MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 16791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_009523	TGA	3	9	1114668	1114676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_009523	CT	3	6	1114715	1114720	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3503	NC_009523	TGG	2	6	1114739	1114744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3504	NC_009523	TAG	2	6	1114791	1114796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_009523	CCT	2	6	1114842	1114847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3506	NC_009523	GCA	2	6	1114887	1114892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_009523	ACA	2	6	1114909	1114914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_009523	TGT	2	6	1115013	1115018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_009523	CGC	2	6	1115024	1115029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3510	NC_009523	ATG	2	6	1115035	1115040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_009523	GCA	2	6	1115071	1115076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_009523	ATG	2	6	1115168	1115173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_009523	TCT	2	6	1115751	1115756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_009523	GCC	2	6	1115808	1115813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3515	NC_009523	CT	3	6	1115833	1115838	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3516	NC_009523	CT	3	6	1115855	1115860	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3517	NC_009523	TGC	2	6	1115872	1115877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3518	NC_009523	TAT	2	6	1115914	1115919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_009523	CAA	2	6	1116018	1116023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_009523	TGA	2	6	1116085	1116090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_009523	GC	3	6	1116100	1116105	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3522	NC_009523	TC	4	8	1116126	1116133	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3523	NC_009523	AGC	2	6	1116180	1116185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3524	NC_009523	CAG	2	6	1116282	1116287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_009523	AGG	2	6	1116292	1116297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_009523	CCTG	3	12	1116639	1116650	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3527	NC_009523	GCA	2	6	1116727	1116732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_009523	GGC	2	6	1117566	1117571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3529	NC_009523	TGT	2	6	1120705	1120710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_009523	CGG	2	6	1120743	1120748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_009523	GCG	3	9	1122007	1122015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3532	NC_009523	AG	3	6	1122032	1122037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_009523	AGA	2	6	1122067	1122072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_009523	GA	3	6	1122104	1122109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_009523	CAGC	2	8	1122148	1122155	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3536	NC_009523	ACG	2	6	1123739	1123744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_009523	GTA	2	6	1123766	1123771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3538	NC_009523	TAC	2	6	1123772	1123777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_009523	GGT	2	6	1123800	1123805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3540	NC_009523	GA	3	6	1123830	1123835	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_009523	TCC	3	9	1127436	1127444	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3542	NC_009523	GCA	2	6	1127462	1127467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_009523	GGAAT	2	10	1127491	1127500	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_009523	TGT	2	6	1127540	1127545	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3545	NC_009523	TGAG	2	8	1128106	1128113	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3546	NC_009523	GC	3	6	1128117	1128122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3547	NC_009523	TCC	2	6	1130423	1130428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3548	NC_009523	CG	3	6	1130431	1130436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3549	NC_009523	TGTAC	2	10	1130457	1130466	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
3550	NC_009523	TGC	2	6	1130469	1130474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_009523	GCA	2	6	1130478	1130483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_009523	AAAAG	2	10	1130484	1130493	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3553	NC_009523	CA	3	6	1130602	1130607	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3554	NC_009523	TGCTG	2	10	1130658	1130667	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
3555	NC_009523	CAGG	2	8	1131258	1131265	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3556	NC_009523	TGC	2	6	1131279	1131284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_009523	GGCG	2	8	1131303	1131310	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3558	NC_009523	CGCC	2	8	1131323	1131330	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3559	NC_009523	TCG	2	6	1131342	1131347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3560	NC_009523	ATT	2	6	1132325	1132330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_009523	GTT	2	6	1132413	1132418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3562	NC_009523	AGGG	2	8	1132591	1132598	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_009523	GTC	2	6	1132620	1132625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3564	NC_009523	GAG	2	6	1132627	1132632	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_009523	CTTCC	2	10	1137498	1137507	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
3566	NC_009523	AC	3	6	1137508	1137513	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3567	NC_009523	TAT	2	6	1138323	1138328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_009523	TCA	2	6	1138952	1138957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_009523	GCG	2	6	1138961	1138966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_009523	CGA	2	6	1139127	1139132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_009523	GT	3	6	1139160	1139165	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_009523	CGG	2	6	1139187	1139192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_009523	CAA	2	6	1139196	1139201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_009523	TCT	2	6	1139211	1139216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_009523	CG	3	6	1140766	1140771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3576	NC_009523	CG	3	6	1140877	1140882	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3577	NC_009523	GCC	2	6	1140938	1140943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3578	NC_009523	GCC	2	6	1140982	1140987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3579	NC_009523	GC	4	8	1141058	1141065	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3580	NC_009523	CA	3	6	1141105	1141110	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3581	NC_009523	CCT	2	6	1142108	1142113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3582	NC_009523	ATTT	2	8	1142403	1142410	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_009523	ATTT	2	8	1142451	1142458	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3584	NC_009523	TCA	2	6	1142557	1142562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3585	NC_009523	GCA	2	6	1142636	1142641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3586	NC_009523	GC	3	6	1146781	1146786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3587	NC_009523	GGC	2	6	1146829	1146834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_009523	GTC	2	6	1146836	1146841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3589	NC_009523	CG	3	6	1146876	1146881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3590	NC_009523	GC	4	8	1146883	1146890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3591	NC_009523	CGC	3	9	1146888	1146896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3592	NC_009523	GGT	2	6	1148127	1148132	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_009523	TTG	2	6	1148134	1148139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_009523	GTT	2	6	1148622	1148627	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3595	NC_009523	GCG	2	6	1148636	1148641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3596	NC_009523	GCT	2	6	1149165	1149170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_009523	CTT	2	6	1149171	1149176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_009523	CGT	2	6	1149186	1149191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_009523	CGT	2	6	1149213	1149218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3600	NC_009523	A	6	6	1149253	1149258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3601	NC_009523	CAC	2	6	1149262	1149267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3602	NC_009523	GCC	2	6	1149337	1149342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3603	NC_009523	ACG	2	6	1149346	1149351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_009523	TC	3	6	1149503	1149508	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3605	NC_009523	AG	3	6	1149561	1149566	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_009523	GAA	2	6	1149672	1149677	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_009523	GTCG	2	8	1149679	1149686	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3608	NC_009523	CT	3	6	1149687	1149692	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3609	NC_009523	TG	3	6	1151198	1151203	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_009523	CGG	2	6	1152946	1152951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_009523	ACGA	2	8	1152959	1152966	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3612	NC_009523	CGT	2	6	1152967	1152972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_009523	AC	3	6	1152995	1153000	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3614	NC_009523	GCG	2	6	1155361	1155366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_009523	GTG	2	6	1157580	1157585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_009523	CAGT	2	8	1159472	1159479	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3617	NC_009523	CGT	2	6	1159538	1159543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3620	NC_009523	CCG	3	9	1159599	1159607	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3621	NC_009523	AACG	2	8	1159698	1159705	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3622	NC_009523	TGA	2	6	1159708	1159713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3624	NC_009523	ATGA	2	8	1159763	1159770	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_009523	GTC	2	6	1161597	1161602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3626	NC_009523	GT	3	6	1161626	1161631	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3627	NC_009523	CCA	2	6	1163241	1163246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3628	NC_009523	GGA	2	6	1164858	1164863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3629	NC_009523	CGG	2	6	1165710	1165715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3631	NC_009523	GCA	2	6	1165745	1165750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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