MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseobacter denitrificans plasmid pTB4

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008389	ACA	2	6	127	132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008389	CGG	2	6	179	184	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_008389	AGA	2	6	203	208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008389	GATC	2	8	296	303	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5	NC_008389	CCT	2	6	502	507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_008389	TTC	2	6	547	552	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_008389	G	6	6	554	559	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008389	CAGAC	2	10	639	648	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_008389	ACA	2	6	718	723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_008389	GAT	2	6	757	762	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_008389	GA	3	6	826	831	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008389	G	6	6	970	975	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008389	AGT	2	6	1601	1606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008389	A	6	6	1617	1622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008389	C	6	6	3548	3553	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_008389	GC	3	6	3560	3565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_008389	CTT	2	6	3575	3580	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_008389	TCT	2	6	3613	3618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_008389	TCC	2	6	3657	3662	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20	NC_008389	CGG	2	6	3763	3768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_008389	GAT	2	6	3797	3802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_008389	CCAC	2	8	3803	3810	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_008389	T	7	7	3842	3848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008389	TCG	2	6	3862	3867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008389	CTGC	2	8	3892	3899	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_008389	TA	3	6	4045	4050	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008389	TTC	2	6	4686	4691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008389	GCC	2	6	4726	4731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_008389	CTG	2	6	5073	5078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_008389	CTT	2	6	5186	5191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008389	TG	3	6	5210	5215	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008389	CA	3	6	5273	5278	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_008389	TGAA	2	8	5434	5441	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008389	GC	3	6	5449	5454	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_008389	ACG	2	6	5577	5582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_008389	CCG	2	6	5644	5649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_008389	GGC	2	6	5752	5757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.