MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseiflexus castenholzii DSM 13941 chromosome

Total Repeats: 20755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_009767	CG	3	6	4104263	4104268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14502	NC_009767	GCA	2	6	4105104	4105109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14503	NC_009767	GCCTC	2	10	4105197	4105206	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14504	NC_009767	CG	3	6	4105299	4105304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14505	NC_009767	CGCCT	2	10	4105490	4105499	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14506	NC_009767	CT	3	6	4105498	4105503	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14507	NC_009767	CGCCT	2	10	4105592	4105601	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
14508	NC_009767	CT	3	6	4105600	4105605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14509	NC_009767	CT	3	6	4105635	4105640	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14510	NC_009767	CGCTA	2	10	4105734	4105743	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14511	NC_009767	TC	3	6	4105752	4105757	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14512	NC_009767	CGCTA	2	10	4105803	4105812	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
14513	NC_009767	TC	3	6	4105821	4105826	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14514	NC_009767	AG	3	6	4105879	4105884	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14515	NC_009767	GC	3	6	4106682	4106687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14516	NC_009767	GCT	2	6	4106838	4106843	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14517	NC_009767	C	6	6	4106884	4106889	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14518	NC_009767	GAAGA	2	10	4106929	4106938	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14519	NC_009767	GAG	2	6	4106939	4106944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14520	NC_009767	GCG	2	6	4108323	4108328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14521	NC_009767	GAC	2	6	4108378	4108383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14522	NC_009767	GA	3	6	4108398	4108403	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14523	NC_009767	ACG	2	6	4108426	4108431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14524	NC_009767	GGC	2	6	4108495	4108500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14525	NC_009767	CAT	2	6	4109861	4109866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14526	NC_009767	GT	3	6	4109878	4109883	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14527	NC_009767	CGC	2	6	4109942	4109947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14528	NC_009767	TGA	2	6	4109948	4109953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14529	NC_009767	CAG	2	6	4111806	4111811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14530	NC_009767	TCC	2	6	4111822	4111827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14531	NC_009767	GGC	2	6	4111915	4111920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14532	NC_009767	ACCAA	2	10	4111935	4111944	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
14533	NC_009767	ATC	2	6	4111956	4111961	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14534	NC_009767	GAT	2	6	4111978	4111983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14535	NC_009767	CCTCC	2	10	4111989	4111998	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
14536	NC_009767	CCT	2	6	4112037	4112042	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14537	NC_009767	CTC	2	6	4112111	4112116	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14538	NC_009767	TG	3	6	4112198	4112203	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
14539	NC_009767	AGC	2	6	4116063	4116068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14540	NC_009767	CATCTT	2	12	4116091	4116102	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14541	NC_009767	TCCC	2	8	4116187	4116194	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
14542	NC_009767	CG	3	6	4116325	4116330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14543	NC_009767	CCG	2	6	4116372	4116377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14544	NC_009767	GC	3	6	4116469	4116474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14545	NC_009767	GGAAA	2	10	4116559	4116568	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
14546	NC_009767	ACGA	2	8	4117810	4117817	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14547	NC_009767	TC	3	6	4117820	4117825	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14548	NC_009767	CG	3	6	4117833	4117838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14549	NC_009767	CAT	2	6	4120298	4120303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14550	NC_009767	CACAG	2	10	4120343	4120352	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
14551	NC_009767	AAT	2	6	4120420	4120425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14552	NC_009767	GGC	2	6	4120446	4120451	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14553	NC_009767	GCCT	2	8	4120477	4120484	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14554	NC_009767	CGAG	2	8	4121085	4121092	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14555	NC_009767	GC	3	6	4121142	4121147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14556	NC_009767	CAT	2	6	4121153	4121158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14557	NC_009767	CCCG	2	8	4123196	4123203	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14558	NC_009767	CGCC	2	8	4123233	4123240	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14559	NC_009767	CCCG	3	12	4123253	4123264	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14560	NC_009767	CCCG	2	8	4123315	4123322	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14561	NC_009767	CCAGCG	2	12	4123360	4123371	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14562	NC_009767	CG	3	6	4123379	4123384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14563	NC_009767	GAG	2	6	4123393	4123398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14566	NC_009767	CTTCG	2	10	4126535	4126544	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14567	NC_009767	CG	3	6	4126593	4126598	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14568	NC_009767	CTC	2	6	4126680	4126685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14569	NC_009767	CAAT	2	8	4126693	4126700	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14570	NC_009767	CGG	2	6	4126701	4126706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14571	NC_009767	CCG	2	6	4126721	4126726	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14575	NC_009767	CGC	2	6	4127016	4127021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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14581	NC_009767	CCCCG	2	10	4128726	4128735	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
14582	NC_009767	CCCCG	2	10	4128762	4128771	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
14583	NC_009767	GCC	2	6	4128827	4128832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14584	NC_009767	AAAGTA	2	12	4128846	4128857	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14585	NC_009767	CTTCG	2	10	4130094	4130103	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14586	NC_009767	CTTCG	2	10	4130232	4130241	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14587	NC_009767	GCT	2	6	4130293	4130298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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14598	NC_009767	GGT	2	6	4131798	4131803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14599	NC_009767	CAA	2	6	4136109	4136114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14600	NC_009767	CCG	2	6	4136127	4136132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14601	NC_009767	TTC	2	6	4136239	4136244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14602	NC_009767	A	6	6	4136265	4136270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14603	NC_009767	GGCG	2	8	4136330	4136337	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14604	NC_009767	CCGC	2	8	4136354	4136361	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14605	NC_009767	GC	3	6	4136360	4136365	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14606	NC_009767	GC	3	6	4136411	4136416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14607	NC_009767	CGGG	2	8	4136454	4136461	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
14608	NC_009767	AT	3	6	4136527	4136532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14609	NC_009767	AGG	2	6	4136563	4136568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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14611	NC_009767	CCTT	2	8	4138295	4138302	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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14617	NC_009767	C	8	8	4142419	4142426	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14618	NC_009767	TAG	2	6	4142437	4142442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14622	NC_009767	CCG	2	6	4142527	4142532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14623	NC_009767	TCG	2	6	4142540	4142545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14624	NC_009767	CCT	2	6	4142591	4142596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14625	NC_009767	GGA	2	6	4142629	4142634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14626	NC_009767	AAC	2	6	4143680	4143685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14627	NC_009767	GAG	3	9	4143686	4143694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14628	NC_009767	ACCGC	2	10	4145111	4145120	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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