MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseiflexus castenholzii DSM 13941 chromosome

Total Repeats: 20755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_009767	ACG	2	6	4239962	4239967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15002	NC_009767	GTG	2	6	4241148	4241153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15003	NC_009767	TGGCGC	2	12	4241165	4241176	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15004	NC_009767	ATC	2	6	4241210	4241215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15005	NC_009767	TGC	2	6	4241218	4241223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15006	NC_009767	GGTGA	2	10	4241235	4241244	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
15007	NC_009767	CGC	2	6	4241264	4241269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15008	NC_009767	CGG	2	6	4241320	4241325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15009	NC_009767	TCG	2	6	4241349	4241354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15010	NC_009767	GT	3	6	4241361	4241366	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15011	NC_009767	CG	3	6	4241462	4241467	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15012	NC_009767	GC	3	6	4241494	4241499	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15013	NC_009767	AAT	2	6	4241517	4241522	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15014	NC_009767	TCC	2	6	4241766	4241771	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15015	NC_009767	GTTCC	2	10	4241778	4241787	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15016	NC_009767	AC	3	6	4241797	4241802	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15017	NC_009767	AATA	2	8	4241804	4241811	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15018	NC_009767	A	7	7	4241825	4241831	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15019	NC_009767	TCCT	2	8	4241852	4241859	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15020	NC_009767	ATT	2	6	4241928	4241933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15021	NC_009767	CTT	2	6	4241957	4241962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15022	NC_009767	TGC	2	6	4241980	4241985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15023	NC_009767	ATT	2	6	4241999	4242004	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15024	NC_009767	CGAG	2	8	4242077	4242084	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15025	NC_009767	TGTT	2	8	4242117	4242124	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
15026	NC_009767	GCT	2	6	4242206	4242211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15027	NC_009767	CAG	2	6	4242264	4242269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15028	NC_009767	AG	4	8	4242268	4242275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15029	NC_009767	CGG	2	6	4243915	4243920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15030	NC_009767	GC	3	6	4243980	4243985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15031	NC_009767	ACC	2	6	4244013	4244018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15032	NC_009767	GAT	2	6	4244025	4244030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15033	NC_009767	ACA	2	6	4244970	4244975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15034	NC_009767	GGA	2	6	4244985	4244990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15035	NC_009767	CAG	2	6	4245028	4245033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15036	NC_009767	TTTC	2	8	4245042	4245049	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
15037	NC_009767	GAT	2	6	4245495	4245500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15038	NC_009767	GCG	2	6	4245502	4245507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15039	NC_009767	CG	3	6	4245558	4245563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15040	NC_009767	GAT	2	6	4245567	4245572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15041	NC_009767	GCG	2	6	4245574	4245579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15042	NC_009767	TGA	2	6	4245634	4245639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15043	NC_009767	CTC	2	6	4245645	4245650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15044	NC_009767	CGCC	2	8	4245718	4245725	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15045	NC_009767	ACG	2	6	4245729	4245734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15046	NC_009767	TC	3	6	4245761	4245766	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15047	NC_009767	GGTC	2	8	4245836	4245843	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15048	NC_009767	GAA	2	6	4245891	4245896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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15050	NC_009767	CGAC	2	8	4246020	4246027	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15051	NC_009767	GC	3	6	4246031	4246036	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15052	NC_009767	CGC	2	6	4246043	4246048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15053	NC_009767	GTT	2	6	4246175	4246180	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15054	NC_009767	CTA	2	6	4246181	4246186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15055	NC_009767	CGA	2	6	4246205	4246210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15056	NC_009767	GAC	2	6	4246237	4246242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15057	NC_009767	ATC	2	6	4246284	4246289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15058	NC_009767	CCA	2	6	4246290	4246295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15059	NC_009767	AAC	2	6	4246368	4246373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15060	NC_009767	GCG	2	6	4246420	4246425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15061	NC_009767	GCA	2	6	4246453	4246458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15062	NC_009767	ATT	2	6	4246482	4246487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15063	NC_009767	AGG	2	6	4246644	4246649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15064	NC_009767	ATGA	2	8	4246688	4246695	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15065	NC_009767	ACAT	2	8	4249960	4249967	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15066	NC_009767	ATG	2	6	4250000	4250005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15067	NC_009767	TCG	2	6	4250020	4250025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15068	NC_009767	G	6	6	4250046	4250051	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
15069	NC_009767	CTTCG	2	10	4250100	4250109	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15070	NC_009767	GCT	2	6	4250161	4250166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15071	NC_009767	TCA	2	6	4250210	4250215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15073	NC_009767	TCC	2	6	4250294	4250299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15074	NC_009767	CGGG	2	8	4251612	4251619	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
15075	NC_009767	TCA	2	6	4251629	4251634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15076	NC_009767	G	6	6	4251700	4251705	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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15079	NC_009767	CA	3	6	4253044	4253049	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15080	NC_009767	ATC	2	6	4253086	4253091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15081	NC_009767	TGC	2	6	4253094	4253099	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15082	NC_009767	CG	3	6	4253184	4253189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15083	NC_009767	CTG	2	6	4253225	4253230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15084	NC_009767	ACA	2	6	4253234	4253239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15085	NC_009767	CACC	2	8	4253276	4253283	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
15086	NC_009767	CGCA	2	8	4253337	4253344	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
15087	NC_009767	GCAT	2	8	4253357	4253364	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
15088	NC_009767	CACCCT	2	12	4253385	4253396	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15089	NC_009767	CGG	2	6	4253430	4253435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15090	NC_009767	CG	4	8	4253436	4253443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15091	NC_009767	CGG	2	6	4253453	4253458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15092	NC_009767	GCCC	2	8	4253538	4253545	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
15093	NC_009767	GGC	2	6	4253559	4253564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15094	NC_009767	GCT	2	6	4256361	4256366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15095	NC_009767	GA	3	6	4256411	4256416	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15096	NC_009767	GA	3	6	4256418	4256423	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15097	NC_009767	GCT	2	6	4256825	4256830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15098	NC_009767	GTGAG	2	10	4256945	4256954	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
15099	NC_009767	GTGAG	2	10	4256959	4256968	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
15100	NC_009767	CTTCG	2	10	4257147	4257156	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
15101	NC_009767	ACG	2	6	4257196	4257201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15103	NC_009767	T	7	7	4257295	4257301	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15104	NC_009767	TTA	2	6	4257325	4257330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15105	NC_009767	TTC	2	6	4258238	4258243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15106	NC_009767	CGA	2	6	4258294	4258299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15107	NC_009767	ATGA	2	8	4258312	4258319	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
15108	NC_009767	GAGCA	2	10	4259049	4259058	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15109	NC_009767	AGCGA	2	10	4259105	4259114	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15110	NC_009767	GTT	2	6	4259167	4259172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15111	NC_009767	GCG	2	6	4259187	4259192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15112	NC_009767	GAG	2	6	4259209	4259214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15113	NC_009767	TTGG	2	8	4261258	4261265	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15114	NC_009767	GCA	2	6	4261305	4261310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15115	NC_009767	CG	3	6	4261329	4261334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15116	NC_009767	ACGA	2	8	4261365	4261372	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15117	NC_009767	CA	3	6	4261387	4261392	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15118	NC_009767	AGC	2	6	4261442	4261447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15119	NC_009767	ACC	2	6	4261572	4261577	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15120	NC_009767	TAC	2	6	4261691	4261696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15121	NC_009767	GAG	2	6	4261770	4261775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15122	NC_009767	GGCGC	2	10	4263904	4263913	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
15123	NC_009767	ACG	2	6	4263956	4263961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15124	NC_009767	CCG	2	6	4265013	4265018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15125	NC_009767	GCG	2	6	4265044	4265049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15126	NC_009767	CGG	2	6	4265053	4265058	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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