MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 7675

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_010263	AT	3	6	1156817	1156822	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_010263	CTTT	2	8	1156831	1156838	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7004	NC_010263	T	7	7	1156836	1156842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7005	NC_010263	AAT	2	6	1156932	1156937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_010263	TAT	2	6	1156950	1156955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_010263	TA	3	6	1156974	1156979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7008	NC_010263	TAT	2	6	1156984	1156989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7009	NC_010263	T	6	6	1157027	1157032	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7010	NC_010263	CTG	2	6	1157155	1157160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_010263	GGT	2	6	1157209	1157214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_010263	TTC	2	6	1157388	1157393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7013	NC_010263	ATC	2	6	1157574	1157579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_010263	T	7	7	1157590	1157596	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_010263	AATA	2	8	1157612	1157619	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_010263	TTA	2	6	1158001	1158006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_010263	T	6	6	1158029	1158034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_010263	CAT	2	6	1158043	1158048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7019	NC_010263	ATAA	2	8	1158072	1158079	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_010263	TTA	2	6	1158099	1158104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7021	NC_010263	TAT	2	6	1158142	1158147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_010263	CTT	2	6	1158158	1158163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7024	NC_010263	AAG	2	6	1158290	1158295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7025	NC_010263	ATA	3	9	1160841	1160849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7027	NC_010263	AATG	2	8	1160883	1160890	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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7029	NC_010263	CTTTA	2	10	1160923	1160932	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7030	NC_010263	A	7	7	1160936	1160942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_010263	TAAT	2	8	1160946	1160953	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_010263	TTA	2	6	1161257	1161262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7033	NC_010263	TA	3	6	1161287	1161292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_010263	GT	3	6	1161306	1161311	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7038	NC_010263	TAG	2	6	1161625	1161630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7040	NC_010263	AAG	2	6	1161704	1161709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7041	NC_010263	TTTC	2	8	1161779	1161786	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7042	NC_010263	ACT	2	6	1161808	1161813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7043	NC_010263	TTAT	2	8	1161937	1161944	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_010263	TA	3	6	1161950	1161955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7045	NC_010263	TA	3	6	1161961	1161966	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7046	NC_010263	TAG	2	6	1161989	1161994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7049	NC_010263	TAT	2	6	1162058	1162063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7050	NC_010263	ATT	2	6	1162182	1162187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7053	NC_010263	CT	3	6	1162235	1162240	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7054	NC_010263	TCT	2	6	1162255	1162260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7055	NC_010263	TC	3	6	1162308	1162313	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7056	NC_010263	TAT	2	6	1162340	1162345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7060	NC_010263	TAT	2	6	1162490	1162495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_010263	ACT	2	6	1162545	1162550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7062	NC_010263	GCA	2	6	1162648	1162653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7063	NC_010263	TAT	2	6	1162658	1162663	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7064	NC_010263	CAC	2	6	1162679	1162684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7065	NC_010263	AGC	2	6	1162695	1162700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7069	NC_010263	ACTAC	2	10	1163099	1163108	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
7070	NC_010263	TGG	2	6	1163116	1163121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7079	NC_010263	GTG	2	6	1163471	1163476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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7091	NC_010263	TAC	2	6	1164178	1164183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7094	NC_010263	ATT	2	6	1164264	1164269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_010263	GTT	2	6	1164277	1164282	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7099	NC_010263	TAT	2	6	1165143	1165148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7100	NC_010263	ATT	2	6	1165186	1165191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_010263	A	7	7	1165262	1165268	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_010263	TTA	2	6	1165339	1165344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7103	NC_010263	TTA	2	6	1165410	1165415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_010263	AAC	2	6	1165484	1165489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7105	NC_010263	GCTA	2	8	1165532	1165539	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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7112	NC_010263	AGT	2	6	1166145	1166150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7113	NC_010263	GTA	2	6	1166155	1166160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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7122	NC_010263	TGT	2	6	1166550	1166555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_010263	TGTTCC	2	12	1166610	1166621	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7124	NC_010263	GTA	2	6	1166638	1166643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_010263	TGT	2	6	1166646	1166651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_010263	GCA	2	6	1166671	1166676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7127	NC_010263	CCGC	2	8	1166749	1166756	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7128	NC_010263	ATT	2	6	1166778	1166783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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7130	NC_010263	AT	3	6	1166859	1166864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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