MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 chromosome

Total Repeats: 13401

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_008380	AT	3	6	2615967	2615972	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_008380	TCGG	2	8	2615993	2616000	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
7003	NC_008380	AGA	2	6	2616009	2616014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7004	NC_008380	CCG	2	6	2616025	2616030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7005	NC_008380	TCTCA	2	10	2616090	2616099	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
7006	NC_008380	CT	3	6	2617309	2617314	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7007	NC_008380	TGC	2	6	2617352	2617357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7008	NC_008380	GCT	2	6	2617371	2617376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7009	NC_008380	GCT	2	6	2617383	2617388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7010	NC_008380	AGCC	2	8	2617393	2617400	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7011	NC_008380	ACCGT	2	10	2617541	2617550	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7012	NC_008380	TTG	2	6	2617590	2617595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7013	NC_008380	CG	3	6	2617612	2617617	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7014	NC_008380	TGG	2	6	2617667	2617672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7015	NC_008380	GGC	2	6	2617676	2617681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_008380	TTG	2	6	2617686	2617691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_008380	GGTT	2	8	2617700	2617707	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_008380	TAA	2	6	2618070	2618075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_008380	CCGG	2	8	2618118	2618125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7020	NC_008380	CGC	2	6	2618128	2618133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7021	NC_008380	GTG	2	6	2618148	2618153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_008380	CGC	2	6	2618178	2618183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7023	NC_008380	CTC	2	6	2618240	2618245	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7024	NC_008380	CGA	2	6	2618254	2618259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7025	NC_008380	GAT	2	6	2618263	2618268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_008380	GCA	2	6	2618275	2618280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7027	NC_008380	GGC	2	6	2618318	2618323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7028	NC_008380	ACGTC	2	10	2618330	2618339	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
7029	NC_008380	GC	3	6	2618378	2618383	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7030	NC_008380	AGC	2	6	2618402	2618407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7031	NC_008380	TTA	2	6	2618431	2618436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7032	NC_008380	GGC	2	6	2618522	2618527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7033	NC_008380	CAA	2	6	2618529	2618534	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7034	NC_008380	GGC	2	6	2619297	2619302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7035	NC_008380	CGATGT	2	12	2619375	2619386	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7036	NC_008380	AGA	2	6	2619443	2619448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7037	NC_008380	GCG	2	6	2619452	2619457	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7038	NC_008380	ATC	2	6	2619463	2619468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7039	NC_008380	GGAT	2	8	2619570	2619577	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7040	NC_008380	TCGC	2	8	2619596	2619603	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7041	NC_008380	TTCA	2	8	2621136	2621143	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7042	NC_008380	TGC	2	6	2622425	2622430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7043	NC_008380	GTT	2	6	2622442	2622447	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7044	NC_008380	GCC	2	6	2622461	2622466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7045	NC_008380	CGGC	2	8	2623394	2623401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7046	NC_008380	GCC	2	6	2624314	2624319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7047	NC_008380	TGC	2	6	2624337	2624342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7048	NC_008380	GGC	2	6	2624348	2624353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7049	NC_008380	CGC	2	6	2624356	2624361	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7050	NC_008380	CTC	2	6	2624364	2624369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7051	NC_008380	ATC	2	6	2624497	2624502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7052	NC_008380	CTG	2	6	2624521	2624526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7053	NC_008380	GCTC	2	8	2624534	2624541	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7054	NC_008380	ATT	2	6	2624563	2624568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_008380	CGATT	2	10	2624625	2624634	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
7056	NC_008380	TTA	2	6	2624712	2624717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_008380	T	6	6	2624783	2624788	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_008380	CTT	2	6	2624807	2624812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7059	NC_008380	GCCG	2	8	2624816	2624823	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7060	NC_008380	GCTT	2	8	2624858	2624865	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7061	NC_008380	CTT	2	6	2624876	2624881	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7062	NC_008380	CAG	2	6	2624918	2624923	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7063	NC_008380	GGCGAT	2	12	2624933	2624944	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
7064	NC_008380	ATC	2	6	2624983	2624988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7065	NC_008380	TTC	2	6	2625005	2625010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7066	NC_008380	AATC	2	8	2625016	2625023	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7067	NC_008380	CGC	2	6	2625126	2625131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7068	NC_008380	TCCT	2	8	2625148	2625155	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7069	NC_008380	GC	3	6	2625217	2625222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7070	NC_008380	GA	3	6	2625277	2625282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7071	NC_008380	AGC	2	6	2625284	2625289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7072	NC_008380	CGA	2	6	2625304	2625309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7073	NC_008380	CAA	2	6	2625337	2625342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7074	NC_008380	TTG	2	6	2625449	2625454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7075	NC_008380	TCCG	2	8	2625458	2625465	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
7076	NC_008380	CTG	2	6	2625561	2625566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7077	NC_008380	TGC	2	6	2625575	2625580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7078	NC_008380	TGC	2	6	2625607	2625612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7079	NC_008380	TTCGT	3	15	2625672	2625686	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
7080	NC_008380	AGG	2	6	2625709	2625714	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7081	NC_008380	TTC	2	6	2626076	2626081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7082	NC_008380	GGC	2	6	2626417	2626422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7083	NC_008380	CCG	2	6	2626433	2626438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7084	NC_008380	CGC	2	6	2626455	2626460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7085	NC_008380	GCC	2	6	2626464	2626469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7086	NC_008380	GCC	2	6	2626481	2626486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7087	NC_008380	CG	3	6	2626500	2626505	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7088	NC_008380	GTTT	2	8	2626529	2626536	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7089	NC_008380	CCGC	2	8	2626554	2626561	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7090	NC_008380	GC	3	6	2626560	2626565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7091	NC_008380	GCC	2	6	2632785	2632790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7092	NC_008380	AAT	2	6	2632835	2632840	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7093	NC_008380	TGA	2	6	2632884	2632889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7094	NC_008380	GGCA	2	8	2632949	2632956	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7095	NC_008380	CTG	2	6	2632973	2632978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7096	NC_008380	CAT	2	6	2633049	2633054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7097	NC_008380	CAAC	2	8	2633102	2633109	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7098	NC_008380	CGA	2	6	2633139	2633144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7099	NC_008380	GC	4	8	2633199	2633206	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7100	NC_008380	GAA	2	6	2633248	2633253	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_008380	CGAT	2	8	2633662	2633669	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7102	NC_008380	ATC	2	6	2633688	2633693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7103	NC_008380	GCC	2	6	2633748	2633753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7104	NC_008380	CGT	2	6	2633761	2633766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7105	NC_008380	GCC	2	6	2633791	2633796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7106	NC_008380	TCA	2	6	2633845	2633850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7107	NC_008380	GGC	2	6	2633865	2633870	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7108	NC_008380	CGTCGC	2	12	2633876	2633887	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
7109	NC_008380	CGC	2	6	2636746	2636751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7110	NC_008380	CG	3	6	2636838	2636843	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7111	NC_008380	TCA	2	6	2636846	2636851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7112	NC_008380	CAGG	2	8	2636862	2636869	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7113	NC_008380	TC	4	8	2637851	2637858	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7114	NC_008380	AG	3	6	2637947	2637952	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7115	NC_008380	CA	3	6	2639137	2639142	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7116	NC_008380	CCTC	2	8	2640470	2640477	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7117	NC_008380	CCG	2	6	2640499	2640504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7118	NC_008380	TGC	2	6	2642517	2642522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7119	NC_008380	AGCC	2	8	2642534	2642541	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7120	NC_008380	AGC	3	9	2644404	2644412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7121	NC_008380	CAG	2	6	2644424	2644429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7122	NC_008380	GAT	2	6	2644432	2644437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_008380	TCT	2	6	2645019	2645024	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7124	NC_008380	TCT	2	6	2645034	2645039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7125	NC_008380	A	6	6	2645083	2645088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_008380	CGG	2	6	2645107	2645112	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7127	NC_008380	CGG	2	6	2647447	2647452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7128	NC_008380	GCC	2	6	2647464	2647469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7130	NC_008380	CCA	2	6	2649680	2649685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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