MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseiflexus castenholzii DSM 13941 chromosome

Total Repeats: 20755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_009767	CCCCG	2	10	4538810	4538819	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
16502	NC_009767	CGTTC	2	10	4538825	4538834	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16503	NC_009767	CGATC	2	10	4538846	4538855	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16504	NC_009767	CGTTC	2	10	4538858	4538867	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16505	NC_009767	CGATC	3	15	4538879	4538893	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16506	NC_009767	CG	3	6	4538894	4538899	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16507	NC_009767	TCA	2	6	4538901	4538906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16508	NC_009767	AG	3	6	4538956	4538961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16509	NC_009767	TGC	2	6	4539979	4539984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16510	NC_009767	GTC	2	6	4541987	4541992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16511	NC_009767	AGCGC	2	10	4541999	4542008	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16512	NC_009767	GTC	2	6	4542009	4542014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16513	NC_009767	CGT	2	6	4542054	4542059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16514	NC_009767	AGCGC	2	10	4542067	4542076	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16515	NC_009767	GTC	2	6	4542077	4542082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16516	NC_009767	CGT	2	6	4542122	4542127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16517	NC_009767	AGCGC	2	10	4542135	4542144	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
16518	NC_009767	GTC	2	6	4542145	4542150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16519	NC_009767	GT	3	6	4542187	4542192	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16520	NC_009767	CCCA	2	8	4544525	4544532	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
16521	NC_009767	CT	3	6	4544537	4544542	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16522	NC_009767	CG	3	6	4544572	4544577	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16523	NC_009767	CG	4	8	4544616	4544623	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16524	NC_009767	CG	4	8	4544643	4544650	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16525	NC_009767	GCGGG	2	10	4544654	4544663	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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16527	NC_009767	A	6	6	4544743	4544748	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16528	NC_009767	CGG	2	6	4544765	4544770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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16530	NC_009767	CAA	2	6	4544930	4544935	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16531	NC_009767	TTC	2	6	4544985	4544990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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16535	NC_009767	AAT	2	6	4549570	4549575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16537	NC_009767	TCC	2	6	4550162	4550167	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16538	NC_009767	TG	3	6	4550210	4550215	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16539	NC_009767	CG	3	6	4550232	4550237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16540	NC_009767	CG	4	8	4550241	4550248	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16541	NC_009767	GCAG	2	8	4550272	4550279	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16542	NC_009767	ATG	2	6	4550339	4550344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16543	NC_009767	TGC	2	6	4550360	4550365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16546	NC_009767	CAC	2	6	4552130	4552135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16547	NC_009767	GTT	2	6	4557249	4557254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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16553	NC_009767	CGG	2	6	4559497	4559502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16554	NC_009767	TCC	2	6	4561557	4561562	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16555	NC_009767	GAA	2	6	4561584	4561589	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16556	NC_009767	GAAT	2	8	4564662	4564669	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16557	NC_009767	CTC	2	6	4565975	4565980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16558	NC_009767	CT	3	6	4568746	4568751	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16559	NC_009767	TGCG	2	8	4568761	4568768	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
16560	NC_009767	CCG	2	6	4568825	4568830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
16561	NC_009767	TGC	2	6	4568835	4568840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16563	NC_009767	CGG	2	6	4574021	4574026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
16564	NC_009767	CAT	2	6	4574101	4574106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16565	NC_009767	A	6	6	4574536	4574541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16566	NC_009767	TAA	2	6	4575293	4575298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16567	NC_009767	AATT	2	8	4575309	4575316	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16585	NC_009767	CTGCG	2	10	4596946	4596955	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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16588	NC_009767	GTAT	2	8	4597102	4597109	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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16593	NC_009767	GC	3	6	4598881	4598886	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16594	NC_009767	TG	3	6	4598941	4598946	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16595	NC_009767	AGCGT	2	10	4598971	4598980	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
16596	NC_009767	CTC	2	6	4601010	4601015	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16597	NC_009767	TAT	2	6	4601037	4601042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16598	NC_009767	CTC	2	6	4601052	4601057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16599	NC_009767	GCA	2	6	4601089	4601094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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16601	NC_009767	C	7	7	4601112	4601118	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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16603	NC_009767	CCCCA	2	10	4601167	4601176	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
16604	NC_009767	AGCGGG	2	12	4601179	4601190	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
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16608	NC_009767	GC	3	6	4601375	4601380	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16609	NC_009767	G	6	6	4601417	4601422	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16610	NC_009767	ACG	2	6	4601492	4601497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16611	NC_009767	CTTCG	2	10	4605374	4605383	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16612	NC_009767	GCT	2	6	4605435	4605440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16613	NC_009767	TCTA	2	8	4606495	4606502	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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16620	NC_009767	TCG	2	6	4606720	4606725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16621	NC_009767	C	6	6	4606749	4606754	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16622	NC_009767	CCAG	2	8	4606775	4606782	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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16626	NC_009767	GC	3	6	4607039	4607044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16627	NC_009767	GAC	2	6	4607118	4607123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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