MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 14762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_008268	GGT	2	6	7198090	7198095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_008268	TCATG	2	10	7199863	7199872	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
13003	NC_008268	CA	3	6	7199942	7199947	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13004	NC_008268	CG	3	6	7199954	7199959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13005	NC_008268	AG	3	6	7200049	7200054	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_008268	GGA	2	6	7200864	7200869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_008268	GACCG	2	10	7201185	7201194	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13008	NC_008268	TCGT	2	8	7201195	7201202	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13009	NC_008268	ACG	2	6	7201206	7201211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13010	NC_008268	CCT	2	6	7204089	7204094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13011	NC_008268	TG	4	8	7204120	7204127	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13012	NC_008268	TCA	2	6	7205812	7205817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13013	NC_008268	GATG	2	8	7205840	7205847	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13014	NC_008268	CGA	2	6	7205857	7205862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13015	NC_008268	TCGC	2	8	7205919	7205926	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13016	NC_008268	GTG	2	6	7205933	7205938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_008268	ACA	2	6	7205974	7205979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_008268	TTC	2	6	7210026	7210031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13019	NC_008268	TGC	2	6	7210045	7210050	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13020	NC_008268	TGG	2	6	7210058	7210063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13021	NC_008268	TGA	2	6	7210071	7210076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13022	NC_008268	CGC	2	6	7210124	7210129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13023	NC_008268	CA	3	6	7210217	7210222	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13024	NC_008268	CTC	2	6	7210231	7210236	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13025	NC_008268	AGG	2	6	7210263	7210268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_008268	CGG	2	6	7211924	7211929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13027	NC_008268	CG	3	6	7211951	7211956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13028	NC_008268	GCG	2	6	7212564	7212569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13029	NC_008268	ATC	2	6	7212584	7212589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13030	NC_008268	GTG	2	6	7212619	7212624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13031	NC_008268	CGA	2	6	7214187	7214192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13032	NC_008268	TCG	2	6	7214211	7214216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13033	NC_008268	GCA	2	6	7214223	7214228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13034	NC_008268	ACG	2	6	7214249	7214254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13035	NC_008268	GCA	2	6	7214286	7214291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13036	NC_008268	GCT	2	6	7214292	7214297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13037	NC_008268	GATC	2	8	7214319	7214326	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13038	NC_008268	GAT	2	6	7214398	7214403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13039	NC_008268	CGAGC	2	10	7214413	7214422	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13040	NC_008268	CAG	2	6	7214428	7214433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13041	NC_008268	GC	3	6	7214453	7214458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13042	NC_008268	CGG	2	6	7214511	7214516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13043	NC_008268	GGA	2	6	7214517	7214522	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13044	NC_008268	CGG	2	6	7214550	7214555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13045	NC_008268	GAA	2	6	7214557	7214562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13046	NC_008268	CAG	2	6	7214578	7214583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13047	NC_008268	TCG	2	6	7214654	7214659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13048	NC_008268	GAA	2	6	7214689	7214694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13049	NC_008268	GC	3	6	7214706	7214711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13050	NC_008268	GTC	2	6	7214782	7214787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13051	NC_008268	TCG	2	6	7214825	7214830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13052	NC_008268	GAC	2	6	7215580	7215585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13053	NC_008268	CAT	2	6	7222534	7222539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13054	NC_008268	CA	3	6	7222547	7222552	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13055	NC_008268	CACCC	2	10	7222572	7222581	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
13056	NC_008268	CCG	2	6	7222595	7222600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13057	NC_008268	GGC	2	6	7222613	7222618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13058	NC_008268	TAC	2	6	7222622	7222627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13059	NC_008268	ACT	2	6	7222639	7222644	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13060	NC_008268	GAAG	2	8	7222690	7222697	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13061	NC_008268	CTTG	2	8	7222722	7222729	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13062	NC_008268	CCG	2	6	7223908	7223913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13063	NC_008268	CTGGTC	2	12	7223962	7223973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13064	NC_008268	ACA	2	6	7223992	7223997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13065	NC_008268	ACAGT	2	10	7224101	7224110	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
13066	NC_008268	GCT	2	6	7224133	7224138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13067	NC_008268	GCG	2	6	7224204	7224209	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13068	NC_008268	AGT	2	6	7224321	7224326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13069	NC_008268	ACA	2	6	7224327	7224332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13070	NC_008268	TCG	2	6	7224342	7224347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13071	NC_008268	GTA	2	6	7224350	7224355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_008268	TCG	2	6	7224376	7224381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13073	NC_008268	GCAG	2	8	7224435	7224442	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13074	NC_008268	ACG	2	6	7225535	7225540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13075	NC_008268	CG	3	6	7225560	7225565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13076	NC_008268	TGC	2	6	7225579	7225584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13077	NC_008268	CGTTG	2	10	7225594	7225603	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
13078	NC_008268	CGA	2	6	7226852	7226857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13079	NC_008268	GC	3	6	7226907	7226912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13080	NC_008268	TG	4	8	7226960	7226967	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13081	NC_008268	CGTGG	2	10	7226990	7226999	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
13082	NC_008268	CCT	2	6	7227022	7227027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13083	NC_008268	G	6	6	7227131	7227136	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13084	NC_008268	ACGG	2	8	7227144	7227151	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13085	NC_008268	GCA	2	6	7227152	7227157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13087	NC_008268	GAGG	2	8	7227207	7227214	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_008268	GC	3	6	7227284	7227289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13089	NC_008268	AGGC	2	8	7227308	7227315	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13090	NC_008268	GCA	2	6	7227417	7227422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13091	NC_008268	CTG	2	6	7227444	7227449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13092	NC_008268	CGC	2	6	7227453	7227458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13093	NC_008268	CGC	2	6	7227464	7227469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13094	NC_008268	GAG	2	6	7227473	7227478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_008268	GA	3	6	7227493	7227498	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_008268	CGG	2	6	7227504	7227509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13097	NC_008268	TCA	2	6	7227568	7227573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13098	NC_008268	AGG	2	6	7227576	7227581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13099	NC_008268	TCG	2	6	7227586	7227591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13100	NC_008268	GGT	2	6	7227610	7227615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13101	NC_008268	CGC	2	6	7227629	7227634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13102	NC_008268	CATC	2	8	7227650	7227657	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13103	NC_008268	GCG	2	6	7227682	7227687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13104	NC_008268	GCC	2	6	7228196	7228201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13105	NC_008268	GCGCC	2	10	7228208	7228217	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
13106	NC_008268	GTGCC	2	10	7228229	7228238	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13107	NC_008268	TGG	2	6	7228339	7228344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13108	NC_008268	CCCG	2	8	7228348	7228355	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13109	NC_008268	CTG	2	6	7228368	7228373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13110	NC_008268	AGC	2	6	7228506	7228511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13111	NC_008268	GGT	2	6	7228590	7228595	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13112	NC_008268	TGG	2	6	7228622	7228627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13113	NC_008268	GGC	2	6	7228644	7228649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13114	NC_008268	TC	3	6	7228662	7228667	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13115	NC_008268	CGC	2	6	7228676	7228681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13116	NC_008268	GCG	2	6	7228702	7228707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13117	NC_008268	GGCG	2	8	7228742	7228749	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13118	NC_008268	CGT	2	6	7228754	7228759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13119	NC_008268	TGG	2	6	7228805	7228810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13120	NC_008268	TG	3	6	7228811	7228816	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13121	NC_008268	GT	3	6	7228894	7228899	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13122	NC_008268	ATC	2	6	7229922	7229927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13123	NC_008268	CTC	2	6	7229932	7229937	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13124	NC_008268	GATC	2	8	7229942	7229949	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13125	NC_008268	TCT	2	6	7230070	7230075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13126	NC_008268	GAT	2	6	7230139	7230144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13127	NC_008268	AGC	2	6	7230630	7230635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13128	NC_008268	CGA	2	6	7230653	7230658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13129	NC_008268	CCGA	2	8	7230682	7230689	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13130	NC_008268	GAGC	2	8	7230692	7230699	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13131	NC_008268	ACC	2	6	7232723	7232728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13132	NC_008268	CCG	2	6	7232739	7232744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13133	NC_008268	GCG	2	6	7232769	7232774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13135	NC_008268	CGA	2	6	7232847	7232852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13136	NC_008268	CCG	2	6	7232880	7232885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13137	NC_008268	GCC	2	6	7232904	7232909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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13139	NC_008268	CACGC	2	10	7235293	7235302	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
13140	NC_008268	CCCT	2	8	7235331	7235338	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13141	NC_008268	GGC	2	6	7235343	7235348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13143	NC_008268	AGG	2	6	7235392	7235397	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13148	NC_008268	CGG	2	6	7235490	7235495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13152	NC_008268	GTA	2	6	7236409	7236414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13157	NC_008268	CGTT	2	8	7240002	7240009	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13158	NC_008268	GAAGA	2	10	7240073	7240082	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
13159	NC_008268	G	6	6	7240180	7240185	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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13165	NC_008268	TGG	2	6	7240358	7240363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13168	NC_008268	GAGG	2	8	7245232	7245239	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
13169	NC_008268	CGG	2	6	7248330	7248335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13221	NC_008268	TCCG	2	8	7274575	7274582	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13222	NC_008268	GGT	2	6	7276211	7276216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13233	NC_008268	ACCGC	2	10	7284381	7284390	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
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13237	NC_008268	GAAC	2	8	7293689	7293696	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
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13241	NC_008268	CCGG	2	8	7295487	7295494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13242	NC_008268	CAG	2	6	7295500	7295505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13243	NC_008268	CAC	2	6	7296827	7296832	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13244	NC_008268	GAG	2	6	7296883	7296888	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13245	NC_008268	GAG	2	6	7298069	7298074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13246	NC_008268	CCT	2	6	7298098	7298103	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13247	NC_008268	CTG	2	6	7298909	7298914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13248	NC_008268	GAC	2	6	7299104	7299109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13249	NC_008268	AGC	2	6	7299120	7299125	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13250	NC_008268	GC	3	6	7304932	7304937	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13251	NC_008268	TCC	2	6	7304960	7304965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13252	NC_008268	CG	3	6	7304980	7304985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13253	NC_008268	ATC	2	6	7304986	7304991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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