MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL11

Total Repeats: 1602

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008384	CCGC	2	8	624935	624942	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1502	NC_008384	TTC	2	6	625024	625029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1503	NC_008384	GCT	2	6	625046	625051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_008384	GCG	2	6	625090	625095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1505	NC_008384	GCCTGC	2	12	625182	625193	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1506	NC_008384	GGGC	2	8	626409	626416	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1507	NC_008384	CTG	2	6	626429	626434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1508	NC_008384	CCGC	2	8	626450	626457	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1509	NC_008384	GAG	2	6	626544	626549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_008384	TGCG	2	8	627500	627507	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1511	NC_008384	GTT	2	6	627556	627561	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_008384	CTCGC	2	10	627757	627766	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1513	NC_008384	ATG	2	6	627798	627803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_008384	CAT	2	6	629926	629931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_008384	TCA	2	6	630319	630324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_008384	CG	3	6	630779	630784	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1517	NC_008384	GCC	2	6	630836	630841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1518	NC_008384	CGC	2	6	630890	630895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_008384	CATT	2	8	633319	633326	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1520	NC_008384	TCAT	2	8	633327	633334	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1521	NC_008384	CCT	2	6	640651	640656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1522	NC_008384	ACTG	2	8	640695	640702	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1523	NC_008384	CTTG	2	8	640728	640735	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1524	NC_008384	AGGG	2	8	640736	640743	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1525	NC_008384	ATT	2	6	640750	640755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1526	NC_008384	GAA	2	6	640765	640770	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_008384	GAG	2	6	640844	640849	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_008384	GAT	2	6	642145	642150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_008384	CGC	2	6	643888	643893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1530	NC_008384	GCA	2	6	643941	643946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_008384	AGGA	2	8	645218	645225	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_008384	CCG	2	6	645226	645231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1533	NC_008384	CGA	2	6	645252	645257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_008384	GCC	3	9	645285	645293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1535	NC_008384	GCC	2	6	645303	645308	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1536	NC_008384	GAT	2	6	645516	645521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1537	NC_008384	CCG	2	6	645553	645558	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1538	NC_008384	CTG	2	6	648190	648195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1539	NC_008384	CGC	2	6	648259	648264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1540	NC_008384	CGG	2	6	648307	648312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_008384	GTT	2	6	649664	649669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1542	NC_008384	GGCCG	2	10	649724	649733	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1543	NC_008384	GCCG	2	8	649751	649758	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1544	NC_008384	TCTTG	2	10	650568	650577	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1545	NC_008384	TCG	2	6	650611	650616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_008384	GC	3	6	650664	650669	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1547	NC_008384	CT	3	6	650672	650677	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1548	NC_008384	GGA	2	6	650687	650692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_008384	TCC	2	6	650816	650821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_008384	GTG	2	6	650844	650849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_008384	AGG	2	6	650949	650954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_008384	GGA	2	6	651807	651812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_008384	T	6	6	652703	652708	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1554	NC_008384	GCAA	2	8	652762	652769	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1555	NC_008384	TTAT	2	8	652779	652786	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_008384	GTT	2	6	652798	652803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_008384	AGGCAT	2	12	653293	653304	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1558	NC_008384	ATCG	2	8	653319	653326	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1559	NC_008384	CTG	2	6	653638	653643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_008384	GGC	2	6	655760	655765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_008384	GGT	2	6	655799	655804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1562	NC_008384	TTGG	2	8	655836	655843	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_008384	TGC	2	6	655853	655858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_008384	GAAA	2	8	655871	655878	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_008384	TCA	2	6	658050	658055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_008384	TCGA	2	8	658167	658174	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1567	NC_008384	GCG	2	6	658187	658192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_008384	TGATG	2	10	658308	658317	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_008384	GTT	2	6	658356	658361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1570	NC_008384	ATG	2	6	659501	659506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_008384	GAA	2	6	659539	659544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1572	NC_008384	ACA	2	6	659604	659609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_008384	TCA	2	6	659623	659628	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_008384	CGC	2	6	659631	659636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1575	NC_008384	CGG	2	6	659879	659884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1576	NC_008384	T	7	7	659899	659905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_008384	AG	3	6	659913	659918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_008384	CGG	2	6	663308	663313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_008384	GAG	2	6	663316	663321	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_008384	CGA	2	6	666011	666016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1581	NC_008384	TGC	2	6	666053	666058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1582	NC_008384	GC	3	6	666080	666085	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1583	NC_008384	CTTTAG	2	12	666451	666462	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1584	NC_008384	TC	4	8	666495	666502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1585	NC_008384	CGG	2	6	666658	666663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1586	NC_008384	TGA	2	6	666708	666713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_008384	CTG	2	6	666719	666724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_008384	GGC	2	6	672115	672120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1589	NC_008384	TCC	2	6	673678	673683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1590	NC_008384	ATG	2	6	675947	675952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1591	NC_008384	CAT	2	6	675959	675964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1592	NC_008384	TC	3	6	675977	675982	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1593	NC_008384	GCCGGC	2	12	675993	676004	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1594	NC_008384	GGAT	2	8	676011	676018	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_008384	GCG	2	6	676020	676025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1596	NC_008384	AGG	2	6	676089	676094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_008384	GCC	2	6	676920	676925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1598	NC_008384	GGCCG	2	10	683207	683216	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1599	NC_008384	CGG	2	6	684032	684037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_008384	CGC	2	6	684058	684063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1601	NC_008384	TGT	2	6	684121	684126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1602	NC_008384	TGC	2	6	684127	684132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.