MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 5135

< Previous1234567891011Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010168	GC	3	6	3086718	3086723	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5002	NC_010168	TTC	2	6	3091273	3091278	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_010168	GACAC	2	10	3091335	3091344	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5004	NC_010168	CGC	2	6	3091362	3091367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5005	NC_010168	GTC	2	6	3091385	3091390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5006	NC_010168	T	7	7	3091436	3091442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_010168	CAT	2	6	3091490	3091495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_010168	GTA	2	6	3091528	3091533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_010168	GCC	2	6	3091951	3091956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5010	NC_010168	TGT	2	6	3091968	3091973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_010168	AGC	2	6	3091978	3091983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_010168	GCCC	2	8	3092447	3092454	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5013	NC_010168	AAG	2	6	3092501	3092506	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_010168	ACG	2	6	3094643	3094648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5015	NC_010168	TTCAG	2	10	3094688	3094697	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5016	NC_010168	GAA	2	6	3094698	3094703	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_010168	CT	3	6	3095701	3095706	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5018	NC_010168	CAGA	2	8	3096309	3096316	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5019	NC_010168	TTA	2	6	3096326	3096331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_010168	AGC	2	6	3096397	3096402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_010168	GTTC	2	8	3098368	3098375	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5022	NC_010168	CTT	2	6	3098381	3098386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_010168	ATTCC	2	10	3099012	3099021	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
5024	NC_010168	TTA	2	6	3099108	3099113	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_010168	AT	4	8	3099176	3099183	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_010168	TTC	2	6	3099200	3099205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5027	NC_010168	GACT	2	8	3099221	3099228	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5028	NC_010168	GGC	2	6	3099262	3099267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_010168	GTGC	2	8	3099592	3099599	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5030	NC_010168	GTA	2	6	3100489	3100494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_010168	GGT	2	6	3100505	3100510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5032	NC_010168	TCGAC	2	10	3100542	3100551	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
5033	NC_010168	TGGT	2	8	3101242	3101249	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_010168	CG	3	6	3101253	3101258	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5035	NC_010168	AGA	2	6	3103658	3103663	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5036	NC_010168	GCT	2	6	3103715	3103720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5037	NC_010168	GCC	2	6	3104066	3104071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5038	NC_010168	CGA	2	6	3104748	3104753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_010168	C	7	7	3105377	3105383	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5040	NC_010168	AGC	2	6	3105485	3105490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5041	NC_010168	CGA	2	6	3106864	3106869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_010168	CAG	2	6	3108310	3108315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5043	NC_010168	TTGG	2	8	3110162	3110169	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_010168	CCAA	2	8	3110192	3110199	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5045	NC_010168	A	7	7	3115808	3115814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5046	NC_010168	AGT	2	6	3115906	3115911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_010168	CAGC	2	8	3115914	3115921	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5048	NC_010168	CG	3	6	3116007	3116012	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5049	NC_010168	TCGA	2	8	3116021	3116028	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5050	NC_010168	CTT	3	9	3116046	3116054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_010168	GGC	2	6	3116076	3116081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_010168	TC	3	6	3116092	3116097	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5053	NC_010168	GCG	2	6	3116130	3116135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_010168	TCC	2	6	3116151	3116156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5055	NC_010168	TGC	2	6	3116227	3116232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5056	NC_010168	CTGC	2	8	3118127	3118134	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5057	NC_010168	CGT	2	6	3118180	3118185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_010168	CAC	2	6	3118215	3118220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5059	NC_010168	CGC	2	6	3118297	3118302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5060	NC_010168	AGC	3	9	3118309	3118317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_010168	GCCT	2	8	3119453	3119460	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5062	NC_010168	ACG	2	6	3119467	3119472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_010168	TTCC	2	8	3119479	3119486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5064	NC_010168	GCC	2	6	3119500	3119505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_010168	CAG	2	6	3119508	3119513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_010168	AGC	2	6	3119518	3119523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_010168	GAT	2	6	3119547	3119552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_010168	CTTC	2	8	3119619	3119626	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5069	NC_010168	TG	3	6	3120844	3120849	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_010168	AGGT	2	8	3120869	3120876	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_010168	GC	3	6	3121657	3121662	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5072	NC_010168	GCA	2	6	3121682	3121687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5073	NC_010168	CCG	2	6	3122914	3122919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5074	NC_010168	GGC	2	6	3124523	3124528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5075	NC_010168	GCT	2	6	3124566	3124571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5076	NC_010168	TAG	2	6	3124579	3124584	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5077	NC_010168	CGG	2	6	3124595	3124600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_010168	TG	3	6	3124669	3124674	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_010168	GCG	2	6	3124678	3124683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_010168	CTG	2	6	3125052	3125057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_010168	TGC	2	6	3125066	3125071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_010168	GA	3	6	3125073	3125078	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_010168	GCC	2	6	3126530	3126535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5084	NC_010168	AGCA	2	8	3126588	3126595	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5085	NC_010168	GCG	2	6	3126698	3126703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5086	NC_010168	ATTT	2	8	3126745	3126752	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_010168	A	6	6	3126856	3126861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_010168	A	6	6	3126877	3126882	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_010168	CGA	2	6	3126988	3126993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5090	NC_010168	CAC	2	6	3127790	3127795	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5091	NC_010168	GTT	2	6	3127813	3127818	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_010168	GTG	2	6	3127831	3127836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_010168	TC	3	6	3128316	3128321	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5094	NC_010168	GTG	2	6	3128630	3128635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_010168	ATT	2	6	3128693	3128698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5096	NC_010168	TCAGA	2	10	3129295	3129304	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5097	NC_010168	TGAT	2	8	3129305	3129312	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_010168	ACG	2	6	3131168	3131173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5099	NC_010168	G	6	6	3131258	3131263	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_010168	CTA	2	6	3131711	3131716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_010168	CCAGC	2	10	3131738	3131747	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
5102	NC_010168	TGG	2	6	3131750	3131755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_010168	TATG	2	8	3131804	3131811	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5104	NC_010168	CGG	2	6	3131876	3131881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5105	NC_010168	GA	3	6	3132026	3132031	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_010168	TTC	2	6	3132054	3132059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_010168	GT	3	6	3134827	3134832	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_010168	AC	3	6	3136143	3136148	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5109	NC_010168	AAC	3	9	3136911	3136919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_010168	T	6	6	3136929	3136934	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_010168	CAA	2	6	3137005	3137010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_010168	AGG	2	6	3137713	3137718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_010168	C	6	6	3138361	3138366	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5114	NC_010168	CTGC	2	8	3140872	3140879	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5115	NC_010168	AGA	2	6	3140952	3140957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5116	NC_010168	GTT	2	6	3141019	3141024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_010168	CAG	2	6	3141075	3141080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_010168	GC	3	6	3141247	3141252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5119	NC_010168	GC	3	6	3141301	3141306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5120	NC_010168	CGT	2	6	3141308	3141313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_010168	CGT	2	6	3141319	3141324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_010168	AGC	2	6	3141332	3141337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5123	NC_010168	GCG	2	6	3141347	3141352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5124	NC_010168	GCT	2	6	3141356	3141361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5125	NC_010168	AAT	2	6	3141684	3141689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_010168	TGT	2	6	3141877	3141882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5127	NC_010168	CTG	2	6	3141930	3141935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_010168	ATG	2	6	3144764	3144769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5129	NC_010168	TCAA	2	8	3149144	3149151	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5130	NC_010168	AGG	2	6	3149509	3149514	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5131	NC_010168	CCT	2	6	3149537	3149542	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5132	NC_010168	CAG	2	6	3149569	3149574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5133	NC_010168	ATG	2	6	3150608	3150613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_010168	GCT	2	6	3150623	3150628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5135	NC_010168	CTAC	2	8	3151731	3151738	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding

< Previous1234567891011Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.