MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 plasmid pRHL1

Total Repeats: 4335

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008269	GTG	2	6	1027890	1027895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_008269	GT	3	6	1027904	1027909	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_008269	GT	3	6	1027916	1027921	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_008269	CGGT	2	8	1028921	1028928	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4005	NC_008269	GGC	3	9	1029161	1029169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_008269	GAT	2	6	1029189	1029194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4007	NC_008269	CGA	2	6	1029200	1029205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_008269	TGC	2	6	1029230	1029235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_008269	CCGAGC	2	12	1031239	1031250	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4010	NC_008269	CG	3	6	1031256	1031261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4011	NC_008269	GCG	2	6	1031278	1031283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4012	NC_008269	TCC	2	6	1031350	1031355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4013	NC_008269	TCC	2	6	1031380	1031385	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_008269	CCT	2	6	1031888	1031893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4015	NC_008269	GAC	2	6	1031921	1031926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_008269	GAA	2	6	1031935	1031940	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_008269	AC	3	6	1031949	1031954	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4018	NC_008269	CCAT	2	8	1031961	1031968	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4019	NC_008269	CTG	2	6	1031972	1031977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_008269	TTGC	2	8	1031998	1032005	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4021	NC_008269	CGA	2	6	1032442	1032447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_008269	GGT	2	6	1032905	1032910	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_008269	TACC	2	8	1033080	1033087	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4024	NC_008269	GGC	2	6	1033140	1033145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_008269	GT	3	6	1033161	1033166	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_008269	GAA	2	6	1033192	1033197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_008269	G	6	6	1033209	1033214	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4028	NC_008269	GTAG	2	8	1033275	1033282	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4029	NC_008269	GA	3	6	1033365	1033370	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4030	NC_008269	CTG	2	6	1033413	1033418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_008269	TCA	2	6	1033465	1033470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_008269	TGG	2	6	1033483	1033488	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_008269	CG	3	6	1033639	1033644	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4034	NC_008269	GCGG	2	8	1034009	1034016	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4035	NC_008269	GCT	2	6	1034075	1034080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_008269	GCC	2	6	1034099	1034104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4037	NC_008269	GC	3	6	1034115	1034120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4038	NC_008269	CCG	2	6	1034141	1034146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4039	NC_008269	CCGG	2	8	1034161	1034168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4040	NC_008269	ACA	2	6	1034184	1034189	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_008269	CGC	2	6	1034196	1034201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4042	NC_008269	CG	3	6	1034214	1034219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4043	NC_008269	TCGGC	2	10	1035033	1035042	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4044	NC_008269	CGC	2	6	1035964	1035969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4045	NC_008269	GCTC	2	8	1036042	1036049	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4046	NC_008269	GGC	2	6	1036072	1036077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_008269	AAGT	2	8	1036087	1036094	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_008269	TCGG	2	8	1036237	1036244	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4049	NC_008269	GAT	2	6	1036246	1036251	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4050	NC_008269	GTG	2	6	1036255	1036260	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_008269	CGG	2	6	1036290	1036295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_008269	GTGCG	2	10	1036403	1036412	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
4053	NC_008269	GCGG	2	8	1036481	1036488	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4054	NC_008269	GAG	2	6	1036489	1036494	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_008269	TCG	2	6	1036559	1036564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4056	NC_008269	TGCCG	2	10	1036603	1036612	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4057	NC_008269	CGC	2	6	1036731	1036736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4058	NC_008269	CCT	2	6	1036756	1036761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4059	NC_008269	CGG	2	6	1037693	1037698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_008269	GCG	2	6	1037714	1037719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4061	NC_008269	CAG	2	6	1041560	1041565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_008269	GC	3	6	1041647	1041652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4063	NC_008269	GTC	3	9	1041668	1041676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_008269	TGC	2	6	1041732	1041737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_008269	CG	3	6	1041746	1041751	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4066	NC_008269	GA	3	6	1041765	1041770	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_008269	TGG	2	6	1042842	1042847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_008269	TC	3	6	1042867	1042872	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4069	NC_008269	GCT	2	6	1042875	1042880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_008269	GGC	2	6	1042884	1042889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_008269	GTTC	2	8	1044780	1044787	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4072	NC_008269	GGT	2	6	1044796	1044801	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_008269	GAAG	2	8	1045354	1045361	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4074	NC_008269	GC	4	8	1045673	1045680	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4075	NC_008269	CGT	2	6	1045718	1045723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_008269	CCCG	2	8	1045766	1045773	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4077	NC_008269	CTG	2	6	1045781	1045786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_008269	CCG	2	6	1045815	1045820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4079	NC_008269	CG	3	6	1045863	1045868	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4080	NC_008269	AAC	2	6	1045907	1045912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_008269	GGC	2	6	1047559	1047564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_008269	TGC	2	6	1048967	1048972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_008269	CCT	2	6	1050293	1050298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4084	NC_008269	ACTC	2	8	1050318	1050325	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4085	NC_008269	TG	3	6	1050326	1050331	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_008269	CAG	2	6	1050367	1050372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4087	NC_008269	GTG	2	6	1050482	1050487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_008269	TCGA	2	8	1050518	1050525	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4089	NC_008269	GC	3	6	1050562	1050567	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4090	NC_008269	GTG	2	6	1050620	1050625	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_008269	GCC	2	6	1050643	1050648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4092	NC_008269	GCG	2	6	1051700	1051705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_008269	CAC	2	6	1051727	1051732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4094	NC_008269	GGC	2	6	1051733	1051738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_008269	GC	3	6	1051737	1051742	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4096	NC_008269	GTG	2	6	1051788	1051793	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_008269	GCC	2	6	1051814	1051819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4098	NC_008269	CG	3	6	1051850	1051855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4099	NC_008269	GCG	2	6	1051907	1051912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_008269	CCG	2	6	1053095	1053100	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4101	NC_008269	TCG	2	6	1053149	1053154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_008269	CGT	2	6	1053185	1053190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_008269	TAG	2	6	1053206	1053211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_008269	AGG	2	6	1053246	1053251	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_008269	CGT	2	6	1053255	1053260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_008269	GAC	2	6	1053262	1053267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4107	NC_008269	CGGG	2	8	1053785	1053792	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4108	NC_008269	CAG	2	6	1053799	1053804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_008269	CAC	2	6	1053820	1053825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4110	NC_008269	CG	3	6	1053827	1053832	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4111	NC_008269	CGCC	2	8	1053917	1053924	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4112	NC_008269	CCA	2	6	1053925	1053930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4113	NC_008269	CCG	2	6	1053988	1053993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4114	NC_008269	GGC	2	6	1054749	1054754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4115	NC_008269	TGGC	2	8	1054783	1054790	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4116	NC_008269	TTG	2	6	1054801	1054806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_008269	AAC	2	6	1054854	1054859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_008269	GGC	2	6	1054936	1054941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_008269	CAC	2	6	1054993	1054998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4120	NC_008269	GAT	2	6	1055064	1055069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4121	NC_008269	TCG	2	6	1055847	1055852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_008269	TTG	2	6	1055856	1055861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4123	NC_008269	CG	3	6	1055889	1055894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4124	NC_008269	CAT	2	6	1056480	1056485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4125	NC_008269	GCT	2	6	1056744	1056749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4126	NC_008269	GAG	2	6	1056752	1056757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_008269	GAC	2	6	1057131	1057136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_008269	TCT	2	6	1057138	1057143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4129	NC_008269	CGG	2	6	1057731	1057736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_008269	CCGA	2	8	1057784	1057791	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4131	NC_008269	CGA	2	6	1057835	1057840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4263	NC_008269	GT	3	6	1090871	1090876	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4264	NC_008269	CAGT	2	8	1090927	1090934	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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4281	NC_008269	CGG	2	6	1100318	1100323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4283	NC_008269	CGG	2	6	1100403	1100408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4292	NC_008269	GC	3	6	1102221	1102226	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4293	NC_008269	GGT	2	6	1102227	1102232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4294	NC_008269	CTC	2	6	1102250	1102255	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4297	NC_008269	ATG	2	6	1102396	1102401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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