MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhizobium leguminosarum bv. viciae 3841 plasmid pRL12

Total Repeats: 1646

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008378	GAAAT	2	10	759445	759454	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1502	NC_008378	CGC	3	9	759507	759515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1503	NC_008378	AT	3	6	760407	760412	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_008378	GC	4	8	761504	761511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1505	NC_008378	TC	3	6	761610	761615	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1506	NC_008378	AGG	2	6	761620	761625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_008378	AT	3	6	762504	762509	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_008378	CCTG	2	8	762561	762568	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1509	NC_008378	AGAC	2	8	762623	762630	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1510	NC_008378	CGA	2	6	762659	762664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_008378	CG	3	6	762675	762680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1512	NC_008378	CGA	2	6	762747	762752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_008378	GAC	2	6	762822	762827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1514	NC_008378	ACG	2	6	762861	762866	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1515	NC_008378	TC	3	6	762900	762905	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1516	NC_008378	GGGC	2	8	763759	763766	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1517	NC_008378	ATTC	2	8	765531	765538	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1518	NC_008378	CG	3	6	774910	774915	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1519	NC_008378	GAC	2	6	774959	774964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1520	NC_008378	GAA	2	6	777818	777823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_008378	GCC	2	6	777849	777854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1522	NC_008378	CAAA	2	8	777887	777894	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
1523	NC_008378	GCG	2	6	777923	777928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1524	NC_008378	CAT	2	6	777941	777946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_008378	GCA	2	6	777957	777962	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1526	NC_008378	CTC	2	6	779231	779236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1527	NC_008378	TGGTG	2	10	779284	779293	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1528	NC_008378	CGGC	2	8	779316	779323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_008378	TGC	2	6	779752	779757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1530	NC_008378	GGCA	2	8	780246	780253	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1531	NC_008378	TCG	2	6	780415	780420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_008378	GT	3	6	788446	788451	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_008378	CGG	2	6	789146	789151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1534	NC_008378	TCA	2	6	792944	792949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_008378	CTT	2	6	793304	793309	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1536	NC_008378	TCAACG	2	12	793826	793837	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_008378	CGGC	2	8	794331	794338	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1538	NC_008378	ATG	2	6	794379	794384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_008378	CCGC	2	8	794396	794403	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1540	NC_008378	AGGA	2	8	794428	794435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_008378	GCA	2	6	795264	795269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_008378	T	6	6	795328	795333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1543	NC_008378	GTGC	2	8	795612	795619	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1544	NC_008378	CGC	2	6	795629	795634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1545	NC_008378	ACA	2	6	797288	797293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_008378	CGG	2	6	797316	797321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_008378	TAC	2	6	797353	797358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1548	NC_008378	GCT	2	6	797361	797366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1549	NC_008378	GTT	2	6	798493	798498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1550	NC_008378	GAC	2	6	798499	798504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_008378	TGT	2	6	798529	798534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_008378	GGCAG	2	10	798596	798605	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
1553	NC_008378	GAC	2	6	798606	798611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1554	NC_008378	ACG	2	6	798650	798655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1555	NC_008378	CGC	2	6	799484	799489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1556	NC_008378	GCC	2	6	799492	799497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1557	NC_008378	GGCG	2	8	799505	799512	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1558	NC_008378	CGG	2	6	799534	799539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_008378	GTC	2	6	801139	801144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1560	NC_008378	AAC	2	6	802399	802404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1561	NC_008378	GTC	2	6	802926	802931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_008378	GAT	2	6	803729	803734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_008378	GTG	2	6	806274	806279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1564	NC_008378	CAG	2	6	808181	808186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1565	NC_008378	GAT	2	6	809223	809228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1566	NC_008378	ACC	2	6	809241	809246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_008378	TA	3	6	811383	811388	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1568	NC_008378	AAG	2	6	816905	816910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_008378	TGGCG	2	10	817924	817933	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1570	NC_008378	TCCG	2	8	817959	817966	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_008378	CAG	2	6	817969	817974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1572	NC_008378	CCA	2	6	822104	822109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1573	NC_008378	CATG	2	8	822173	822180	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1574	NC_008378	GATG	2	8	822222	822229	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_008378	AT	3	6	822238	822243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_008378	GAG	2	6	822307	822312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_008378	ATC	2	6	822332	822337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1578	NC_008378	GCC	2	6	822353	822358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1579	NC_008378	GAG	2	6	822385	822390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_008378	GAG	3	9	823479	823487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1581	NC_008378	TGA	2	6	833838	833843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_008378	CTC	2	6	833845	833850	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1583	NC_008378	CGT	2	6	833931	833936	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_008378	GCA	2	6	834058	834063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1585	NC_008378	CGCGC	2	10	834100	834109	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1586	NC_008378	TGA	3	9	834144	834152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_008378	GAT	2	6	835099	835104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1588	NC_008378	GC	3	6	835146	835151	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1589	NC_008378	CAA	2	6	835159	835164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1590	NC_008378	CACG	2	8	835186	835193	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1591	NC_008378	GCCG	2	8	835259	835266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_008378	CGC	2	6	835320	835325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1593	NC_008378	TGC	2	6	835338	835343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1594	NC_008378	G	6	6	836506	836511	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_008378	GGTG	2	8	836536	836543	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_008378	GAT	2	6	837275	837280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1597	NC_008378	AATGC	2	10	837289	837298	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1598	NC_008378	CAC	2	6	840426	840431	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1599	NC_008378	GCT	2	6	840508	840513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_008378	CCAAG	2	10	840518	840527	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1601	NC_008378	GCC	2	6	840535	840540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1602	NC_008378	CAGG	2	8	841407	841414	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1603	NC_008378	TGT	2	6	846671	846676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_008378	CCG	2	6	847674	847679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1605	NC_008378	ATG	2	6	850249	850254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_008378	GCG	2	6	850261	850266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_008378	CTG	2	6	850298	850303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1608	NC_008378	GCA	2	6	850338	850343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1609	NC_008378	GAG	2	6	850420	850425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_008378	GTCGG	2	10	850435	850444	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1611	NC_008378	CGC	2	6	850450	850455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1612	NC_008378	GGA	2	6	850490	850495	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_008378	CTTT	2	8	852474	852481	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1614	NC_008378	CCG	2	6	852516	852521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1615	NC_008378	GGC	2	6	852535	852540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_008378	GCC	2	6	858845	858850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1617	NC_008378	ATTTA	2	10	858941	858950	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_008378	ATC	2	6	858986	858991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_008378	AAG	2	6	859613	859618	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_008378	GCC	2	6	860325	860330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1621	NC_008378	CGTT	2	8	860334	860341	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1622	NC_008378	TCC	2	6	860363	860368	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1623	NC_008378	GTTCC	2	10	860374	860383	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1624	NC_008378	AGG	2	6	860437	860442	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_008378	G	7	7	860478	860484	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_008378	GCT	2	6	860613	860618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_008378	GC	3	6	861192	861197	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1628	NC_008378	AG	3	6	866621	866626	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_008378	GCA	2	6	866652	866657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1630	NC_008378	CGC	2	6	866707	866712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1631	NC_008378	ACG	2	6	866777	866782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_008378	AGA	2	6	866927	866932	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_008378	GCA	2	6	866936	866941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_008378	CCGG	2	8	867724	867731	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1635	NC_008378	CCT	2	6	867840	867845	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1636	NC_008378	GGC	2	6	867854	867859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1637	NC_008378	AAT	2	6	867866	867871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1638	NC_008378	GAGC	2	8	867872	867879	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1639	NC_008378	CATT	2	8	868190	868197	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
1640	NC_008378	GCC	2	6	868253	868258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1641	NC_008378	CGG	2	6	868271	868276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1642	NC_008378	TCA	2	6	868333	868338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1643	NC_008378	GCA	2	6	868409	868414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1645	NC_008378	TA	3	6	869786	869791	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1646	NC_008378	GCC	2	6	869893	869898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding

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