MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 chromosome

Total Repeats: 11760

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010994	CTCG	2	8	2165687	2165694	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5502	NC_010994	GC	3	6	2165725	2165730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5503	NC_010994	TGA	2	6	2165737	2165742	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_010994	GCGA	2	8	2165766	2165773	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5505	NC_010994	TGC	2	6	2165788	2165793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5506	NC_010994	CTG	2	6	2165805	2165810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_010994	ACG	2	6	2168023	2168028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5508	NC_010994	TCC	2	6	2168497	2168502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5509	NC_010994	GCA	2	6	2168508	2168513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5510	NC_010994	ATT	2	6	2168557	2168562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_010994	GCCG	2	8	2168581	2168588	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5512	NC_010994	AGG	2	6	2168689	2168694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_010994	GCC	2	6	2169117	2169122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5514	NC_010994	GCCT	2	8	2169143	2169150	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5515	NC_010994	AG	3	6	2169219	2169224	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_010994	CGC	2	6	2173113	2173118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5517	NC_010994	GAC	2	6	2173161	2173166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_010994	GAA	2	6	2173224	2173229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5519	NC_010994	GAA	2	6	2173288	2173293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_010994	TCC	2	6	2173307	2173312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5521	NC_010994	CGA	2	6	2173377	2173382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5522	NC_010994	AAGA	2	8	2173417	2173424	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_010994	GCC	2	6	2173552	2173557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5524	NC_010994	GGC	2	6	2173558	2173563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5525	NC_010994	CCG	2	6	2173576	2173581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5526	NC_010994	CGG	2	6	2173608	2173613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_010994	CGA	2	6	2173668	2173673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_010994	GCTCT	2	10	2173687	2173696	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5529	NC_010994	CGG	2	6	2173704	2173709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_010994	CGA	3	9	2173722	2173730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_010994	GGC	2	6	2173801	2173806	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5532	NC_010994	CCG	2	6	2173826	2173831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5533	NC_010994	GAC	2	6	2173875	2173880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_010994	GC	3	6	2173883	2173888	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5535	NC_010994	CAA	2	6	2173914	2173919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5536	NC_010994	GATC	2	8	2173950	2173957	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5537	NC_010994	GGC	2	6	2173981	2173986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_010994	CGT	2	6	2173992	2173997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_010994	CGC	2	6	2174028	2174033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5540	NC_010994	CGC	2	6	2174052	2174057	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5541	NC_010994	GTC	2	6	2174077	2174082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_010994	AAC	2	6	2174107	2174112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_010994	GCC	2	6	2174119	2174124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5544	NC_010994	CAGG	2	8	2174174	2174181	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5545	NC_010994	TGA	2	6	2174199	2174204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_010994	TCG	2	6	2174256	2174261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5547	NC_010994	TCG	2	6	2174277	2174282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_010994	GCCGA	2	10	2174291	2174300	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5549	NC_010994	GAT	2	6	2174312	2174317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_010994	GCC	2	6	2174321	2174326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5551	NC_010994	TGC	2	6	2174340	2174345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_010994	GGC	2	6	2174402	2174407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_010994	CTT	2	6	2174408	2174413	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_010994	CCT	2	6	2175416	2175421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5555	NC_010994	ACG	2	6	2175542	2175547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5556	NC_010994	CA	3	6	2175595	2175600	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5557	NC_010994	TGG	2	6	2178527	2178532	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_010994	GCG	2	6	2178549	2178554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5559	NC_010994	CGC	2	6	2178578	2178583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5560	NC_010994	GTG	2	6	2179726	2179731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_010994	CGT	2	6	2179733	2179738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5562	NC_010994	TCG	2	6	2179764	2179769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5563	NC_010994	GCG	2	6	2179827	2179832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_010994	CCGCC	2	10	2181401	2181410	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
5565	NC_010994	CCG	2	6	2181445	2181450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5566	NC_010994	TGG	2	6	2181473	2181478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_010994	GCC	3	9	2181487	2181495	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5568	NC_010994	TCA	2	6	2181519	2181524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_010994	GGCT	2	8	2181550	2181557	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5570	NC_010994	GCC	2	6	2181583	2181588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5571	NC_010994	TCC	2	6	2182280	2182285	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5572	NC_010994	CAAC	2	8	2185637	2185644	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5573	NC_010994	AGA	2	6	2185655	2185660	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_010994	GCA	2	6	2185661	2185666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5575	NC_010994	GGC	2	6	2185702	2185707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5576	NC_010994	AAC	2	6	2185710	2185715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5577	NC_010994	ACG	2	6	2185764	2185769	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5578	NC_010994	AAG	2	6	2188817	2188822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_010994	ACA	2	6	2188850	2188855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5580	NC_010994	CTTG	2	8	2189997	2190004	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5581	NC_010994	A	6	6	2190037	2190042	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_010994	GCA	2	6	2190908	2190913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_010994	GAAG	2	8	2192393	2192400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_010994	CGA	2	6	2192401	2192406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5585	NC_010994	GGCG	2	8	2197868	2197875	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5586	NC_010994	AGG	2	6	2197876	2197881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5587	NC_010994	T	6	6	2197949	2197954	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5588	NC_010994	CGA	2	6	2198079	2198084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5589	NC_010994	CCA	2	6	2198089	2198094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5590	NC_010994	ACA	2	6	2198155	2198160	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5591	NC_010994	GCT	2	6	2199039	2199044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5592	NC_010994	ACGG	2	8	2199086	2199093	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5593	NC_010994	CCT	2	6	2200044	2200049	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5594	NC_010994	AGCC	2	8	2200055	2200062	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5595	NC_010994	TCG	2	6	2200070	2200075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5596	NC_010994	CCGGC	2	10	2200187	2200196	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5597	NC_010994	CGG	2	6	2200207	2200212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5598	NC_010994	CCT	2	6	2200215	2200220	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5599	NC_010994	CTT	2	6	2200432	2200437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5600	NC_010994	TCT	2	6	2200440	2200445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5601	NC_010994	GTA	2	6	2200477	2200482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_010994	CGG	2	6	2200509	2200514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_010994	GGCA	2	8	2200519	2200526	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5604	NC_010994	CGCCT	2	10	2200595	2200604	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
5605	NC_010994	GAAA	2	8	2200637	2200644	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5606	NC_010994	GTGAT	2	10	2200667	2200676	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5607	NC_010994	CTT	2	6	2200690	2200695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5608	NC_010994	GATC	2	8	2200749	2200756	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5609	NC_010994	CGT	2	6	2200797	2200802	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5610	NC_010994	GGT	2	6	2200854	2200859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5611	NC_010994	GTA	2	6	2200873	2200878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_010994	TCG	2	6	2200937	2200942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5613	NC_010994	GAC	2	6	2200993	2200998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5614	NC_010994	CCA	2	6	2201161	2201166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5615	NC_010994	GATC	2	8	2201190	2201197	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5616	NC_010994	GAA	2	6	2201230	2201235	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5617	NC_010994	CGG	2	6	2201248	2201253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5618	NC_010994	GGC	2	6	2201319	2201324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5619	NC_010994	GAT	2	6	2201356	2201361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5620	NC_010994	TCA	2	6	2201364	2201369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5621	NC_010994	GTCGAC	2	12	2201377	2201388	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5622	NC_010994	GCG	2	6	2201397	2201402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_010994	GAG	3	9	2201551	2201559	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5624	NC_010994	ATG	2	6	2201569	2201574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5625	NC_010994	GCC	2	6	2201632	2201637	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5626	NC_010994	CCT	2	6	2201661	2201666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5627	NC_010994	CG	3	6	2201694	2201699	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5628	NC_010994	CCG	2	6	2201756	2201761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5629	NC_010994	CCT	2	6	2201835	2201840	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5630	NC_010994	CGC	2	6	2201850	2201855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5631	NC_010994	GCT	2	6	2201856	2201861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5632	NC_010994	ATC	2	6	2201891	2201896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5755	NC_010994	CCGA	2	8	2241565	2241572	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5756	NC_010994	GCC	3	9	2241596	2241604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5758	NC_010994	GC	3	6	2244182	2244187	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5759	NC_010994	TCG	2	6	2244197	2244202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5760	NC_010994	GGC	2	6	2245811	2245816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5761	NC_010994	GAT	2	6	2245901	2245906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5762	NC_010994	GTC	2	6	2245958	2245963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5764	NC_010994	GCG	2	6	2246848	2246853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5771	NC_010994	GCG	2	6	2249984	2249989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5772	NC_010994	GCGCG	2	10	2249993	2250002	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
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5780	NC_010994	GCG	2	6	2251694	2251699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5791	NC_010994	CGG	2	6	2252972	2252977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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5801	NC_010994	CGTGG	2	10	2256150	2256159	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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5876	NC_010994	TATG	2	8	2292721	2292728	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5877	NC_010994	AGG	2	6	2293541	2293546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5879	NC_010994	CTG	2	6	2294100	2294105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5880	NC_010994	TCC	2	6	2295120	2295125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5881	NC_010994	CCT	2	6	2295583	2295588	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5882	NC_010994	CGG	2	6	2295623	2295628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5883	NC_010994	C	6	6	2295634	2295639	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5884	NC_010994	AAC	2	6	2297427	2297432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5885	NC_010994	GAA	2	6	2297480	2297485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5886	NC_010994	GCT	2	6	2298108	2298113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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