MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodococcus jostii RHA1 chromosome

Total Repeats: 14762

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_008268	CCA	2	6	3245394	3245399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6502	NC_008268	AGC	2	6	3245405	3245410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6503	NC_008268	GCA	2	6	3246727	3246732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6504	NC_008268	GCG	2	6	3246775	3246780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6505	NC_008268	CGT	2	6	3247053	3247058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6506	NC_008268	GCG	2	6	3247067	3247072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6507	NC_008268	CCA	2	6	3247085	3247090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6508	NC_008268	CG	3	6	3247187	3247192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6509	NC_008268	TACC	2	8	3247244	3247251	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6510	NC_008268	TCA	2	6	3247258	3247263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6511	NC_008268	GAT	2	6	3247280	3247285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6512	NC_008268	GAA	2	6	3247298	3247303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6513	NC_008268	ACTT	2	8	3247316	3247323	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6514	NC_008268	GTG	2	6	3247821	3247826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6515	NC_008268	CTG	2	6	3247839	3247844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6516	NC_008268	CAC	2	6	3247854	3247859	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6517	NC_008268	TCG	2	6	3247870	3247875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_008268	AGTC	2	8	3247996	3248003	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6519	NC_008268	CA	3	6	3248023	3248028	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6520	NC_008268	GCC	2	6	3248893	3248898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6521	NC_008268	ACGA	2	8	3248920	3248927	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6522	NC_008268	GTC	2	6	3248977	3248982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6523	NC_008268	GCC	2	6	3249056	3249061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6524	NC_008268	CGG	2	6	3249073	3249078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6525	NC_008268	TG	3	6	3249090	3249095	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_008268	GGT	2	6	3249098	3249103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_008268	GTGG	2	8	3250589	3250596	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_008268	TCG	3	9	3250605	3250613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6529	NC_008268	GC	3	6	3250674	3250679	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6530	NC_008268	CGACC	2	10	3251695	3251704	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6531	NC_008268	CGC	2	6	3253152	3253157	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6532	NC_008268	CA	3	6	3253164	3253169	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6533	NC_008268	CCGC	2	8	3253186	3253193	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6534	NC_008268	TCG	2	6	3253245	3253250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6535	NC_008268	CGC	2	6	3253258	3253263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6536	NC_008268	TCC	2	6	3253318	3253323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6537	NC_008268	TAGCTA	2	12	3253352	3253363	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6538	NC_008268	ACC	2	6	3253377	3253382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6539	NC_008268	GTT	2	6	3255514	3255519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6540	NC_008268	TCG	2	6	3255525	3255530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6541	NC_008268	GAA	2	6	3255544	3255549	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6542	NC_008268	TCG	2	6	3255613	3255618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6543	NC_008268	CGA	2	6	3255706	3255711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6544	NC_008268	GT	3	6	3255761	3255766	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6545	NC_008268	CCT	2	6	3257061	3257066	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6546	NC_008268	CGGTT	2	10	3257129	3257138	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6547	NC_008268	CAT	2	6	3257165	3257170	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6548	NC_008268	AGG	2	6	3257171	3257176	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6549	NC_008268	GC	3	6	3259647	3259652	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6550	NC_008268	ATCC	2	8	3259831	3259838	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
6551	NC_008268	CGG	2	6	3259876	3259881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6552	NC_008268	GAC	2	6	3259919	3259924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6553	NC_008268	ATC	2	6	3259935	3259940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6554	NC_008268	AG	3	6	3259976	3259981	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_008268	CGGC	2	8	3260001	3260008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6556	NC_008268	CGCC	2	8	3260045	3260052	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6557	NC_008268	GCA	2	6	3260085	3260090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6558	NC_008268	CCTTC	2	10	3261530	3261539	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
6559	NC_008268	GCC	2	6	3261893	3261898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6560	NC_008268	CCG	2	6	3261903	3261908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6561	NC_008268	ACG	2	6	3261932	3261937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6562	NC_008268	C	6	6	3261966	3261971	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6563	NC_008268	GAGGT	2	10	3262009	3262018	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_008268	GGC	2	6	3262033	3262038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6565	NC_008268	G	6	6	3262055	3262060	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_008268	CGG	2	6	3262061	3262066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6567	NC_008268	TC	3	6	3262641	3262646	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6568	NC_008268	CGA	2	6	3262672	3262677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6569	NC_008268	TCA	2	6	3262715	3262720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6570	NC_008268	CGG	2	6	3262786	3262791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6571	NC_008268	CGCT	2	8	3262793	3262800	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6572	NC_008268	GACG	2	8	3262827	3262834	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6573	NC_008268	GC	3	6	3263219	3263224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6574	NC_008268	AGC	2	6	3263601	3263606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6575	NC_008268	CCCA	2	8	3263611	3263618	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6576	NC_008268	CCAC	2	8	3263667	3263674	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6577	NC_008268	CGA	2	6	3263704	3263709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6578	NC_008268	CCCCG	2	10	3264655	3264664	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
6579	NC_008268	CGA	2	6	3264682	3264687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6580	NC_008268	CGT	2	6	3264704	3264709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6581	NC_008268	GTC	2	6	3264743	3264748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6582	NC_008268	GCA	2	6	3264760	3264765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6583	NC_008268	TCG	2	6	3264766	3264771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6584	NC_008268	TGA	2	6	3264785	3264790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6585	NC_008268	GTGC	2	8	3264817	3264824	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6586	NC_008268	TCG	2	6	3264859	3264864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6587	NC_008268	AGA	2	6	3265459	3265464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6588	NC_008268	CTC	2	6	3267014	3267019	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6589	NC_008268	TGCC	2	8	3267020	3267027	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6590	NC_008268	CCT	2	6	3267043	3267048	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6591	NC_008268	CTG	2	6	3267098	3267103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6592	NC_008268	GTA	2	6	3267119	3267124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6594	NC_008268	CGG	2	6	3267163	3267168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6595	NC_008268	TGGT	2	8	3267199	3267206	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6596	NC_008268	GCTTG	2	10	3267207	3267216	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
6597	NC_008268	CTG	2	6	3267641	3267646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6598	NC_008268	CG	3	6	3268815	3268820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6599	NC_008268	CGA	2	6	3268835	3268840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6600	NC_008268	CGC	2	6	3268847	3268852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6601	NC_008268	TTG	2	6	3271920	3271925	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6602	NC_008268	GC	3	6	3275160	3275165	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6603	NC_008268	CA	4	8	3275193	3275200	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6604	NC_008268	GTC	2	6	3275205	3275210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6605	NC_008268	CCGA	2	8	3275254	3275261	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6606	NC_008268	TCG	2	6	3275316	3275321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6607	NC_008268	GGT	2	6	3275343	3275348	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6608	NC_008268	ACGCA	2	10	3276012	3276021	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6609	NC_008268	ATC	2	6	3276029	3276034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6611	NC_008268	CGG	2	6	3276121	3276126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6612	NC_008268	GC	3	6	3276142	3276147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6613	NC_008268	CT	3	6	3276233	3276238	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6614	NC_008268	CG	3	6	3276260	3276265	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6618	NC_008268	CGGTC	2	10	3277539	3277548	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6619	NC_008268	CGG	3	9	3277583	3277591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6620	NC_008268	GAC	2	6	3277596	3277601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6624	NC_008268	GGT	2	6	3279079	3279084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6625	NC_008268	CGC	2	6	3279104	3279109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6626	NC_008268	GC	4	8	3279113	3279120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6627	NC_008268	CTGA	2	8	3279176	3279183	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6628	NC_008268	GAG	2	6	3279207	3279212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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