MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 10863

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_009900	A	6	6	1004446	1004451	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_009900	AGT	2	6	1004463	1004468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8003	NC_009900	GTA	2	6	1004481	1004486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8004	NC_009900	ATT	2	6	1004487	1004492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8005	NC_009900	ATTC	2	8	1004505	1004512	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8006	NC_009900	GAA	2	6	1004561	1004566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8007	NC_009900	AT	3	6	1004586	1004591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8008	NC_009900	TAG	2	6	1004677	1004682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_009900	ATA	2	6	1004721	1004726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8010	NC_009900	GATAA	2	10	1004735	1004744	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_009900	TAT	2	6	1004748	1004753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8012	NC_009900	TGA	2	6	1004773	1004778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8013	NC_009900	TAA	2	6	1004792	1004797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_009900	GAG	2	6	1004849	1004854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8015	NC_009900	ATA	2	6	1004880	1004885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_009900	A	7	7	1004885	1004891	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_009900	T	6	6	1004907	1004912	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_009900	T	6	6	1005743	1005748	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_009900	A	7	7	1005776	1005782	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8020	NC_009900	AAC	2	6	1005788	1005793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_009900	A	6	6	1005830	1005835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_009900	TAT	2	6	1005840	1005845	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_009900	CTTGA	2	10	1008323	1008332	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8024	NC_009900	TCT	2	6	1008335	1008340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_009900	A	6	6	1008373	1008378	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_009900	TTGTG	2	10	1008379	1008388	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
8027	NC_009900	A	8	8	1008396	1008403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8028	NC_009900	A	6	6	1008405	1008410	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8029	NC_009900	CTAT	2	8	1008445	1008452	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8030	NC_009900	T	6	6	1008459	1008464	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_009900	ATTT	2	8	1008515	1008522	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_009900	T	6	6	1008520	1008525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_009900	CTT	2	6	1008553	1008558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_009900	TA	3	6	1008606	1008611	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_009900	TTGG	2	8	1008613	1008620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_009900	TTA	2	6	1008652	1008657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8037	NC_009900	CAC	2	6	1008659	1008664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8038	NC_009900	TAT	2	6	1008668	1008673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_009900	ATT	2	6	1008687	1008692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8040	NC_009900	TCA	2	6	1008774	1008779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8041	NC_009900	CCT	2	6	1008828	1008833	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8042	NC_009900	CTA	2	6	1008871	1008876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_009900	AGG	2	6	1008878	1008883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8044	NC_009900	TAGTT	2	10	1008923	1008932	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_009900	ACT	2	6	1008989	1008994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8047	NC_009900	A	7	7	1009116	1009122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8048	NC_009900	T	6	6	1009136	1009141	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8049	NC_009900	ATTTT	2	10	1009168	1009177	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8050	NC_009900	GTA	2	6	1009191	1009196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8051	NC_009900	AT	3	6	1009197	1009202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8052	NC_009900	A	6	6	1009204	1009209	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8053	NC_009900	CATA	2	8	1009237	1009244	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8054	NC_009900	GTA	2	6	1009264	1009269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_009900	AT	3	6	1009281	1009286	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_009900	AT	3	6	1009312	1009317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8057	NC_009900	TTA	2	6	1009342	1009347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8058	NC_009900	TA	3	6	1009368	1009373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_009900	TTAT	2	8	1009377	1009384	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_009900	T	6	6	1009429	1009434	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8061	NC_009900	CTG	2	6	1009460	1009465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_009900	TAT	2	6	1009470	1009475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8063	NC_009900	AT	4	8	1009474	1009481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_009900	TACC	2	8	1009509	1009516	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8065	NC_009900	TAT	2	6	1009558	1009563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_009900	T	7	7	1009581	1009587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8067	NC_009900	AGTA	2	8	1009633	1009640	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8068	NC_009900	ATATT	2	10	1009657	1009666	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_009900	AGT	2	6	1009683	1009688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8071	NC_009900	TTA	2	6	1009831	1009836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8073	NC_009900	T	7	7	1009852	1009858	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8074	NC_009900	TAT	2	6	1009896	1009901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8075	NC_009900	TAT	2	6	1009932	1009937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8076	NC_009900	AT	3	6	1009936	1009941	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8077	NC_009900	TAAT	2	8	1009952	1009959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8080	NC_009900	ATAGT	2	10	1010087	1010096	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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8082	NC_009900	CTT	2	6	1010142	1010147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8083	NC_009900	TAA	2	6	1010195	1010200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8084	NC_009900	GTA	2	6	1010245	1010250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8089	NC_009900	T	7	7	1010354	1010360	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8095	NC_009900	AT	3	6	1010467	1010472	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8099	NC_009900	TAA	2	6	1010606	1010611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8100	NC_009900	GCGA	2	8	1010673	1010680	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8101	NC_009900	ATT	2	6	1010794	1010799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8102	NC_009900	TTG	2	6	1010817	1010822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_009900	ATC	2	6	1010847	1010852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8104	NC_009900	GTAAT	2	10	1010892	1010901	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8105	NC_009900	A	6	6	1010939	1010944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_009900	TTTA	2	8	1011050	1011057	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8109	NC_009900	CTT	2	6	1011135	1011140	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8110	NC_009900	GA	3	6	1011155	1011160	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8111	NC_009900	TAC	2	6	1011204	1011209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8112	NC_009900	A	6	6	1011319	1011324	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8116	NC_009900	AT	3	6	1011442	1011447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8117	NC_009900	TTAG	2	8	1011450	1011457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8118	NC_009900	TTCA	2	8	1011540	1011547	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8119	NC_009900	TGG	2	6	1011587	1011592	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8124	NC_009900	TTA	2	6	1011705	1011710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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8126	NC_009900	ATA	2	6	1014312	1014317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8127	NC_009900	A	7	7	1014319	1014325	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8128	NC_009900	CTTA	2	8	1016972	1016979	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8129	NC_009900	ACT	2	6	1020434	1020439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8131	NC_009900	AAATA	2	10	1020460	1020469	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
8132	NC_009900	A	6	6	1020498	1020503	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8133	NC_009900	TAAT	2	8	1022685	1022692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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