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_011004	G	7	7	1937141	1937147	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_011004	TCC	2	6	1938422	1938427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5565	NC_011004	CGC	2	6	1938448	1938453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5566	NC_011004	CGG	4	12	1938458	1938469	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5567	NC_011004	CGG	2	6	1938506	1938511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_011004	AGCGGC	2	12	1938540	1938551	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_011004	TGC	2	6	1938649	1938654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5570	NC_011004	GC	3	6	1938704	1938709	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5571	NC_011004	ACA	2	6	1938712	1938717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5572	NC_011004	GAGC	2	8	1938749	1938756	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5573	NC_011004	GCC	2	6	1941682	1941687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5574	NC_011004	CGG	2	6	1942360	1942365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_011004	CGC	2	6	1942387	1942392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5576	NC_011004	CG	3	6	1942401	1942406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5577	NC_011004	TGAT	2	8	1942437	1942444	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_011004	GGC	2	6	1944030	1944035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5579	NC_011004	GCC	2	6	1944039	1944044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5580	NC_011004	C	6	6	1944589	1944594	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5581	NC_011004	TGA	3	9	1944671	1944679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_011004	CGG	2	6	1944680	1944685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_011004	CGA	2	6	1945068	1945073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5584	NC_011004	TCG	2	6	1945094	1945099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_011004	GGTGC	2	10	1945142	1945151	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
5586	NC_011004	AGG	2	6	1945240	1945245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_011004	GA	3	6	1945269	1945274	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_011004	GTA	2	6	1945295	1945300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5589	NC_011004	CGAT	2	8	1945452	1945459	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5590	NC_011004	AC	3	6	1945480	1945485	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5591	NC_011004	GGC	2	6	1945501	1945506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_011004	TCC	2	6	1945568	1945573	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5593	NC_011004	AGG	2	6	1945626	1945631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5594	NC_011004	CG	3	6	1945679	1945684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5595	NC_011004	CGGAT	2	10	1945773	1945782	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5596	NC_011004	AG	3	6	1945950	1945955	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5597	NC_011004	TGT	2	6	1946044	1946049	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5598	NC_011004	TGG	2	6	1946062	1946067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5599	NC_011004	ACC	2	6	1946177	1946182	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5600	NC_011004	GCGGG	2	10	1946205	1946214	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5601	NC_011004	TCG	2	6	1946257	1946262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5602	NC_011004	GCGCG	2	10	1946267	1946276	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5603	NC_011004	CG	5	10	1947587	1947596	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5604	NC_011004	GCG	2	6	1947735	1947740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_011004	GC	3	6	1947782	1947787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5606	NC_011004	GGC	2	6	1947789	1947794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5607	NC_011004	GCA	2	6	1948492	1948497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_011004	TCGG	2	8	1949859	1949866	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5609	NC_011004	CTGC	2	8	1949900	1949907	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5610	NC_011004	CCG	2	6	1950710	1950715	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5611	NC_011004	CA	3	6	1950756	1950761	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5612	NC_011004	GCG	2	6	1954149	1954154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_011004	CAT	2	6	1956726	1956731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_011004	GCA	2	6	1956805	1956810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5615	NC_011004	AGC	2	6	1956901	1956906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5616	NC_011004	A	6	6	1956912	1956917	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_011004	GCG	2	6	1956935	1956940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_011004	GAA	2	6	1957767	1957772	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_011004	AGC	2	6	1957874	1957879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5620	NC_011004	CGA	2	6	1958044	1958049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_011004	CAT	2	6	1959403	1959408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_011004	CGT	2	6	1959442	1959447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_011004	GTG	2	6	1960009	1960014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_011004	CTGGT	2	10	1960037	1960046	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5625	NC_011004	G	6	6	1960067	1960072	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_011004	GCA	2	6	1961605	1961610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5627	NC_011004	GATT	2	8	1961623	1961630	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5628	NC_011004	CGA	2	6	1961644	1961649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5629	NC_011004	TCA	3	9	1961661	1961669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5631	NC_011004	G	6	6	1961763	1961768	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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