MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 13401

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_008380	TGA	2	6	2994584	2994589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8002	NC_008380	GCC	2	6	2994745	2994750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8003	NC_008380	CCTA	2	8	2994793	2994800	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8004	NC_008380	CCG	2	6	2994848	2994853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8005	NC_008380	CGC	2	6	2994860	2994865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8006	NC_008380	CAA	3	9	2998052	2998060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8007	NC_008380	CGA	2	6	2998077	2998082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_008380	TCG	2	6	2998914	2998919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8009	NC_008380	CGT	2	6	2998934	2998939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8010	NC_008380	ACG	2	6	2998984	2998989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8011	NC_008380	GGC	2	6	3000530	3000535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8012	NC_008380	CTTGG	2	10	3000551	3000560	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8013	NC_008380	GCG	2	6	3000724	3000729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8014	NC_008380	TGC	2	6	3000735	3000740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8015	NC_008380	T	6	6	3000813	3000818	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8016	NC_008380	TTC	2	6	3000914	3000919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8017	NC_008380	AAT	2	6	3000926	3000931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_008380	AGA	2	6	3000952	3000957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8019	NC_008380	GCGA	2	8	3000970	3000977	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8020	NC_008380	TTG	2	6	3001005	3001010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8021	NC_008380	GGCA	2	8	3001057	3001064	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8022	NC_008380	GA	3	6	3001083	3001088	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8023	NC_008380	CTG	2	6	3001110	3001115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8024	NC_008380	AAG	2	6	3001127	3001132	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8025	NC_008380	GAT	2	6	3002528	3002533	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8026	NC_008380	AGC	2	6	3002585	3002590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8027	NC_008380	TCA	2	6	3002598	3002603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_008380	CTT	2	6	3002604	3002609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8029	NC_008380	CGCGG	2	10	3002610	3002619	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8030	NC_008380	CGGC	2	8	3002629	3002636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8031	NC_008380	GAA	2	6	3002701	3002706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8032	NC_008380	AAG	2	6	3002712	3002717	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8033	NC_008380	GTC	2	6	3002749	3002754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8034	NC_008380	CG	3	6	3002867	3002872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8035	NC_008380	TTTG	2	8	3003868	3003875	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
8036	NC_008380	ACC	2	6	3003891	3003896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8037	NC_008380	GCA	2	6	3003922	3003927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_008380	AGG	2	6	3003929	3003934	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_008380	GCG	2	6	3003997	3004002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8040	NC_008380	CCA	2	6	3004049	3004054	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8041	NC_008380	CTG	2	6	3004058	3004063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8042	NC_008380	CG	3	6	3004106	3004111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8043	NC_008380	CG	3	6	3004168	3004173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8044	NC_008380	GAT	2	6	3004188	3004193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8045	NC_008380	CAA	2	6	3004234	3004239	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8046	NC_008380	TCA	2	6	3004245	3004250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8047	NC_008380	CCGGC	2	10	3007664	3007673	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
8048	NC_008380	TCC	2	6	3008845	3008850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8049	NC_008380	CCA	2	6	3008880	3008885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8050	NC_008380	CCG	2	6	3008944	3008949	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8051	NC_008380	GGC	2	6	3008958	3008963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8052	NC_008380	TTC	2	6	3009837	3009842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8053	NC_008380	CGG	2	6	3009853	3009858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8054	NC_008380	ACG	2	6	3009872	3009877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8055	NC_008380	ATG	2	6	3009888	3009893	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8056	NC_008380	CTC	2	6	3012726	3012731	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8057	NC_008380	CCT	3	9	3012744	3012752	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8058	NC_008380	GCC	2	6	3012753	3012758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8059	NC_008380	TGA	2	6	3012785	3012790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8060	NC_008380	TCC	2	6	3012822	3012827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8061	NC_008380	CAT	2	6	3012838	3012843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8062	NC_008380	TCCT	2	8	3013781	3013788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8063	NC_008380	CCGG	2	8	3013907	3013914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8064	NC_008380	GCCG	2	8	3013944	3013951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8065	NC_008380	GGC	2	6	3013960	3013965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8066	NC_008380	TCC	2	6	3014951	3014956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8067	NC_008380	CGA	2	6	3014957	3014962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8068	NC_008380	CG	3	6	3014985	3014990	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8069	NC_008380	TCA	2	6	3015022	3015027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8071	NC_008380	TC	3	6	3017752	3017757	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8072	NC_008380	TCCT	2	8	3018511	3018518	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8073	NC_008380	TCT	2	6	3018600	3018605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8074	NC_008380	GATC	2	8	3018704	3018711	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8075	NC_008380	GCA	2	6	3022622	3022627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8077	NC_008380	ATAA	2	8	3023065	3023072	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8078	NC_008380	GTC	2	6	3023795	3023800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8079	NC_008380	CGG	2	6	3023855	3023860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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8081	NC_008380	CTT	2	6	3024101	3024106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8082	NC_008380	TG	3	6	3024121	3024126	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8083	NC_008380	CG	3	6	3024128	3024133	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8084	NC_008380	CGA	2	6	3024154	3024159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8086	NC_008380	CTGCT	2	10	3024216	3024225	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
8087	NC_008380	ACC	2	6	3024231	3024236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8088	NC_008380	CTGG	2	8	3024254	3024261	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8089	NC_008380	GGCG	2	8	3024305	3024312	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8090	NC_008380	CAT	2	6	3024323	3024328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8096	NC_008380	CAT	2	6	3024668	3024673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8098	NC_008380	TCC	2	6	3025697	3025702	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8099	NC_008380	TCC	2	6	3027125	3027130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8100	NC_008380	GT	3	6	3027146	3027151	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8101	NC_008380	TCC	3	9	3027187	3027195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8102	NC_008380	GGA	3	9	3027200	3027208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8103	NC_008380	TGC	2	6	3028111	3028116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8105	NC_008380	G	7	7	3028221	3028227	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8106	NC_008380	G	8	8	3030813	3030820	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
8107	NC_008380	CGC	3	9	3030822	3030830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8108	NC_008380	AGG	2	6	3030837	3030842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8109	NC_008380	CAG	2	6	3030860	3030865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8110	NC_008380	ATCA	2	8	3030889	3030896	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8111	NC_008380	GT	3	6	3030903	3030908	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8112	NC_008380	GAT	2	6	3030909	3030914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8113	NC_008380	CCAT	2	8	3030915	3030922	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8114	NC_008380	CTGT	2	8	3030934	3030941	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
8115	NC_008380	TTC	2	6	3030956	3030961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8116	NC_008380	GGCG	2	8	3030993	3031000	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
8117	NC_008380	AATC	2	8	3031163	3031170	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8118	NC_008380	CCTTC	2	10	3031246	3031255	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
8119	NC_008380	GCA	2	6	3031276	3031281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8120	NC_008380	CGA	2	6	3031284	3031289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8123	NC_008380	TCG	2	6	3031388	3031393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8124	NC_008380	AGG	2	6	3031410	3031415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8125	NC_008380	GGC	2	6	3031963	3031968	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8126	NC_008380	TCC	2	6	3031972	3031977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8127	NC_008380	CGTTT	2	10	3034446	3034455	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
8128	NC_008380	GCC	2	6	3034557	3034562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8129	NC_008380	CGCA	2	8	3034571	3034578	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8130	NC_008380	GAC	2	6	3034901	3034906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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8132	NC_008380	CATCT	2	10	3036846	3036855	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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8143	NC_008380	GC	3	6	3041956	3041961	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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