MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 10863

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_009900	T	6	6	1253248	1253253	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10002	NC_009900	TTA	2	6	1253268	1253273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_009900	ATT	2	6	1253303	1253308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10004	NC_009900	CCT	2	6	1253331	1253336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10005	NC_009900	TGC	2	6	1253362	1253367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10006	NC_009900	ACT	2	6	1253368	1253373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10007	NC_009900	CTA	2	6	1253382	1253387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10008	NC_009900	TAA	2	6	1253448	1253453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10009	NC_009900	TGT	2	6	1253455	1253460	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10010	NC_009900	TGTTCC	2	12	1253515	1253526	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10011	NC_009900	GTA	2	6	1253543	1253548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10012	NC_009900	TGT	2	6	1253551	1253556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10013	NC_009900	GCA	2	6	1253576	1253581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10014	NC_009900	ACC	2	6	1253593	1253598	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10015	NC_009900	ATT	2	6	1253623	1253628	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10016	NC_009900	AGT	2	6	1253638	1253643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10017	NC_009900	CCGC	2	8	1253789	1253796	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10018	NC_009900	ATT	2	6	1253818	1253823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10019	NC_009900	AT	3	6	1253838	1253843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10020	NC_009900	AT	3	6	1253903	1253908	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10021	NC_009900	TCC	2	6	1253916	1253921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10022	NC_009900	TAT	2	6	1253927	1253932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10023	NC_009900	ACC	2	6	1253940	1253945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10024	NC_009900	CCA	2	6	1253953	1253958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10025	NC_009900	CCGC	2	8	1254046	1254053	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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10028	NC_009900	CAT	2	6	1254299	1254304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10030	NC_009900	TTAC	2	8	1254358	1254365	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10031	NC_009900	GCC	2	6	1254384	1254389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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10034	NC_009900	TGTAA	2	10	1254557	1254566	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
10035	NC_009900	TACTA	2	10	1254592	1254601	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
10036	NC_009900	GA	3	6	1254611	1254616	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10037	NC_009900	TAT	2	6	1254629	1254634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10038	NC_009900	AGG	2	6	1254642	1254647	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10039	NC_009900	AGTA	2	8	1254713	1254720	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10040	NC_009900	TCCTGG	2	12	1254735	1254746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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10042	NC_009900	TTG	2	6	1254908	1254913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10043	NC_009900	ATT	2	6	1254915	1254920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10044	NC_009900	AT	3	6	1254933	1254938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10045	NC_009900	ATT	2	6	1254969	1254974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10046	NC_009900	CTC	2	6	1255013	1255018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10047	NC_009900	AGCA	2	8	1255098	1255105	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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10049	NC_009900	T	6	6	1255146	1255151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_009900	TTGAC	2	10	1255156	1255165	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
10051	NC_009900	ATA	2	6	1255166	1255171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_009900	ATTA	2	8	1255218	1255225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_009900	TA	3	6	1255270	1255275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_009900	AAAT	2	8	1255305	1255312	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10055	NC_009900	TA	3	6	1255351	1255356	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10056	NC_009900	CTAT	2	8	1255383	1255390	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10057	NC_009900	CTT	2	6	1255396	1255401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10062	NC_009900	AAT	2	6	1255711	1255716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10063	NC_009900	TA	3	6	1255721	1255726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10064	NC_009900	TAAT	2	8	1255736	1255743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10099	NC_009900	ATT	2	6	1259962	1259967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10108	NC_009900	AT	3	6	1260183	1260188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10114	NC_009900	AGTA	2	8	1260392	1260399	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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10117	NC_009900	A	6	6	1260529	1260534	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10126	NC_009900	ATTT	2	8	1260863	1260870	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10129	NC_009900	AT	3	6	1261031	1261036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10131	NC_009900	ATA	2	6	1261260	1261265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10132	NC_009900	TCC	2	6	1261294	1261299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10133	NC_009900	GAA	2	6	1261303	1261308	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10134	NC_009900	CT	3	6	1261395	1261400	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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10139	NC_009900	A	6	6	1261747	1261752	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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10164	NC_009900	GCG	2	6	1272492	1272497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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