MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseiflexus castenholzii DSM 13941 chromosome

Total Repeats: 20755

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_009767	TGCG	2	8	1532688	1532695	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5502	NC_009767	TGA	2	6	1532719	1532724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_009767	GT	3	6	1532771	1532776	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_009767	CTG	2	6	1532788	1532793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5505	NC_009767	GTTT	2	8	1532815	1532822	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5506	NC_009767	T	7	7	1532892	1532898	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5507	NC_009767	AG	3	6	1532910	1532915	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_009767	TCA	2	6	1534097	1534102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5509	NC_009767	GA	3	6	1534103	1534108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5510	NC_009767	GTT	2	6	1534122	1534127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5511	NC_009767	GAT	2	6	1534159	1534164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5512	NC_009767	GC	3	6	1534973	1534978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5513	NC_009767	CGC	2	6	1535004	1535009	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5514	NC_009767	ATC	2	6	1535019	1535024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_009767	CG	4	8	1535080	1535087	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5516	NC_009767	GC	3	6	1535151	1535156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5517	NC_009767	TCG	2	6	1535172	1535177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5518	NC_009767	CTG	2	6	1535207	1535212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5519	NC_009767	C	6	6	1535273	1535278	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5520	NC_009767	GC	3	6	1535280	1535285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5521	NC_009767	CG	5	10	1535301	1535310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5522	NC_009767	CG	3	6	1535332	1535337	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5523	NC_009767	CGA	2	6	1535426	1535431	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_009767	TTCC	2	8	1536530	1536537	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5525	NC_009767	GCG	2	6	1536549	1536554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5526	NC_009767	CATC	2	8	1536564	1536571	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5527	NC_009767	ATC	2	6	1536617	1536622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5528	NC_009767	GTT	2	6	1536646	1536651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_009767	GGC	3	9	1536828	1536836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_009767	GC	3	6	1536835	1536840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5531	NC_009767	GCC	2	6	1536848	1536853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5532	NC_009767	GCA	2	6	1536888	1536893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_009767	GC	3	6	1538427	1538432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5534	NC_009767	GGCGG	2	10	1538437	1538446	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5535	NC_009767	GCGCA	2	10	1538465	1538474	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5536	NC_009767	GC	3	6	1538500	1538505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5537	NC_009767	GCGAG	2	10	1541208	1541217	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5538	NC_009767	TG	3	6	1541259	1541264	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5539	NC_009767	GCGAG	2	10	1541328	1541337	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5540	NC_009767	TG	3	6	1541379	1541384	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_009767	GCGAG	2	10	1541427	1541436	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5542	NC_009767	TG	3	6	1541520	1541525	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5543	NC_009767	GCGAG	2	10	1541568	1541577	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5544	NC_009767	GCGAG	2	10	1541693	1541702	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5545	NC_009767	TG	3	6	1541763	1541768	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5546	NC_009767	GCGAG	2	10	1541853	1541862	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5547	NC_009767	TG	3	6	1541904	1541909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5548	NC_009767	GCGAG	2	10	1541994	1542003	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5549	NC_009767	TG	3	6	1542045	1542050	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5550	NC_009767	GCGAG	2	10	1542093	1542102	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5551	NC_009767	TG	3	6	1542156	1542161	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5552	NC_009767	GCGAG	2	10	1542246	1542255	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5553	NC_009767	TG	3	6	1542297	1542302	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_009767	GCGAG	2	10	1542345	1542354	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5555	NC_009767	GCGAG	2	10	1542463	1542472	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5556	NC_009767	GCGAG	2	10	1542588	1542597	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5557	NC_009767	TG	3	6	1542771	1542776	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_009767	GAGAG	2	10	1542777	1542786	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_009767	TG	3	6	1542875	1542880	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5560	NC_009767	GAG	2	6	1542883	1542888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_009767	CGAGA	2	10	1542936	1542945	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5562	NC_009767	TC	3	6	1542958	1542963	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5563	NC_009767	CATA	2	8	1543015	1543022	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5564	NC_009767	CG	3	6	1543046	1543051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5568	NC_009767	GT	3	6	1547440	1547445	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5569	NC_009767	TG	3	6	1547457	1547462	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_009767	TCGG	2	8	1547993	1548000	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5571	NC_009767	ACGAT	2	10	1548019	1548028	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5572	NC_009767	GGGAG	2	10	1548033	1548042	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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5582	NC_009767	GC	3	6	1549551	1549556	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5584	NC_009767	GC	3	6	1549595	1549600	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5585	NC_009767	GC	3	6	1549617	1549622	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5599	NC_009767	GGA	2	6	1553458	1553463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5602	NC_009767	CA	3	6	1553549	1553554	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5603	NC_009767	GCT	2	6	1553561	1553566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5615	NC_009767	CCTGA	2	10	1555547	1555556	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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5619	NC_009767	TAT	2	6	1558498	1558503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5623	NC_009767	TC	3	6	1560980	1560985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5624	NC_009767	CCG	2	6	1560992	1560997	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5625	NC_009767	CG	3	6	1561020	1561025	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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5629	NC_009767	TTCT	2	8	1561129	1561136	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5630	NC_009767	CTC	2	6	1561138	1561143	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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