MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 13401

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008380	CTGA	2	8	1553825	1553832	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4002	NC_008380	TGT	2	6	1555820	1555825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_008380	TGCC	2	8	1555834	1555841	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4004	NC_008380	GCA	2	6	1555895	1555900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_008380	GCC	2	6	1555916	1555921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4006	NC_008380	TCGCAG	2	12	1555953	1555964	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_008380	GCA	2	6	1555965	1555970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_008380	TCT	2	6	1555978	1555983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_008380	TCC	2	6	1555995	1556000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4010	NC_008380	ATC	2	6	1556035	1556040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_008380	TCC	2	6	1557210	1557215	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_008380	TGGA	2	8	1557225	1557232	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_008380	ATT	2	6	1557269	1557274	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4014	NC_008380	C	7	7	1558124	1558130	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4015	NC_008380	GCC	2	6	1558141	1558146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4016	NC_008380	GCCGC	2	10	1558175	1558184	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4017	NC_008380	GGA	2	6	1559279	1559284	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4018	NC_008380	CTC	2	6	1559294	1559299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4019	NC_008380	CT	3	6	1561250	1561255	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4020	NC_008380	CGC	2	6	1561263	1561268	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4021	NC_008380	TCC	2	6	1561275	1561280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_008380	C	6	6	1561327	1561332	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4023	NC_008380	TCC	2	6	1563310	1563315	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_008380	AAT	2	6	1563355	1563360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4025	NC_008380	CG	3	6	1564455	1564460	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4026	NC_008380	GGA	2	6	1564468	1564473	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_008380	CTT	2	6	1566908	1566913	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_008380	TTTG	2	8	1566968	1566975	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_008380	TCT	2	6	1567007	1567012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_008380	A	6	6	1567024	1567029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_008380	TCT	2	6	1567150	1567155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_008380	GC	3	6	1567176	1567181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4033	NC_008380	A	6	6	1567240	1567245	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_008380	TC	3	6	1567246	1567251	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4035	NC_008380	GA	3	6	1567262	1567267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_008380	A	6	6	1567386	1567391	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_008380	TTG	2	6	1567429	1567434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_008380	C	6	6	1567551	1567556	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4039	NC_008380	CTT	2	6	1567635	1567640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_008380	GCT	2	6	1567666	1567671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_008380	GTT	2	6	1568815	1568820	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_008380	CCGA	2	8	1568825	1568832	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4043	NC_008380	GCTT	2	8	1569771	1569778	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4044	NC_008380	GCG	2	6	1571803	1571808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_008380	CGG	2	6	1571827	1571832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_008380	TTC	2	6	1571868	1571873	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_008380	ACCTT	2	10	1571932	1571941	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4048	NC_008380	ATTC	2	8	1571952	1571959	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4049	NC_008380	GC	3	6	1571996	1572001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4050	NC_008380	GAT	2	6	1572009	1572014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_008380	GAG	2	6	1572078	1572083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_008380	TC	3	6	1573003	1573008	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4053	NC_008380	A	6	6	1573054	1573059	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_008380	CAGC	2	8	1573090	1573097	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4055	NC_008380	TCG	2	6	1573588	1573593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_008380	GAT	2	6	1573611	1573616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_008380	GA	3	6	1573618	1573623	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_008380	CCAAT	2	10	1574212	1574221	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
4059	NC_008380	ATT	2	6	1574306	1574311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_008380	AT	3	6	1574313	1574318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_008380	TTAGC	2	10	1574390	1574399	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4062	NC_008380	GAC	2	6	1574482	1574487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_008380	GC	3	6	1574908	1574913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4064	NC_008380	CGA	2	6	1574979	1574984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_008380	ATT	2	6	1575024	1575029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_008380	TG	3	6	1575035	1575040	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_008380	GC	3	6	1575057	1575062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4068	NC_008380	TTTTAT	2	12	1575063	1575074	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_008380	GCG	2	6	1577382	1577387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_008380	GCG	2	6	1577435	1577440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_008380	TCT	2	6	1577467	1577472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_008380	AGA	2	6	1577491	1577496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_008380	GAA	2	6	1577720	1577725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_008380	CTC	2	6	1577727	1577732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4075	NC_008380	TGG	2	6	1577790	1577795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_008380	TGCAC	2	10	1577798	1577807	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4077	NC_008380	TCG	2	6	1578908	1578913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_008380	GAT	2	6	1578963	1578968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_008380	GGCC	2	8	1578977	1578984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4080	NC_008380	ATG	2	6	1579023	1579028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4081	NC_008380	CAT	2	6	1579057	1579062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_008380	AG	3	6	1579068	1579073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4083	NC_008380	AGAA	2	8	1579080	1579087	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4084	NC_008380	GCC	2	6	1579092	1579097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4085	NC_008380	GCG	2	6	1579098	1579103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_008380	TCG	2	6	1581547	1581552	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_008380	A	6	6	1581581	1581586	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_008380	GC	3	6	1581638	1581643	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4089	NC_008380	AGC	2	6	1582540	1582545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_008380	T	6	6	1582557	1582562	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_008380	AGC	2	6	1582574	1582579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_008380	CGT	2	6	1582598	1582603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_008380	TCC	2	6	1582607	1582612	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4094	NC_008380	TTGCA	2	10	1583154	1583163	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
4095	NC_008380	GAT	2	6	1583217	1583222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_008380	CTT	2	6	1583239	1583244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_008380	T	6	6	1584025	1584030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_008380	TCC	2	6	1584045	1584050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4099	NC_008380	CCT	2	6	1584080	1584085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4100	NC_008380	AGG	2	6	1584110	1584115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_008380	GAT	2	6	1585131	1585136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_008380	ATG	2	6	1585192	1585197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4103	NC_008380	CAT	2	6	1585226	1585231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_008380	CGGA	2	8	1585298	1585305	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4105	NC_008380	CGA	2	6	1586929	1586934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_008380	ATG	2	6	1586969	1586974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_008380	CAT	2	6	1587003	1587008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_008380	TA	3	6	1587017	1587022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4109	NC_008380	ATC	2	6	1587064	1587069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4110	NC_008380	GCT	2	6	1589030	1589035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_008380	ACGT	2	8	1589068	1589075	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4112	NC_008380	CAT	2	6	1589077	1589082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_008380	TGG	2	6	1589146	1589151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_008380	CGGC	2	8	1589269	1589276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4115	NC_008380	GGC	2	6	1589284	1589289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_008380	ATC	2	6	1589325	1589330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4117	NC_008380	AAC	2	6	1589345	1589350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_008380	ACC	2	6	1589379	1589384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4119	NC_008380	ACC	2	6	1589425	1589430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4120	NC_008380	GCCG	2	8	1589831	1589838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4121	NC_008380	AAT	2	6	1589890	1589895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_008380	CG	3	6	1589947	1589952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4123	NC_008380	CGGA	2	8	1590004	1590011	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4124	NC_008380	ATCGG	2	10	1590558	1590567	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
4125	NC_008380	GCA	2	6	1590584	1590589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_008380	ACG	2	6	1590603	1590608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_008380	GTT	2	6	1591545	1591550	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4128	NC_008380	T	6	6	1594713	1594718	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_008380	AAC	2	6	1594751	1594756	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4131	NC_008380	CAA	2	6	1595263	1595268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4262	NC_008380	GCG	3	9	1666608	1666616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4263	NC_008380	CGT	2	6	1668480	1668485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4378	NC_008380	AGC	2	6	1717798	1717803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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