MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Roseobacter denitrificans OCh 114 chromosome

Total Repeats: 7635

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_008209	GAA	2	6	3313011	3313016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6002	NC_008209	CGA	2	6	3315857	3315862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_008209	TCC	2	6	3316832	3316837	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6004	NC_008209	GTCT	2	8	3317118	3317125	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
6005	NC_008209	CAG	2	6	3317245	3317250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6006	NC_008209	CAG	2	6	3317429	3317434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_008209	AGC	2	6	3317456	3317461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_008209	GAA	2	6	3317484	3317489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6009	NC_008209	TCG	2	6	3317544	3317549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_008209	CAC	2	6	3317577	3317582	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6011	NC_008209	TAC	2	6	3317646	3317651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6012	NC_008209	TTTC	2	8	3317692	3317699	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6013	NC_008209	T	6	6	3317779	3317784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6014	NC_008209	CGG	2	6	3317787	3317792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6015	NC_008209	TGCG	2	8	3317805	3317812	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6016	NC_008209	T	6	6	3317837	3317842	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6017	NC_008209	GTG	2	6	3318014	3318019	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_008209	GATCC	2	10	3318057	3318066	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6019	NC_008209	GCT	2	6	3318103	3318108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6020	NC_008209	CG	3	6	3318157	3318162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6021	NC_008209	ACG	2	6	3318199	3318204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6022	NC_008209	ACG	2	6	3318220	3318225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6023	NC_008209	ACA	2	6	3318244	3318249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6024	NC_008209	ACT	2	6	3318317	3318322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6025	NC_008209	A	7	7	3318379	3318385	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6026	NC_008209	TCA	2	6	3318478	3318483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6027	NC_008209	GCAG	2	8	3318560	3318567	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
6028	NC_008209	GCG	2	6	3318590	3318595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6029	NC_008209	GCC	2	6	3318634	3318639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6030	NC_008209	CTG	2	6	3319485	3319490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6031	NC_008209	GGA	2	6	3319530	3319535	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6032	NC_008209	GCGTG	2	10	3319600	3319609	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6033	NC_008209	GCG	2	6	3319613	3319618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6034	NC_008209	TGC	2	6	3319653	3319658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6035	NC_008209	GCA	2	6	3319673	3319678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6036	NC_008209	TTC	2	6	3319746	3319751	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6037	NC_008209	A	7	7	3319792	3319798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6038	NC_008209	GCC	2	6	3319802	3319807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6039	NC_008209	GAG	2	6	3320665	3320670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6040	NC_008209	GCA	2	6	3320708	3320713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6041	NC_008209	TGA	2	6	3320722	3320727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6042	NC_008209	CCAA	2	8	3320772	3320779	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6043	NC_008209	GT	3	6	3320809	3320814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6044	NC_008209	TCT	2	6	3320883	3320888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6045	NC_008209	ATGA	2	8	3320968	3320975	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6046	NC_008209	TCAG	2	8	3321001	3321008	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6047	NC_008209	AGC	2	6	3321012	3321017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6048	NC_008209	CA	3	6	3321024	3321029	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6049	NC_008209	ACC	2	6	3321067	3321072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6050	NC_008209	GAC	2	6	3321112	3321117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6051	NC_008209	CAT	2	6	3321174	3321179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6052	NC_008209	CGT	4	12	3321204	3321215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6053	NC_008209	GCCC	2	8	3321240	3321247	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6054	NC_008209	TGT	2	6	3321295	3321300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6055	NC_008209	AAGG	2	8	3321310	3321317	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6056	NC_008209	CAACGC	2	12	3321387	3321398	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
6057	NC_008209	GCC	2	6	3321505	3321510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6058	NC_008209	CCA	2	6	3321560	3321565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6059	NC_008209	CTG	2	6	3321634	3321639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6060	NC_008209	TCA	2	6	3321656	3321661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6061	NC_008209	CAC	2	6	3321744	3321749	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6062	NC_008209	TCG	2	6	3321761	3321766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6063	NC_008209	CCA	2	6	3321776	3321781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6064	NC_008209	ACCA	2	8	3321805	3321812	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6065	NC_008209	GTC	2	6	3321817	3321822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6066	NC_008209	CCA	2	6	3321884	3321889	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6067	NC_008209	CAC	2	6	3321936	3321941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6068	NC_008209	CGC	2	6	3321966	3321971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6069	NC_008209	TGT	2	6	3322002	3322007	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6070	NC_008209	CAG	2	6	3322027	3322032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6071	NC_008209	ATC	2	6	3322033	3322038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6072	NC_008209	GTC	2	6	3322057	3322062	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6073	NC_008209	GCC	2	6	3322072	3322077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6074	NC_008209	CGC	2	6	3322098	3322103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6075	NC_008209	TCG	2	6	3322121	3322126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6076	NC_008209	CCG	2	6	3322127	3322132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6077	NC_008209	CGC	2	6	3322143	3322148	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6078	NC_008209	C	6	6	3322154	3322159	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6079	NC_008209	CTA	2	6	3322266	3322271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6080	NC_008209	ACA	2	6	3322322	3322327	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6081	NC_008209	GAA	2	6	3322450	3322455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6082	NC_008209	TGT	2	6	3322481	3322486	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6083	NC_008209	ATCAC	2	10	3322499	3322508	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6084	NC_008209	GATCA	2	10	3322561	3322570	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
6085	NC_008209	CAT	2	6	3322590	3322595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6086	NC_008209	CCG	2	6	3322601	3322606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6087	NC_008209	ATC	2	6	3322621	3322626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6088	NC_008209	CTT	2	6	3322629	3322634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6089	NC_008209	ATCAC	2	10	3322643	3322652	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
6090	NC_008209	GCG	2	6	3322736	3322741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6091	NC_008209	ACCG	2	8	3322821	3322828	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6092	NC_008209	GAT	2	6	3322875	3322880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6093	NC_008209	GAT	2	6	3322911	3322916	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6094	NC_008209	ATG	2	6	3322961	3322966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_008209	ATC	2	6	3322999	3323004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_008209	C	7	7	3323037	3323043	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6097	NC_008209	ACC	2	6	3323086	3323091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6098	NC_008209	ATCGT	2	10	3323147	3323156	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
6099	NC_008209	CG	3	6	3323235	3323240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6100	NC_008209	ACC	2	6	3323353	3323358	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6101	NC_008209	TTTC	2	8	3323462	3323469	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6102	NC_008209	TCA	2	6	3323513	3323518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6103	NC_008209	TGCC	2	8	3323523	3323530	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6104	NC_008209	GTC	2	6	3323539	3323544	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6106	NC_008209	GTC	2	6	3323620	3323625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6107	NC_008209	CTC	2	6	3323656	3323661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6108	NC_008209	ACCGA	2	10	3323761	3323770	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6109	NC_008209	ATC	2	6	3323785	3323790	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_008209	CCG	2	6	3323817	3323822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6111	NC_008209	CGC	2	6	3323871	3323876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6112	NC_008209	GCA	2	6	3323885	3323890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6113	NC_008209	CCCT	2	8	3323920	3323927	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6114	NC_008209	GTC	2	6	3324047	3324052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6115	NC_008209	CCTCG	2	10	3324091	3324100	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6116	NC_008209	GCC	2	6	3324173	3324178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6117	NC_008209	CACC	2	8	3324202	3324209	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6118	NC_008209	TCG	2	6	3324216	3324221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6119	NC_008209	CCA	2	6	3324300	3324305	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6120	NC_008209	GC	3	6	3324325	3324330	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6121	NC_008209	CTA	2	6	3324370	3324375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6122	NC_008209	GAT	2	6	3324376	3324381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6123	NC_008209	TGC	2	6	3324406	3324411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6124	NC_008209	TGCCCC	2	12	3324438	3324449	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
6125	NC_008209	GCCGGT	2	12	3324590	3324601	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6126	NC_008209	TCA	2	6	3324603	3324608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6127	NC_008209	GTC	2	6	3324647	3324652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_008209	GTC	2	6	3324698	3324703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6129	NC_008209	ACC	2	6	3324713	3324718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6130	NC_008209	ACC	2	6	3324740	3324745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6131	NC_008209	ATC	2	6	3324782	3324787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6132	NC_008209	GTT	3	9	3324818	3324826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_008209	GATT	2	8	3324835	3324842	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6134	NC_008209	AGC	2	6	3324864	3324869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6137	NC_008209	CGCC	2	8	3325007	3325014	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6138	NC_008209	ACC	2	6	3325070	3325075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6139	NC_008209	GC	3	6	3325151	3325156	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6142	NC_008209	TGCG	2	8	3325428	3325435	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
6143	NC_008209	CG	3	6	3325600	3325605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6144	NC_008209	CCT	2	6	3325684	3325689	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6147	NC_008209	GTC	2	6	3325835	3325840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6160	NC_008209	CG	3	6	3326466	3326471	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6250	NC_008209	CACC	2	8	3348420	3348427	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6251	NC_008209	GC	4	8	3348435	3348442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6252	NC_008209	CGG	2	6	3348444	3348449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6253	NC_008209	GTG	2	6	3348480	3348485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6254	NC_008209	CT	3	6	3348486	3348491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6255	NC_008209	CAT	2	6	3351764	3351769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6257	NC_008209	CCCG	2	8	3351788	3351795	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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