MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 14762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_008268	CCG	2	6	6077152	6077157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11502	NC_008268	GCG	2	6	6077175	6077180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11503	NC_008268	GCG	2	6	6077194	6077199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11504	NC_008268	TGCC	2	8	6077216	6077223	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11505	NC_008268	CCG	2	6	6077228	6077233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11506	NC_008268	CCCG	2	8	6078856	6078863	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11507	NC_008268	GTA	2	6	6078884	6078889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11508	NC_008268	CGA	2	6	6078903	6078908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11509	NC_008268	GATC	2	8	6078917	6078924	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11510	NC_008268	GCG	2	6	6079614	6079619	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11511	NC_008268	AAC	2	6	6079657	6079662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11512	NC_008268	GCTT	2	8	6080569	6080576	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11513	NC_008268	GTT	2	6	6080601	6080606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_008268	GGC	2	6	6082286	6082291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11515	NC_008268	GTCG	2	8	6083893	6083900	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11516	NC_008268	CGTC	2	8	6083903	6083910	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11517	NC_008268	CGC	2	6	6083921	6083926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11518	NC_008268	GC	3	6	6087654	6087659	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11519	NC_008268	CTCC	2	8	6088552	6088559	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11520	NC_008268	GCG	4	12	6088592	6088603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11521	NC_008268	GCT	2	6	6089537	6089542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11522	NC_008268	GTC	2	6	6089556	6089561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11523	NC_008268	CG	3	6	6089567	6089572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11524	NC_008268	TCAG	2	8	6092341	6092348	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11525	NC_008268	CTT	2	6	6092370	6092375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11526	NC_008268	GTGAA	2	10	6092436	6092445	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_008268	CGCA	2	8	6092478	6092485	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11528	NC_008268	TACCG	2	10	6092525	6092534	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11529	NC_008268	GAA	2	6	6096138	6096143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11530	NC_008268	GTC	2	6	6096918	6096923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11531	NC_008268	CGC	2	6	6096935	6096940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11532	NC_008268	GTAA	2	8	6098029	6098036	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11534	NC_008268	CGG	2	6	6100480	6100485	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11535	NC_008268	ACCG	2	8	6100539	6100546	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11536	NC_008268	AGG	2	6	6100548	6100553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_008268	GA	3	6	6103556	6103561	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_008268	CCGG	2	8	6107708	6107715	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11539	NC_008268	AGC	2	6	6109319	6109324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11540	NC_008268	CGG	2	6	6109377	6109382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11541	NC_008268	CGG	3	9	6111246	6111254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11542	NC_008268	AGG	2	6	6111841	6111846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11543	NC_008268	CGG	2	6	6111850	6111855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11544	NC_008268	GTC	2	6	6112115	6112120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11545	NC_008268	CCG	2	6	6112160	6112165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11546	NC_008268	CAC	2	6	6112222	6112227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11547	NC_008268	CAC	2	6	6112258	6112263	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11548	NC_008268	AC	3	6	6112288	6112293	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11549	NC_008268	GTA	2	6	6112352	6112357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_008268	GAG	2	6	6114172	6114177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_008268	GTC	2	6	6114215	6114220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11552	NC_008268	CGTG	2	8	6115925	6115932	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11553	NC_008268	GAC	2	6	6116588	6116593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11554	NC_008268	GCG	2	6	6116595	6116600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11555	NC_008268	GAC	2	6	6116622	6116627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11556	NC_008268	GCC	2	6	6116630	6116635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11557	NC_008268	GGT	2	6	6117308	6117313	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11558	NC_008268	GGCG	2	8	6117318	6117325	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11559	NC_008268	CGA	2	6	6117334	6117339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11560	NC_008268	CGC	2	6	6117387	6117392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11561	NC_008268	AGCC	2	8	6117406	6117413	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11562	NC_008268	GCG	2	6	6117508	6117513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11563	NC_008268	GAGGT	2	10	6117516	6117525	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_008268	CGA	2	6	6117600	6117605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11565	NC_008268	GGA	2	6	6117607	6117612	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_008268	GTG	2	6	6119411	6119416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11567	NC_008268	GTGTG	2	10	6122159	6122168	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_008268	CCT	2	6	6122274	6122279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11569	NC_008268	CAG	2	6	6122287	6122292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11570	NC_008268	GCCTGC	2	12	6122303	6122314	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
11571	NC_008268	ACGG	2	8	6122343	6122350	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11572	NC_008268	GCC	2	6	6122390	6122395	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11573	NC_008268	G	6	6	6122402	6122407	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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11575	NC_008268	GGC	2	6	6123722	6123727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11576	NC_008268	GAG	2	6	6128047	6128052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11577	NC_008268	GGTC	2	8	6130154	6130161	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11578	NC_008268	CAT	2	6	6130173	6130178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11580	NC_008268	TCGA	2	8	6130224	6130231	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11581	NC_008268	ACG	2	6	6130260	6130265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11583	NC_008268	CGTCT	2	10	6136666	6136675	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11584	NC_008268	TC	3	6	6138396	6138401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11585	NC_008268	CTTCG	2	10	6139592	6139601	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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11589	NC_008268	CGG	2	6	6144124	6144129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11590	NC_008268	GAT	2	6	6144181	6144186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11592	NC_008268	CTGTC	2	10	6144223	6144232	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11593	NC_008268	GAG	2	6	6144239	6144244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_008268	GCTCC	2	10	6152125	6152134	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
11595	NC_008268	GCC	2	6	6152135	6152140	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11596	NC_008268	TGC	2	6	6152179	6152184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11598	NC_008268	GA	3	6	6152237	6152242	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11599	NC_008268	CGC	2	6	6152260	6152265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11600	NC_008268	TCG	3	9	6152350	6152358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11601	NC_008268	AGGAA	2	10	6152367	6152376	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
11602	NC_008268	GC	3	6	6153132	6153137	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11603	NC_008268	G	7	7	6153144	6153150	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11604	NC_008268	CTGA	2	8	6157547	6157554	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11605	NC_008268	GAC	3	9	6157576	6157584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11607	NC_008268	GT	3	6	6157760	6157765	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11608	NC_008268	CTCC	2	8	6157773	6157780	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
11609	NC_008268	CCA	2	6	6168511	6168516	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11610	NC_008268	CG	3	6	6168690	6168695	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11611	NC_008268	TCGC	2	8	6168815	6168822	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11612	NC_008268	TGG	2	6	6168833	6168838	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_008268	TG	3	6	6169731	6169736	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11614	NC_008268	CGG	2	6	6169746	6169751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11616	NC_008268	TG	3	6	6176882	6176887	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11617	NC_008268	GTC	2	6	6176939	6176944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11619	NC_008268	TTTG	2	8	6177006	6177013	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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11622	NC_008268	GGCG	2	8	6177133	6177140	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11623	NC_008268	AAT	2	6	6177144	6177149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11624	NC_008268	GTTT	2	8	6178106	6178113	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
11625	NC_008268	AGG	2	6	6181179	6181184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11629	NC_008268	TCA	2	6	6189605	6189610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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