MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 14762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_008268	GAG	2	6	7448499	7448504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13502	NC_008268	GCCGAC	2	12	7448617	7448628	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
13503	NC_008268	GC	3	6	7448646	7448651	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13504	NC_008268	GGGTG	2	10	7448699	7448708	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
13505	NC_008268	GTC	2	6	7448719	7448724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13506	NC_008268	GGT	2	6	7448758	7448763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13507	NC_008268	CCG	2	6	7448774	7448779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13508	NC_008268	GGTG	2	8	7448969	7448976	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13509	NC_008268	GAC	2	6	7448978	7448983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13510	NC_008268	TGC	2	6	7449017	7449022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13511	NC_008268	GAC	2	6	7451568	7451573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13512	NC_008268	TCG	2	6	7451599	7451604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13513	NC_008268	GAAG	2	8	7451614	7451621	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13514	NC_008268	CCG	2	6	7452845	7452850	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13515	NC_008268	TCG	2	6	7452957	7452962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13516	NC_008268	CAC	2	6	7453323	7453328	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13517	NC_008268	CCG	2	6	7453340	7453345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13518	NC_008268	CAC	2	6	7453366	7453371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13519	NC_008268	CG	3	6	7454997	7455002	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13520	NC_008268	TGC	2	6	7455009	7455014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13521	NC_008268	GCTC	2	8	7456661	7456668	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13522	NC_008268	GCG	2	6	7456674	7456679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13523	NC_008268	CGT	2	6	7456734	7456739	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13524	NC_008268	CGCTG	2	10	7456747	7456756	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13525	NC_008268	CGGG	2	8	7456790	7456797	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13526	NC_008268	CAG	2	6	7456799	7456804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13527	NC_008268	C	7	7	7456818	7456824	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13528	NC_008268	CCTG	2	8	7456898	7456905	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13529	NC_008268	CGA	2	6	7458055	7458060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13530	NC_008268	CG	3	6	7458203	7458208	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13531	NC_008268	CAC	2	6	7458226	7458231	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13532	NC_008268	CTC	2	6	7458308	7458313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13533	NC_008268	GCT	2	6	7458353	7458358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13534	NC_008268	CA	3	6	7461503	7461508	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13535	NC_008268	GAG	2	6	7461581	7461586	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13536	NC_008268	CCGG	2	8	7461628	7461635	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13537	NC_008268	TCG	2	6	7461651	7461656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13538	NC_008268	TCA	2	6	7461720	7461725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13539	NC_008268	GC	3	6	7461796	7461801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13540	NC_008268	CGA	2	6	7461847	7461852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13541	NC_008268	CCA	2	6	7461899	7461904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13542	NC_008268	ACG	2	6	7461929	7461934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13543	NC_008268	AAC	2	6	7462610	7462615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13544	NC_008268	CGG	2	6	7462654	7462659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13545	NC_008268	CAC	2	6	7462677	7462682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13546	NC_008268	CTG	2	6	7462695	7462700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13547	NC_008268	TCG	2	6	7462764	7462769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13548	NC_008268	GAA	2	6	7462811	7462816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13549	NC_008268	GAA	2	6	7463100	7463105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13550	NC_008268	GA	3	6	7463111	7463116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13551	NC_008268	ACCA	2	8	7463131	7463138	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13552	NC_008268	CAG	2	6	7463145	7463150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13553	NC_008268	CGCA	2	8	7463168	7463175	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13554	NC_008268	CGT	2	6	7463226	7463231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13555	NC_008268	GCG	2	6	7463258	7463263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13556	NC_008268	GATGC	2	10	7463274	7463283	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
13557	NC_008268	CCAC	2	8	7463295	7463302	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
13558	NC_008268	CTG	2	6	7463455	7463460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13559	NC_008268	CGC	2	6	7463477	7463482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13560	NC_008268	TTC	2	6	7463506	7463511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13561	NC_008268	CGAT	2	8	7463934	7463941	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13562	NC_008268	GAT	2	6	7463948	7463953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13563	NC_008268	CCCCA	2	10	7464018	7464027	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
13564	NC_008268	TGG	2	6	7464030	7464035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13565	NC_008268	GGA	2	6	7464074	7464079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13566	NC_008268	TCG	2	6	7464106	7464111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13567	NC_008268	TCG	3	9	7464115	7464123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13568	NC_008268	CCG	2	6	7464868	7464873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13569	NC_008268	CG	3	6	7467476	7467481	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13570	NC_008268	TCC	2	6	7468319	7468324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13571	NC_008268	CAC	2	6	7468347	7468352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13572	NC_008268	CGA	2	6	7468395	7468400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13573	NC_008268	CGA	2	6	7468471	7468476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13580	NC_008268	GCCG	2	8	7473257	7473264	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13581	NC_008268	CCG	2	6	7473267	7473272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13584	NC_008268	GGTG	2	8	7473337	7473344	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
13585	NC_008268	GGTGC	2	10	7473355	7473364	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
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13595	NC_008268	GCC	2	6	7473868	7473873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13596	NC_008268	CGA	2	6	7473879	7473884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13598	NC_008268	CGGCG	2	10	7473976	7473985	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
13599	NC_008268	ACC	2	6	7473987	7473992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13600	NC_008268	CCG	2	6	7474008	7474013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13601	NC_008268	CGC	2	6	7474024	7474029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13602	NC_008268	GCC	2	6	7474064	7474069	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13603	NC_008268	CCGG	2	8	7474096	7474103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13604	NC_008268	TGC	2	6	7474105	7474110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13605	NC_008268	CT	3	6	7474317	7474322	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13606	NC_008268	TC	3	6	7474326	7474331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13607	NC_008268	GGT	2	6	7474341	7474346	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13608	NC_008268	GTC	3	9	7474357	7474365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13615	NC_008268	TCC	2	6	7474682	7474687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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13617	NC_008268	TCG	2	6	7475315	7475320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13620	NC_008268	CCGG	2	8	7477070	7477077	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13621	NC_008268	TCTT	2	8	7477093	7477100	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
13622	NC_008268	CG	3	6	7477111	7477116	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13623	NC_008268	GCAT	2	8	7477155	7477162	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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13626	NC_008268	AT	3	6	7477924	7477929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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