MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL11

Total Repeats: 1602

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008384	AGG	2	6	372417	372422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_008384	GAG	2	6	372493	372498	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_008384	TCG	2	6	374898	374903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_008384	CCCGAG	2	12	374941	374952	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
1005	NC_008384	CGT	2	6	375147	375152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_008384	CAA	2	6	375262	375267	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1007	NC_008384	CGCC	2	8	375356	375363	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1008	NC_008384	AT	3	6	376034	376039	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_008384	GCA	2	6	376071	376076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_008384	CGG	2	6	376125	376130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_008384	ATA	2	6	376170	376175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_008384	GCTGT	2	10	376180	376189	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1013	NC_008384	CTC	2	6	376226	376231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1014	NC_008384	GAT	2	6	376232	376237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_008384	TGG	2	6	376238	376243	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_008384	AGTTGC	2	12	379452	379463	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1017	NC_008384	TAT	2	6	379474	379479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_008384	GT	3	6	380019	380024	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_008384	CGT	2	6	380078	380083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_008384	AGG	2	6	380344	380349	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_008384	ATG	2	6	380382	380387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_008384	GGA	2	6	380457	380462	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_008384	GTT	3	9	380981	380989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_008384	GAAAT	2	10	381025	381034	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_008384	CG	3	6	381123	381128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_008384	ATC	2	6	381142	381147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_008384	AGC	2	6	381538	381543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_008384	GT	3	6	381603	381608	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_008384	CTT	2	6	381676	381681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_008384	TCG	2	6	381961	381966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_008384	CAGGG	2	10	381971	381980	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1032	NC_008384	GATT	2	8	382033	382040	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_008384	CGT	2	6	382102	382107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_008384	ATG	2	6	382151	382156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_008384	TC	3	6	382888	382893	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1036	NC_008384	CCG	2	6	382897	382902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1037	NC_008384	TC	3	6	384226	384231	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1038	NC_008384	CCT	2	6	384257	384262	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_008384	AGGA	2	8	384270	384277	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_008384	GGC	2	6	384333	384338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_008384	GCC	2	6	384382	384387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1042	NC_008384	CGA	2	6	384424	384429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_008384	CAT	2	6	384448	384453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_008384	ATA	2	6	384501	384506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1045	NC_008384	T	6	6	384545	384550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_008384	GTT	2	6	384598	384603	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1047	NC_008384	GAG	2	6	384615	384620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1048	NC_008384	GTT	2	6	384630	384635	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_008384	TTC	2	6	384649	384654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_008384	ATG	2	6	384658	384663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_008384	TCTCG	2	10	384678	384687	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1052	NC_008384	ACG	2	6	384703	384708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_008384	CGT	2	6	384720	384725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_008384	TTC	2	6	384993	384998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_008384	GCG	2	6	385006	385011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_008384	TCA	2	6	385813	385818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_008384	ACC	2	6	385868	385873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_008384	TCA	2	6	386247	386252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_008384	GT	3	6	386256	386261	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_008384	CCGG	2	8	386268	386275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1061	NC_008384	TGCGTC	2	12	386311	386322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_008384	TCG	2	6	386693	386698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_008384	GAGC	2	8	386776	386783	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1064	NC_008384	GGACGA	2	12	386866	386877	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1065	NC_008384	GAA	2	6	386889	386894	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_008384	TCCGA	2	10	387903	387912	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1067	NC_008384	GTT	2	6	387929	387934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_008384	ACG	2	6	387975	387980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_008384	TCA	2	6	387994	387999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_008384	CGA	2	6	388002	388007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_008384	CGA	2	6	388029	388034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_008384	GGC	2	6	388474	388479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_008384	CGA	2	6	388601	388606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_008384	AAAC	2	8	390246	390253	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_008384	ACCCC	2	10	390273	390282	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1076	NC_008384	GTT	2	6	390284	390289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_008384	TTA	2	6	390296	390301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_008384	TTC	2	6	390309	390314	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_008384	CCT	2	6	390359	390364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1080	NC_008384	AAC	2	6	390367	390372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1081	NC_008384	CGG	2	6	391310	391315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_008384	CAGC	2	8	391338	391345	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1083	NC_008384	AACA	2	8	391382	391389	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1084	NC_008384	TC	3	6	391404	391409	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1085	NC_008384	GA	4	8	393373	393380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_008384	CGG	3	9	394675	394683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_008384	GCC	3	9	394695	394703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_008384	T	6	6	394706	394711	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_008384	CGC	2	6	394734	394739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_008384	CGG	2	6	397598	397603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_008384	CAG	2	6	397642	397647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_008384	GAG	2	6	397652	397657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_008384	AGCG	2	8	398445	398452	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1094	NC_008384	CGTG	2	8	398490	398497	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1095	NC_008384	TGGAT	2	10	398507	398516	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1096	NC_008384	CCT	2	6	400694	400699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_008384	ACAA	2	8	400761	400768	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1098	NC_008384	CGG	2	6	400814	400819	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1099	NC_008384	CCT	2	6	400823	400828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_008384	GCA	2	6	400870	400875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_008384	TGC	2	6	400898	400903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_008384	CG	3	6	400915	400920	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_008384	CGC	2	6	400932	400937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1104	NC_008384	CCT	2	6	404759	404764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_008384	TTC	2	6	404812	404817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1106	NC_008384	CTGC	2	8	404913	404920	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_008384	T	7	7	404933	404939	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_008384	TCC	2	6	404949	404954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1109	NC_008384	TTAT	2	8	406176	406183	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_008384	GGGA	2	8	406697	406704	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_008384	GGGC	2	8	410139	410146	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1112	NC_008384	GGAA	2	8	410160	410167	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_008384	GGC	2	6	412965	412970	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_008384	GAG	2	6	412977	412982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_008384	CAT	2	6	412989	412994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_008384	GAT	2	6	413001	413006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_008384	GTC	2	6	413020	413025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_008384	GGA	2	6	413087	413092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_008384	GCT	2	6	414832	414837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1120	NC_008384	TCG	2	6	414968	414973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1121	NC_008384	CAT	2	6	415061	415066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_008384	TGT	2	6	415079	415084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_008384	TTG	2	6	415087	415092	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1124	NC_008384	AGACA	2	10	415098	415107	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1125	NC_008384	GCC	2	6	415122	415127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1126	NC_008384	GAT	2	6	415149	415154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_008384	TC	3	6	415163	415168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1128	NC_008384	GACG	2	8	415206	415213	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1129	NC_008384	TA	3	6	415224	415229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_008384	GCT	2	6	415297	415302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1131	NC_008384	TTG	2	6	415345	415350	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_008384	GTC	2	6	415401	415406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_008384	GCGTC	2	10	419035	419044	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1134	NC_008384	ATGC	2	8	419083	419090	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1135	NC_008384	GGC	2	6	419120	419125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_008384	CTC	2	6	420327	420332	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1139	NC_008384	CGAT	2	8	420465	420472	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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1142	NC_008384	TCA	2	6	421848	421853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1168	NC_008384	GAG	2	6	434460	434465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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1250	NC_008384	GTG	2	6	489293	489298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1251	NC_008384	TG	3	6	489320	489325	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1252	NC_008384	CCG	2	6	489344	489349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1253	NC_008384	GATC	2	8	489380	489387	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1254	NC_008384	CCG	2	6	490998	491003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1255	NC_008384	TCT	2	6	491017	491022	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1257	NC_008384	GCA	2	6	491028	491033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1258	NC_008384	CCG	2	6	492870	492875	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1259	NC_008384	T	6	6	493470	493475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1260	NC_008384	CCG	2	6	494698	494703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1261	NC_008384	GAA	2	6	497900	497905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1262	NC_008384	CGG	2	6	498598	498603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1263	NC_008384	CGA	2	6	498628	498633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1264	NC_008384	GCG	2	6	498657	498662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1265	NC_008384	TA	3	6	500819	500824	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1266	NC_008384	TGA	2	6	500947	500952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1267	NC_008384	GAC	2	6	500953	500958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1269	NC_008384	TATT	2	8	501092	501099	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1405	NC_008384	GCC	2	6	578360	578365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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