MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 10863

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009900	TAAT	2	8	43645	43652	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_009900	TTA	2	6	43674	43679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_009900	ATTA	3	12	43676	43687	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_009900	TG	3	6	43689	43694	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
505	NC_009900	TAAA	2	8	43698	43705	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_009900	TAAGT	2	10	43723	43732	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
507	NC_009900	TAA	2	6	43776	43781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_009900	A	7	7	43783	43789	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_009900	T	7	7	43791	43797	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
510	NC_009900	AGTA	2	8	43819	43826	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
511	NC_009900	ATT	2	6	43868	43873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
512	NC_009900	CGG	2	6	43875	43880	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_009900	TCT	2	6	43889	43894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_009900	AGGTAC	2	12	43900	43911	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
515	NC_009900	ATGA	2	8	43913	43920	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
516	NC_009900	ATT	2	6	43967	43972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
517	NC_009900	ATTAAT	2	12	44012	44023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
518	NC_009900	TAAC	2	8	44103	44110	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
519	NC_009900	AAT	3	9	44177	44185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
520	NC_009900	GGT	2	6	44318	44323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
521	NC_009900	TAA	2	6	44325	44330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_009900	AGA	2	6	44412	44417	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_009900	TAC	3	9	44481	44489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_009900	GAGAG	2	10	44499	44508	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
525	NC_009900	CAAAC	2	10	44551	44560	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
526	NC_009900	ATTC	2	8	44614	44621	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
527	NC_009900	CGCA	2	8	44659	44666	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
528	NC_009900	ACGTA	2	10	44721	44730	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
529	NC_009900	GTA	2	6	44746	44751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_009900	ATTAAT	2	12	44839	44850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
531	NC_009900	ATG	2	6	44867	44872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_009900	GCC	2	6	44877	44882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_009900	ACA	2	6	44965	44970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_009900	AGC	2	6	44983	44988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_009900	CAAG	2	8	45008	45015	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
536	NC_009900	TAG	2	6	45030	45035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
537	NC_009900	TAG	2	6	45045	45050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
538	NC_009900	CAA	2	6	45131	45136	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_009900	TTAAGG	2	12	45152	45163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
540	NC_009900	CAA	2	6	45207	45212	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_009900	CAA	2	6	45225	45230	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_009900	TGC	2	6	45239	45244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
543	NC_009900	ATA	2	6	45334	45339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_009900	TAG	2	6	45409	45414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
545	NC_009900	CAA	2	6	45438	45443	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_009900	CAGCAA	2	12	45494	45505	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_009900	GAA	2	6	45506	45511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_009900	AGA	2	6	45512	45517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_009900	AATGAA	2	12	45518	45529	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_009900	CAA	2	6	45539	45544	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
551	NC_009900	A	7	7	45570	45576	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_009900	AGA	2	6	45581	45586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_009900	A	6	6	45660	45665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
554	NC_009900	CAAT	2	8	45690	45697	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
555	NC_009900	AAG	2	6	45747	45752	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_009900	ATA	2	6	45828	45833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
557	NC_009900	AAG	2	6	45846	45851	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_009900	ATG	2	6	45858	45863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
559	NC_009900	TGT	2	6	45868	45873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
560	NC_009900	AAAAC	2	10	45881	45890	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
561	NC_009900	TTA	2	6	45902	45907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_009900	ATA	2	6	45939	45944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_009900	A	7	7	45946	45952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_009900	GTA	2	6	45953	45958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
565	NC_009900	ACT	2	6	46022	46027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_009900	TAA	2	6	46033	46038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_009900	GGT	2	6	46049	46054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
568	NC_009900	GCA	2	6	46070	46075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_009900	TGA	2	6	46078	46083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
570	NC_009900	A	6	6	46103	46108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
571	NC_009900	TA	3	6	46152	46157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_009900	CGG	2	6	46191	46196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
573	NC_009900	CGG	2	6	46205	46210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_009900	ATT	2	6	46323	46328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_009900	CAA	2	6	46403	46408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_009900	TCGG	2	8	46422	46429	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
577	NC_009900	AAT	2	6	46576	46581	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_009900	ATGT	2	8	46582	46589	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
579	NC_009900	TAACT	2	10	46605	46614	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
580	NC_009900	ATTT	2	8	46740	46747	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_009900	AGC	2	6	46780	46785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_009900	TTAC	2	8	46819	46826	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
583	NC_009900	GCA	2	6	46874	46879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_009900	TTC	2	6	46936	46941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_009900	GTA	2	6	48320	48325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
586	NC_009900	CAT	3	9	48326	48334	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_009900	TAT	2	6	49126	49131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_009900	A	6	6	49145	49150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_009900	ATT	2	6	49202	49207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_009900	T	8	8	49206	49213	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
591	NC_009900	TTA	2	6	49296	49301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
592	NC_009900	AGTA	2	8	49319	49326	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
593	NC_009900	CTA	2	6	49330	49335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_009900	T	7	7	49338	49344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
595	NC_009900	CAT	2	6	49375	49380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_009900	A	6	6	49418	49423	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_009900	GCT	2	6	49430	49435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
598	NC_009900	AAGAG	2	10	49465	49474	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
599	NC_009900	ACT	2	6	49510	49515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_009900	AGC	2	6	49538	49543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_009900	ATAC	2	8	49545	49552	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
602	NC_009900	TAT	2	6	49570	49575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_009900	TTC	2	6	49580	49585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
604	NC_009900	GTT	2	6	49622	49627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
605	NC_009900	T	7	7	49666	49672	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
606	NC_009900	TTGC	2	8	49683	49690	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
607	NC_009900	TAT	2	6	49723	49728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
608	NC_009900	TTA	2	6	49731	49736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
609	NC_009900	TAT	2	6	49762	49767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_009900	TAT	2	6	49782	49787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_009900	ACT	2	6	49801	49806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_009900	TC	3	6	49808	49813	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
613	NC_009900	TAG	2	6	49830	49835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
614	NC_009900	TTA	2	6	49838	49843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_009900	ATT	2	6	49853	49858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_009900	TTC	3	9	49879	49887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_009900	TA	3	6	49906	49911	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_009900	AGTAC	2	10	49919	49928	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
619	NC_009900	TAA	2	6	49969	49974	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_009900	TA	3	6	50000	50005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_009900	GCT	2	6	50008	50013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_009900	TGTT	2	8	50049	50056	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
623	NC_009900	ATT	2	6	50061	50066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_009900	ATA	2	6	50067	50072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_009900	ATG	2	6	50092	50097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_009900	ATA	3	9	50103	50111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
627	NC_009900	TTAA	2	8	50137	50144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
628	NC_009900	AT	3	6	50152	50157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
629	NC_009900	CTT	2	6	50164	50169	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_009900	TAT	2	6	50243	50248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_009900	GCC	2	6	50275	50280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
632	NC_009900	TTA	2	6	50304	50309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
633	NC_009900	TCA	2	6	50324	50329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
634	NC_009900	TTC	2	6	50356	50361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
635	NC_009900	T	7	7	50376	50382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
636	NC_009900	AGC	2	6	50536	50541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
637	NC_009900	CTA	2	6	50640	50645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_009900	TGA	2	6	50694	50699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
639	NC_009900	TA	3	6	50707	50712	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
640	NC_009900	ATT	2	6	50738	50743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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642	NC_009900	CTC	2	6	50771	50776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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