MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 10863

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_009900	TAC	2	6	314364	314369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2502	NC_009900	AAAGA	2	10	314375	314384	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2503	NC_009900	CTA	2	6	314993	314998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2504	NC_009900	T	8	8	314999	315006	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2505	NC_009900	CTG	2	6	315035	315040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2506	NC_009900	AAG	2	6	315071	315076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2507	NC_009900	TAA	2	6	315096	315101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2508	NC_009900	T	6	6	315215	315220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2509	NC_009900	AGC	2	6	315255	315260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_009900	ACA	2	6	315265	315270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2511	NC_009900	TTA	2	6	315289	315294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_009900	AAT	2	6	315315	315320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2513	NC_009900	T	6	6	315363	315368	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2514	NC_009900	AAT	2	6	315460	315465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2515	NC_009900	ATT	2	6	315483	315488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2516	NC_009900	TTGT	2	8	315509	315516	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2517	NC_009900	AT	3	6	315563	315568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2518	NC_009900	AGT	2	6	315743	315748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_009900	ATAAA	2	10	315844	315853	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_009900	TCT	2	6	315857	315862	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2521	NC_009900	CATT	2	8	315873	315880	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2522	NC_009900	TTA	2	6	315909	315914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_009900	TTC	2	6	315928	315933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2524	NC_009900	TTG	2	6	315934	315939	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_009900	TTTA	2	8	315943	315950	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2526	NC_009900	AGA	2	6	315964	315969	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_009900	TAT	2	6	315991	315996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2528	NC_009900	ATTA	2	8	316010	316017	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_009900	TAAAA	2	10	316038	316047	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2530	NC_009900	TTA	2	6	316128	316133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_009900	CTAA	2	8	316168	316175	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2532	NC_009900	ATT	2	6	316186	316191	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2533	NC_009900	GCTA	2	8	317968	317975	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2534	NC_009900	G	6	6	317981	317986	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
2535	NC_009900	TA	3	6	318044	318049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2536	NC_009900	AAC	2	6	318127	318132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2537	NC_009900	ATT	2	6	319896	319901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2538	NC_009900	GCGA	2	8	319914	319921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2539	NC_009900	GA	3	6	320070	320075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2540	NC_009900	TAAT	2	8	320079	320086	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2541	NC_009900	TGC	2	6	323592	323597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2542	NC_009900	TTC	2	6	323607	323612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2543	NC_009900	GTAC	2	8	323643	323650	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2544	NC_009900	GCAA	2	8	323721	323728	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2545	NC_009900	ACT	2	6	323766	323771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2546	NC_009900	TG	3	6	325281	325286	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2547	NC_009900	TAT	2	6	325307	325312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2548	NC_009900	A	7	7	325313	325319	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2549	NC_009900	ATA	2	6	326081	326086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2550	NC_009900	TGT	2	6	328066	328071	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_009900	TTG	2	6	329094	329099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_009900	T	6	6	329110	329115	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2553	NC_009900	ATT	2	6	329169	329174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_009900	T	7	7	329189	329195	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2555	NC_009900	GGGGAT	2	12	329197	329208	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2556	NC_009900	CTT	2	6	329281	329286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2557	NC_009900	GT	3	6	329356	329361	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2558	NC_009900	TCCC	2	8	329374	329381	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
2559	NC_009900	CATT	2	8	329389	329396	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2560	NC_009900	TG	3	6	329436	329441	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2561	NC_009900	GTT	2	6	329446	329451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_009900	TAT	2	6	329464	329469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2563	NC_009900	AT	4	8	329468	329475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2564	NC_009900	TAA	2	6	329554	329559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2565	NC_009900	CTT	2	6	329585	329590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2567	NC_009900	AAG	2	6	329717	329722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2568	NC_009900	GTC	2	6	329861	329866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2569	NC_009900	TA	3	6	329868	329873	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2570	NC_009900	TAAG	2	8	329877	329884	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2571	NC_009900	ATC	2	6	330382	330387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2572	NC_009900	AT	3	6	330460	330465	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_009900	ATT	2	6	330517	330522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_009900	ATT	3	9	330533	330541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_009900	TTG	2	6	330554	330559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_009900	TA	3	6	330663	330668	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2579	NC_009900	A	6	6	330734	330739	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2580	NC_009900	AT	4	8	330758	330765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_009900	TA	3	6	330795	330800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2582	NC_009900	TAG	2	6	330818	330823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_009900	GTA	2	6	330828	330833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2584	NC_009900	AAT	2	6	330847	330852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2585	NC_009900	TAA	3	9	330866	330874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_009900	CTT	2	6	330953	330958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2587	NC_009900	TGA	2	6	330969	330974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2590	NC_009900	AAT	2	6	331486	331491	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2591	NC_009900	CA	3	6	331501	331506	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2592	NC_009900	TTA	2	6	331533	331538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2593	NC_009900	AATT	2	8	331539	331546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2594	NC_009900	AAT	2	6	331557	331562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2595	NC_009900	TAA	3	9	331575	331583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2596	NC_009900	TAA	2	6	331593	331598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2597	NC_009900	TTAAT	2	10	331651	331660	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2598	NC_009900	TTATT	2	10	331678	331687	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2599	NC_009900	T	6	6	331796	331801	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2600	NC_009900	A	6	6	331842	331847	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2601	NC_009900	TGC	2	6	332270	332275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2602	NC_009900	TATT	2	8	332287	332294	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2603	NC_009900	ACA	2	6	332301	332306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2604	NC_009900	TAA	2	6	332345	332350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2605	NC_009900	ATG	2	6	332380	332385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_009900	ATA	2	6	332398	332403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2607	NC_009900	AAT	2	6	332439	332444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2608	NC_009900	CTT	2	6	332478	332483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2609	NC_009900	TA	5	10	332488	332497	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2613	NC_009900	AGC	2	6	335098	335103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2614	NC_009900	GAC	2	6	335180	335185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2616	NC_009900	TTAAA	2	10	335274	335283	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_009900	ATT	2	6	336046	336051	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2618	NC_009900	TAA	2	6	336075	336080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2619	NC_009900	ATT	2	6	336091	336096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2620	NC_009900	AGC	2	6	337190	337195	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2622	NC_009900	T	6	6	337262	337267	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2623	NC_009900	TAAA	2	8	337284	337291	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
2624	NC_009900	A	6	6	339148	339153	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2625	NC_009900	AAT	2	6	339158	339163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2626	NC_009900	TAA	2	6	339172	339177	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2627	NC_009900	TAT	2	6	339191	339196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2628	NC_009900	CTTA	2	8	339203	339210	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2629	NC_009900	TAA	2	6	339219	339224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2630	NC_009900	TAA	2	6	339243	339248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2631	NC_009900	A	7	7	339293	339299	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2632	NC_009900	AG	3	6	339313	339318	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2633	NC_009900	ACC	2	6	339349	339354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2634	NC_009900	ATA	2	6	340018	340023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2635	NC_009900	AGA	2	6	340056	340061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2636	NC_009900	TA	3	6	340591	340596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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