MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 5135

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_010168	ACG	2	6	1389909	1389914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_010168	GTT	2	6	1390006	1390011	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_010168	CAGT	2	8	1390097	1390104	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2504	NC_010168	CAG	2	6	1390213	1390218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2505	NC_010168	AAT	2	6	1390278	1390283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2506	NC_010168	CCA	2	6	1390411	1390416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2507	NC_010168	TCA	2	6	1390953	1390958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2508	NC_010168	CTT	2	6	1391001	1391006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2509	NC_010168	GTT	2	6	1391012	1391017	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2510	NC_010168	AC	3	6	1391036	1391041	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2511	NC_010168	GCCT	2	8	1391078	1391085	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
2512	NC_010168	ATG	2	6	1391089	1391094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_010168	CAG	2	6	1391097	1391102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2514	NC_010168	GCC	2	6	1392961	1392966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2515	NC_010168	TTC	2	6	1397866	1397871	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2516	NC_010168	CGT	2	6	1399999	1400004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2517	NC_010168	CG	3	6	1400005	1400010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2518	NC_010168	GTTC	2	8	1400366	1400373	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2519	NC_010168	GA	3	6	1400829	1400834	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_010168	ATCA	2	8	1400853	1400860	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2521	NC_010168	AGC	2	6	1400917	1400922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2522	NC_010168	AAG	2	6	1400924	1400929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_010168	GTC	2	6	1400949	1400954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2524	NC_010168	GAC	2	6	1401836	1401841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2525	NC_010168	AGG	2	6	1401844	1401849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_010168	ATCG	2	8	1401883	1401890	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2527	NC_010168	GGT	2	6	1401970	1401975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_010168	GAA	2	6	1401998	1402003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_010168	GCC	2	6	1402025	1402030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2530	NC_010168	CAG	2	6	1402067	1402072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2531	NC_010168	CTGT	2	8	1402073	1402080	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2532	NC_010168	GT	3	6	1402094	1402099	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_010168	CTG	2	6	1403509	1403514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2534	NC_010168	GT	3	6	1406615	1406620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_010168	AC	3	6	1407931	1407936	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2536	NC_010168	GCA	2	6	1407983	1407988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2537	NC_010168	G	6	6	1408021	1408026	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_010168	GGCT	2	8	1408052	1408059	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2539	NC_010168	ACAA	2	8	1411554	1411561	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2540	NC_010168	AT	3	6	1415894	1415899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_010168	CTG	2	6	1415922	1415927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2542	NC_010168	TAGGC	2	10	1415950	1415959	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
2543	NC_010168	AGTT	2	8	1415998	1416005	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2544	NC_010168	TCG	2	6	1416907	1416912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2545	NC_010168	TCA	2	6	1416973	1416978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_010168	ATCCAA	2	12	1416979	1416990	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2547	NC_010168	AAG	2	6	1417126	1417131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_010168	GCC	3	9	1417214	1417222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2549	NC_010168	ATC	2	6	1423396	1423401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2550	NC_010168	CGC	2	6	1426493	1426498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2551	NC_010168	AC	3	6	1427479	1427484	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2552	NC_010168	TC	3	6	1428975	1428980	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2553	NC_010168	CG	3	6	1428995	1429000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2554	NC_010168	GA	3	6	1429005	1429010	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_010168	GCCC	2	8	1430199	1430206	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2556	NC_010168	A	6	6	1432278	1432283	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_010168	GTG	2	6	1432474	1432479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_010168	GT	3	6	1432564	1432569	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2559	NC_010168	CAA	2	6	1434041	1434046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2560	NC_010168	GGCCA	2	10	1434692	1434701	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2561	NC_010168	CTG	2	6	1435177	1435182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2562	NC_010168	TCA	2	6	1435194	1435199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2563	NC_010168	CTTT	2	8	1435749	1435756	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2564	NC_010168	CTC	2	6	1435792	1435797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2565	NC_010168	CAA	2	6	1437782	1437787	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2566	NC_010168	GCT	2	6	1439072	1439077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2567	NC_010168	AT	3	6	1439150	1439155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_010168	ATT	2	6	1439158	1439163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2569	NC_010168	CG	3	6	1443143	1443148	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2570	NC_010168	GCGA	2	8	1443149	1443156	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2571	NC_010168	AGC	2	6	1448628	1448633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2572	NC_010168	TCTT	2	8	1448645	1448652	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2573	NC_010168	GA	3	6	1449865	1449870	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_010168	GCA	2	6	1449916	1449921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2575	NC_010168	AAT	2	6	1449974	1449979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_010168	ACG	2	6	1450033	1450038	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2577	NC_010168	TTC	2	6	1453931	1453936	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2578	NC_010168	GAT	3	9	1453964	1453972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2579	NC_010168	TGC	2	6	1458201	1458206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2580	NC_010168	TTTAG	2	10	1458290	1458299	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_010168	CTAA	2	8	1458310	1458317	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2582	NC_010168	TCG	2	6	1458324	1458329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2583	NC_010168	TTC	2	6	1458344	1458349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2584	NC_010168	TCAGA	2	10	1458387	1458396	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2585	NC_010168	CAT	3	9	1459412	1459420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2586	NC_010168	ACCC	2	8	1459667	1459674	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
2587	NC_010168	TCG	2	6	1459704	1459709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2588	NC_010168	GAA	2	6	1459786	1459791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2589	NC_010168	CCTAG	2	10	1461979	1461988	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2590	NC_010168	ACC	2	6	1464945	1464950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2591	NC_010168	GAA	2	6	1464991	1464996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2592	NC_010168	TCA	2	6	1469424	1469429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2593	NC_010168	TTC	2	6	1469515	1469520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2594	NC_010168	TGGT	2	8	1469553	1469560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_010168	GGC	2	6	1469795	1469800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2596	NC_010168	AGA	2	6	1469836	1469841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_010168	GAG	2	6	1469856	1469861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_010168	CT	3	6	1472848	1472853	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2599	NC_010168	CAC	2	6	1472870	1472875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2600	NC_010168	GTG	2	6	1472911	1472916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_010168	TGA	2	6	1472980	1472985	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2602	NC_010168	GAT	2	6	1473123	1473128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_010168	GT	3	6	1473251	1473256	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2604	NC_010168	AC	3	6	1474567	1474572	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2605	NC_010168	GTG	2	6	1474922	1474927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_010168	CAT	2	6	1477054	1477059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2607	NC_010168	ACG	2	6	1479258	1479263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2608	NC_010168	GCT	2	6	1479277	1479282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_010168	CCCGT	2	10	1480669	1480678	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
2610	NC_010168	CGG	2	6	1481373	1481378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2611	NC_010168	CGCC	2	8	1481460	1481467	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
2612	NC_010168	GAT	2	6	1481575	1481580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2613	NC_010168	CCA	2	6	1481603	1481608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2614	NC_010168	TC	3	6	1481650	1481655	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2615	NC_010168	GGCAA	2	10	1481674	1481683	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2616	NC_010168	AGT	2	6	1481692	1481697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_010168	TTCGG	2	10	1487589	1487598	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2618	NC_010168	CAA	2	6	1487640	1487645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2619	NC_010168	CCCT	2	8	1489060	1489067	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2620	NC_010168	GTG	2	6	1489129	1489134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2621	NC_010168	TGCGT	2	10	1489143	1489152	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2622	NC_010168	GGA	2	6	1489675	1489680	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_010168	AGA	2	6	1489686	1489691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_010168	AGC	2	6	1489730	1489735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2625	NC_010168	ACT	2	6	1489749	1489754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2626	NC_010168	ATT	2	6	1491609	1491614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_010168	TG	3	6	1491626	1491631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_010168	GTC	2	6	1491680	1491685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2629	NC_010168	CTT	2	6	1498346	1498351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2630	NC_010168	TTCGT	2	10	1499471	1499480	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
2631	NC_010168	CTTG	2	8	1499679	1499686	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
2632	NC_010168	GAACA	2	10	1499689	1499698	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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2635	NC_010168	CGG	2	6	1499818	1499823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2636	NC_010168	TGT	2	6	1499849	1499854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2644	NC_010168	G	9	9	1506125	1506133	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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2653	NC_010168	CGAA	2	8	1507795	1507802	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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2655	NC_010168	AGCC	2	8	1507855	1507862	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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2758	NC_010168	TCG	2	6	1592805	1592810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2760	NC_010168	GTCGA	2	10	1597024	1597033	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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2762	NC_010168	AAC	2	6	1597117	1597122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2763	NC_010168	TGA	2	6	1597124	1597129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2764	NC_010168	CAC	2	6	1597301	1597306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2765	NC_010168	CCG	2	6	1597346	1597351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2766	NC_010168	GGGT	2	8	1597419	1597426	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2767	NC_010168	GGA	2	6	1597459	1597464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2774	NC_010168	TTG	2	6	1599817	1599822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2776	NC_010168	TCA	2	6	1601218	1601223	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2777	NC_010168	GCG	2	6	1601598	1601603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2778	NC_010168	C	6	6	1601604	1601609	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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2780	NC_010168	T	6	6	1601635	1601640	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2781	NC_010168	GTCG	2	8	1601708	1601715	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2782	NC_010168	TGGT	2	8	1606882	1606889	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2783	NC_010168	CCT	2	6	1607715	1607720	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2794	NC_010168	TTC	2	6	1622829	1622834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2802	NC_010168	GGAT	2	8	1625211	1625218	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2803	NC_010168	ATGA	2	8	1625230	1625237	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2804	NC_010168	A	6	6	1625246	1625251	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2885	NC_010168	AAGA	2	8	1677963	1677970	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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2889	NC_010168	CCTT	2	8	1681900	1681907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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