MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 10863

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_009900	CAA	2	6	208876	208881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_009900	AT	3	6	209481	209486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_009900	TAT	3	9	209484	209492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_009900	A	6	6	209613	209618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_009900	T	6	6	209634	209639	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_009900	ATT	2	6	209640	209645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_009900	GCT	2	6	209673	209678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_009900	CAA	2	6	209703	209708	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_009900	ACA	2	6	209738	209743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_009900	TAAAT	2	10	212382	212391	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_009900	TAA	2	6	212397	212402	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_009900	TAAAA	2	10	212417	212426	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1513	NC_009900	A	6	6	212423	212428	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_009900	TATT	2	8	212460	212467	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_009900	AGACA	2	10	212479	212488	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1516	NC_009900	AT	3	6	212491	212496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_009900	TTAT	2	8	212507	212514	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_009900	ATA	2	6	212524	212529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_009900	TGAT	2	8	212536	212543	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_009900	ATTA	2	8	212567	212574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_009900	ATT	2	6	212811	212816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1522	NC_009900	AAG	2	6	212838	212843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_009900	TA	3	6	212879	212884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_009900	TA	3	6	212893	212898	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_009900	T	6	6	212902	212907	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_009900	A	6	6	212951	212956	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_009900	GTTTT	2	10	212961	212970	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_009900	GTT	2	6	213019	213024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_009900	TAA	2	6	213103	213108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_009900	TGC	2	6	213125	213130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_009900	TTA	2	6	213230	213235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_009900	AGAT	2	8	213295	213302	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_009900	GTT	2	6	213308	213313	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_009900	ATC	2	6	213357	213362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_009900	ATG	2	6	213399	213404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_009900	A	6	6	213410	213415	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_009900	T	6	6	214029	214034	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_009900	AAT	2	6	214077	214082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_009900	TTA	2	6	214113	214118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_009900	TGT	2	6	214136	214141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_009900	T	6	6	214152	214157	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_009900	TC	4	8	214167	214174	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_009900	ACC	2	6	214208	214213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1544	NC_009900	TAT	2	6	214216	214221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1545	NC_009900	T	6	6	214242	214247	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_009900	T	6	6	214296	214301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1547	NC_009900	ATA	2	6	214358	214363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_009900	TTA	2	6	214382	214387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_009900	ATT	2	6	214437	214442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_009900	TTTA	2	8	214488	214495	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_009900	ATTAT	2	10	214586	214595	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_009900	GCGA	2	8	214634	214641	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1553	NC_009900	A	7	7	214667	214673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_009900	CTT	2	6	217060	217065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_009900	ATTTA	2	10	217070	217079	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_009900	ATA	2	6	217130	217135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_009900	AAT	2	6	217197	217202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1558	NC_009900	CTAA	2	8	217214	217221	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1559	NC_009900	TAAT	2	8	217234	217241	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_009900	TAG	2	6	217253	217258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_009900	ATA	2	6	217259	217264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_009900	AGCA	2	8	217273	217280	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1563	NC_009900	TAA	2	6	218384	218389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_009900	ATT	2	6	218390	218395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_009900	A	6	6	218495	218500	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_009900	T	6	6	218547	218552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_009900	AAATT	2	10	218623	218632	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_009900	TTTCT	2	10	218638	218647	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1569	NC_009900	TAT	2	6	219982	219987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_009900	AT	3	6	219986	219991	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_009900	T	7	7	219996	220002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_009900	T	6	6	221105	221110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1573	NC_009900	A	6	6	221113	221118	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_009900	GTCAA	2	10	221120	221129	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1575	NC_009900	TTA	2	6	221140	221145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_009900	TAT	2	6	221149	221154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_009900	TAAA	2	8	221155	221162	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_009900	TA	3	6	221186	221191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1579	NC_009900	TGCATT	2	12	221193	221204	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1580	NC_009900	AAC	2	6	221212	221217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_009900	AG	3	6	222228	222233	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_009900	GCT	2	6	223789	223794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1583	NC_009900	TTG	2	6	224086	224091	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1584	NC_009900	TAT	2	6	224159	224164	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1585	NC_009900	TG	3	6	224208	224213	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_009900	CAA	2	6	224230	224235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1587	NC_009900	AAT	2	6	224247	224252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_009900	CTA	2	6	224277	224282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_009900	ATT	2	6	227387	227392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1590	NC_009900	TA	3	6	227423	227428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_009900	TA	3	6	227468	227473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1592	NC_009900	T	6	6	227477	227482	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_009900	A	6	6	227486	227491	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_009900	T	6	6	227499	227504	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_009900	TAC	2	6	227533	227538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_009900	TAATA	2	10	227643	227652	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_009900	TA	3	6	227656	227661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1598	NC_009900	AAG	2	6	228144	228149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_009900	TAA	2	6	228167	228172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1600	NC_009900	CAA	2	6	228226	228231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1601	NC_009900	CTT	2	6	228263	228268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_009900	ACA	2	6	229131	229136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_009900	AT	3	6	229139	229144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_009900	GA	3	6	229146	229151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_009900	T	9	9	229162	229170	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_009900	GTA	2	6	229262	229267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1607	NC_009900	TATAT	2	10	230659	230668	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_009900	CAA	2	6	230830	230835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_009900	T	10	10	230959	230968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_009900	GTA	2	6	230978	230983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1611	NC_009900	TAA	2	6	230984	230989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_009900	TAAT	2	8	231019	231026	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_009900	CACTAC	2	12	231085	231096	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
1614	NC_009900	AAGT	2	8	231123	231130	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1615	NC_009900	TTC	2	6	231169	231174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_009900	GCT	2	6	231193	231198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_009900	T	6	6	231269	231274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_009900	TCT	2	6	231288	231293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_009900	AAAT	2	8	231390	231397	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_009900	CAT	2	6	231408	231413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_009900	CCG	2	6	231433	231438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1622	NC_009900	TCC	2	6	231444	231449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1623	NC_009900	TTA	2	6	231491	231496	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_009900	GCC	2	6	231540	231545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1625	NC_009900	GA	3	6	231637	231642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_009900	CCG	2	6	231669	231674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1627	NC_009900	T	6	6	231719	231724	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1628	NC_009900	ACA	2	6	231783	231788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_009900	TAA	2	6	231823	231828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1630	NC_009900	ATAG	2	8	231857	231864	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1631	NC_009900	GGA	2	6	231867	231872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1632	NC_009900	TAAT	2	8	231892	231899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_009900	TCT	2	6	231903	231908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_009900	TCA	3	9	231912	231920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1635	NC_009900	ACA	2	6	231922	231927	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1636	NC_009900	ATTA	2	8	231979	231986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1637	NC_009900	TAC	2	6	232004	232009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1638	NC_009900	CT	3	6	232083	232088	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1639	NC_009900	ATA	2	6	232099	232104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1917	NC_009900	CTACA	2	10	261599	261608	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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1976	NC_009900	AT	3	6	263618	263623	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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