MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 14762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_008268	CGG	2	6	3794431	3794436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8002	NC_008268	CGGCGC	2	12	3794466	3794477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8003	NC_008268	TGC	2	6	3794562	3794567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8004	NC_008268	CATCA	2	10	3794595	3794604	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
8005	NC_008268	CAGTT	2	10	3794606	3794615	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8006	NC_008268	CCG	2	6	3794640	3794645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8007	NC_008268	CGA	2	6	3794670	3794675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8008	NC_008268	GGA	2	6	3794726	3794731	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8009	NC_008268	CCG	2	6	3796214	3796219	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8010	NC_008268	AGA	2	6	3801216	3801221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8011	NC_008268	CACG	2	8	3802179	3802186	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8012	NC_008268	TCG	2	6	3804860	3804865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8013	NC_008268	GGA	2	6	3804877	3804882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8014	NC_008268	CGA	2	6	3804911	3804916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8015	NC_008268	GCA	2	6	3804921	3804926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8016	NC_008268	TTGA	2	8	3804990	3804997	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8017	NC_008268	GAA	2	6	3806744	3806749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8018	NC_008268	GCT	2	6	3806796	3806801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8019	NC_008268	TTC	2	6	3806822	3806827	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8020	NC_008268	TCA	2	6	3806828	3806833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8021	NC_008268	AGG	2	6	3806877	3806882	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8022	NC_008268	CGAT	2	8	3807964	3807971	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8023	NC_008268	GC	3	6	3807990	3807995	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8024	NC_008268	ACG	3	9	3809092	3809100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8025	NC_008268	CGG	2	6	3809140	3809145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8026	NC_008268	ACCC	2	8	3811832	3811839	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8027	NC_008268	ACA	2	6	3811843	3811848	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8028	NC_008268	TTCC	2	8	3811892	3811899	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
8029	NC_008268	CGG	2	6	3811922	3811927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8030	NC_008268	GGT	2	6	3811936	3811941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8031	NC_008268	GCC	2	6	3811968	3811973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8032	NC_008268	TCCA	2	8	3811978	3811985	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
8033	NC_008268	CTC	2	6	3814376	3814381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8034	NC_008268	GTG	2	6	3814403	3814408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8035	NC_008268	GCA	2	6	3814417	3814422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8036	NC_008268	GCCC	2	8	3814475	3814482	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8037	NC_008268	GTC	2	6	3815935	3815940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8038	NC_008268	TGAA	2	8	3817944	3817951	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8039	NC_008268	TCG	2	6	3820879	3820884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8040	NC_008268	CTGA	2	8	3820906	3820913	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8041	NC_008268	CGC	2	6	3820972	3820977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8042	NC_008268	TTC	2	6	3820986	3820991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8043	NC_008268	GCT	2	6	3821012	3821017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8044	NC_008268	CTGA	2	8	3821071	3821078	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8045	NC_008268	TCAG	2	8	3821110	3821117	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8046	NC_008268	AGG	2	6	3821130	3821135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8047	NC_008268	ACC	2	6	3821753	3821758	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8048	NC_008268	GAC	2	6	3823686	3823691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8049	NC_008268	CGG	2	6	3823729	3823734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8050	NC_008268	GCC	2	6	3823766	3823771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8051	NC_008268	ACC	2	6	3824181	3824186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8052	NC_008268	CCG	2	6	3824203	3824208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8053	NC_008268	ACG	2	6	3825463	3825468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8054	NC_008268	TTA	2	6	3825485	3825490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8055	NC_008268	CACCC	2	10	3828427	3828436	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
8056	NC_008268	CCG	2	6	3828459	3828464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8057	NC_008268	ACC	2	6	3833923	3833928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8058	NC_008268	GT	3	6	3833959	3833964	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8059	NC_008268	CAT	2	6	3834579	3834584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8061	NC_008268	GGA	2	6	3834610	3834615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8062	NC_008268	CGC	2	6	3834634	3834639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8063	NC_008268	AG	3	6	3835358	3835363	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8064	NC_008268	CAA	2	6	3835370	3835375	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8065	NC_008268	AG	3	6	3835430	3835435	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8066	NC_008268	CA	3	6	3835464	3835469	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8067	NC_008268	TCG	2	6	3838163	3838168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8068	NC_008268	GTA	2	6	3838235	3838240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8069	NC_008268	TG	3	6	3838260	3838265	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8070	NC_008268	CGGGC	2	10	3838291	3838300	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
8071	NC_008268	GGTC	2	8	3838352	3838359	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8072	NC_008268	ACC	2	6	3838373	3838378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8073	NC_008268	CCGC	2	8	3839963	3839970	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8074	NC_008268	GT	3	6	3843125	3843130	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8078	NC_008268	TC	3	6	3847399	3847404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8089	NC_008268	GAG	2	6	3856787	3856792	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8090	NC_008268	CCA	3	9	3859193	3859201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8091	NC_008268	ACC	2	6	3859215	3859220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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8095	NC_008268	AC	4	8	3861512	3861519	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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8097	NC_008268	GACC	2	8	3861952	3861959	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
8098	NC_008268	ATCG	2	8	3861967	3861974	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
8099	NC_008268	TTTG	2	8	3861976	3861983	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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8102	NC_008268	ACT	2	6	3866202	3866207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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8106	NC_008268	GCC	2	6	3868418	3868423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8107	NC_008268	GTT	2	6	3868428	3868433	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8108	NC_008268	ACCC	2	8	3868822	3868829	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
8109	NC_008268	CGG	2	6	3868856	3868861	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
8110	NC_008268	CCCG	2	8	3868878	3868885	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
8111	NC_008268	CGC	2	6	3868942	3868947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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8113	NC_008268	GAAAC	2	10	3868996	3869005	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
8114	NC_008268	TG	3	6	3869092	3869097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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8117	NC_008268	GGTCA	2	10	3871876	3871885	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8118	NC_008268	CAC	2	6	3872081	3872086	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8119	NC_008268	GTT	2	6	3872136	3872141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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8121	NC_008268	GC	3	6	3872208	3872213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8122	NC_008268	CTC	2	6	3872224	3872229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8123	NC_008268	AGG	2	6	3872251	3872256	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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8127	NC_008268	AC	3	6	3872421	3872426	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8128	NC_008268	GGA	2	6	3872430	3872435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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