MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseiflexus sp. RS-1 chromosome

Total Repeats: 16791

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_009523	CA	3	6	2231764	2231769	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6502	NC_009523	CCA	2	6	2231814	2231819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6503	NC_009523	CGA	2	6	2232625	2232630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6504	NC_009523	GCG	2	6	2232641	2232646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6505	NC_009523	GGC	2	6	2232687	2232692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6506	NC_009523	CAG	2	6	2232740	2232745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6507	NC_009523	ATG	2	6	2232817	2232822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6508	NC_009523	TGA	2	6	2232838	2232843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6509	NC_009523	TG	3	6	2233731	2233736	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_009523	CCT	2	6	2234674	2234679	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6511	NC_009523	TCC	2	6	2234681	2234686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6512	NC_009523	CT	3	6	2234723	2234728	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6513	NC_009523	AAC	2	6	2234785	2234790	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6514	NC_009523	GCA	2	6	2234812	2234817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6515	NC_009523	GC	3	6	2234822	2234827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6516	NC_009523	GC	3	6	2234847	2234852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6517	NC_009523	TC	4	8	2234855	2234862	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6518	NC_009523	AGT	2	6	2237073	2237078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_009523	GCA	2	6	2237108	2237113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6520	NC_009523	GCGCT	2	10	2237114	2237123	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6521	NC_009523	GCG	3	9	2237134	2237142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6522	NC_009523	GCA	2	6	2237160	2237165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6523	NC_009523	GCGCT	2	10	2237166	2237175	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6524	NC_009523	GCG	3	9	2237186	2237194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6525	NC_009523	GCA	2	6	2237212	2237217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6526	NC_009523	GCGCT	2	10	2237218	2237227	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6527	NC_009523	GCG	2	6	2237238	2237243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6528	NC_009523	G	6	6	2239155	2239160	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_009523	TC	3	6	2239201	2239206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6530	NC_009523	G	6	6	2239231	2239236	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6531	NC_009523	TC	3	6	2239277	2239282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6532	NC_009523	CT	3	6	2240201	2240206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6533	NC_009523	CGGA	2	8	2240239	2240246	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6534	NC_009523	CCT	2	6	2242986	2242991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6535	NC_009523	TCC	2	6	2244563	2244568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6536	NC_009523	TGT	2	6	2247927	2247932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6537	NC_009523	TCC	2	6	2247933	2247938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6538	NC_009523	GCT	2	6	2248684	2248689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6539	NC_009523	TCG	2	6	2248695	2248700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6540	NC_009523	GCG	2	6	2248713	2248718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6541	NC_009523	GCC	2	6	2248770	2248775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6542	NC_009523	CGC	2	6	2248776	2248781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6543	NC_009523	CCAT	2	8	2248782	2248789	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6544	NC_009523	AAG	2	6	2248798	2248803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_009523	GT	3	6	2248933	2248938	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6546	NC_009523	CTG	2	6	2249122	2249127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6547	NC_009523	GACA	2	8	2249165	2249172	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6548	NC_009523	TGC	2	6	2249223	2249228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6549	NC_009523	TGGT	2	8	2251841	2251848	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6550	NC_009523	TTA	2	6	2251859	2251864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6551	NC_009523	AGC	2	6	2252001	2252006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6552	NC_009523	CCA	2	6	2252047	2252052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6553	NC_009523	GGT	2	6	2252054	2252059	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6554	NC_009523	AAT	2	6	2252129	2252134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_009523	CG	3	6	2252210	2252215	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6556	NC_009523	CAG	2	6	2252234	2252239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6557	NC_009523	CCA	2	6	2252257	2252262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6558	NC_009523	GCC	2	6	2252360	2252365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6559	NC_009523	CAG	2	6	2252375	2252380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6560	NC_009523	GAA	2	6	2252387	2252392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6561	NC_009523	GCA	2	6	2252434	2252439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6562	NC_009523	GATC	2	8	2252450	2252457	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6563	NC_009523	CGA	2	6	2252461	2252466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6564	NC_009523	CTT	2	6	2252584	2252589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6565	NC_009523	CATCA	2	10	2252603	2252612	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6566	NC_009523	ACG	2	6	2252622	2252627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6567	NC_009523	CAT	2	6	2252644	2252649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6568	NC_009523	CGA	2	6	2252650	2252655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6569	NC_009523	GC	3	6	2252678	2252683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6570	NC_009523	GC	3	6	2252690	2252695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6571	NC_009523	CAG	2	6	2252780	2252785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6572	NC_009523	CGC	2	6	2252787	2252792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6573	NC_009523	ATAG	2	8	2252836	2252843	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6574	NC_009523	CGT	2	6	2252857	2252862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6575	NC_009523	GC	3	6	2252879	2252884	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6576	NC_009523	CGA	2	6	2252920	2252925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6579	NC_009523	GCA	2	6	2252968	2252973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6580	NC_009523	CGG	2	6	2252986	2252991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6581	NC_009523	CCT	2	6	2252992	2252997	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6582	NC_009523	GCC	2	6	2253009	2253014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6583	NC_009523	GGC	3	9	2253056	2253064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6586	NC_009523	GCC	2	6	2253168	2253173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6587	NC_009523	TGT	2	6	2253174	2253179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6591	NC_009523	GTC	2	6	2253290	2253295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6593	NC_009523	CAGATC	2	12	2253329	2253340	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6595	NC_009523	TCC	2	6	2254089	2254094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6596	NC_009523	GCG	2	6	2254148	2254153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6597	NC_009523	GCC	2	6	2254176	2254181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6598	NC_009523	AGG	2	6	2254188	2254193	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6599	NC_009523	G	6	6	2254262	2254267	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6600	NC_009523	TGAC	2	8	2254320	2254327	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6601	NC_009523	TGC	2	6	2254343	2254348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6603	NC_009523	CT	3	6	2254398	2254403	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6604	NC_009523	GTT	2	6	2254427	2254432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6605	NC_009523	TG	3	6	2254601	2254606	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6606	NC_009523	TAGA	2	8	2256427	2256434	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6607	NC_009523	CAG	2	6	2256465	2256470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6608	NC_009523	GTT	2	6	2256484	2256489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6609	NC_009523	CT	3	6	2259032	2259037	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6610	NC_009523	ACG	2	6	2259078	2259083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6611	NC_009523	GC	3	6	2259186	2259191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6612	NC_009523	CCT	2	6	2260277	2260282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6613	NC_009523	GT	3	6	2261493	2261498	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6614	NC_009523	CG	3	6	2261530	2261535	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6615	NC_009523	TAAG	2	8	2261564	2261571	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6618	NC_009523	TG	4	8	2261635	2261642	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6619	NC_009523	AT	3	6	2261714	2261719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6620	NC_009523	ATA	2	6	2261753	2261758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6621	NC_009523	GTC	2	6	2261767	2261772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6623	NC_009523	GAG	2	6	2263939	2263944	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6624	NC_009523	ATG	2	6	2265969	2265974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_009523	TGC	2	6	2266021	2266026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6626	NC_009523	CAG	2	6	2266060	2266065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6627	NC_009523	CGC	2	6	2266154	2266159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6628	NC_009523	GC	3	6	2266165	2266170	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6892	NC_009523	TCCG	2	8	2340179	2340186	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6893	NC_009523	GGT	2	6	2340228	2340233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6895	NC_009523	CG	3	6	2340356	2340361	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6896	NC_009523	GC	3	6	2340391	2340396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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