MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseiflexus castenholzii DSM 13941 chromosome

Total Repeats: 20755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009767	GAG	2	6	149738	149743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
502	NC_009767	A	7	7	149785	149791	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_009767	ATA	2	6	149797	149802	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_009767	GCA	2	6	149867	149872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_009767	TTCG	2	8	149912	149919	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
506	NC_009767	GAG	2	6	152368	152373	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
507	NC_009767	CGC	2	6	152473	152478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_009767	CTCGC	2	10	152633	152642	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
509	NC_009767	C	6	6	152924	152929	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
510	NC_009767	GAGAG	2	10	153061	153070	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
511	NC_009767	CCCG	2	8	154967	154974	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
512	NC_009767	TC	3	6	156303	156308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
513	NC_009767	CGC	2	6	156335	156340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
514	NC_009767	GCG	2	6	156363	156368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_009767	TGA	2	6	156402	156407	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_009767	TGCC	2	8	156453	156460	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
517	NC_009767	CCT	2	6	158139	158144	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_009767	GAAGGT	2	12	160566	160577	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
519	NC_009767	ATG	2	6	160644	160649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_009767	GCGCG	2	10	160770	160779	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
521	NC_009767	GCGAG	2	10	160784	160793	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
522	NC_009767	GCG	2	6	160883	160888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_009767	GCG	2	6	160945	160950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
524	NC_009767	TGA	2	6	161267	161272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
525	NC_009767	CGT	2	6	161344	161349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_009767	GTT	2	6	161376	161381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_009767	GCG	2	6	161384	161389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_009767	GAA	2	6	161416	161421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
529	NC_009767	CAT	2	6	161439	161444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_009767	CCG	2	6	161461	161466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_009767	TGC	2	6	161468	161473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_009767	TGG	2	6	161503	161508	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_009767	CTG	2	6	161596	161601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_009767	GC	3	6	161641	161646	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
535	NC_009767	CAAC	2	8	161662	161669	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
536	NC_009767	GAC	2	6	161711	161716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_009767	TTC	2	6	161777	161782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_009767	AGA	2	6	161835	161840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_009767	GCT	2	6	161917	161922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_009767	GC	3	6	161937	161942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
541	NC_009767	GA	3	6	161972	161977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
542	NC_009767	GA	3	6	162696	162701	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_009767	GCGCC	2	10	162898	162907	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
544	NC_009767	GGC	2	6	162925	162930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_009767	TCCG	3	12	162933	162944	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
546	NC_009767	CGC	2	6	162948	162953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_009767	GCC	2	6	162958	162963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_009767	TAG	2	6	165958	165963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
549	NC_009767	ACT	2	6	165975	165980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
550	NC_009767	AGT	2	6	166950	166955	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_009767	AAAG	2	8	171410	171417	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
552	NC_009767	ATTG	2	8	171418	171425	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
553	NC_009767	CT	3	6	171428	171433	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
554	NC_009767	GTT	2	6	171517	171522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_009767	AAT	2	6	171562	171567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_009767	GA	3	6	173164	173169	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
557	NC_009767	GGTT	2	8	175464	175471	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
558	NC_009767	TG	3	6	175523	175528	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
559	NC_009767	GCG	2	6	175545	175550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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561	NC_009767	G	6	6	175576	175581	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
562	NC_009767	TTC	2	6	175604	175609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_009767	ACG	2	6	175617	175622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_009767	CTC	2	6	175686	175691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_009767	GA	3	6	175714	175719	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
566	NC_009767	CGC	2	6	175734	175739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
567	NC_009767	TC	3	6	175830	175835	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_009767	ATT	2	6	175851	175856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_009767	ATG	2	6	175879	175884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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571	NC_009767	TGA	2	6	176978	176983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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573	NC_009767	GGC	2	6	177118	177123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_009767	TCA	2	6	177153	177158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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579	NC_009767	CG	3	6	177937	177942	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
580	NC_009767	CG	3	6	178018	178023	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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582	NC_009767	CG	3	6	178053	178058	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
583	NC_009767	TCG	2	6	178065	178070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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602	NC_009767	GAACG	2	10	184067	184076	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
603	NC_009767	CGC	2	6	189485	189490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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607	NC_009767	GAG	2	6	195322	195327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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613	NC_009767	GCCGA	2	10	195526	195535	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
614	NC_009767	ATC	2	6	195550	195555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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617	NC_009767	CGGA	2	8	195635	195642	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
618	NC_009767	GATC	2	8	195644	195651	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
619	NC_009767	GCTC	2	8	195665	195672	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
620	NC_009767	CG	3	6	195760	195765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
621	NC_009767	CG	3	6	195782	195787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
622	NC_009767	CGT	2	6	195873	195878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_009767	CGA	2	6	196782	196787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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629	NC_009767	CAC	2	6	197136	197141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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633	NC_009767	ACT	2	6	197289	197294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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636	NC_009767	TG	3	6	197368	197373	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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