MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 7218

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_008148	TA	3	6	475580	475585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_008148	CCT	2	6	479497	479502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1003	NC_008148	TC	3	6	479508	479513	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1004	NC_008148	CCG	2	6	483605	483610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_008148	CCT	2	6	483616	483621	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_008148	CT	4	8	483620	483627	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_008148	GCT	2	6	483659	483664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_008148	AGGG	2	8	487923	487930	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_008148	G	6	6	487928	487933	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_008148	CCG	2	6	489918	489923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_008148	GCC	2	6	489934	489939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1012	NC_008148	AT	3	6	489950	489955	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_008148	GGCCGT	2	12	490463	490474	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_008148	ATC	2	6	490478	490483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_008148	TCA	2	6	490537	490542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_008148	GCC	2	6	491297	491302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_008148	GCA	2	6	491346	491351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_008148	CGC	2	6	491910	491915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1019	NC_008148	GGC	2	6	491930	491935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_008148	CCT	2	6	492794	492799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_008148	TG	3	6	492804	492809	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_008148	CG	3	6	492832	492837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1023	NC_008148	GA	3	6	492844	492849	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1024	NC_008148	CCCG	2	8	492851	492858	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1025	NC_008148	CG	3	6	492857	492862	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1026	NC_008148	GCC	2	6	494407	494412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1027	NC_008148	CCGG	2	8	494449	494456	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1028	NC_008148	CCG	2	6	494463	494468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1029	NC_008148	TC	3	6	495800	495805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1030	NC_008148	CTGG	2	8	495808	495815	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_008148	GCC	2	6	495819	495824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1032	NC_008148	TCGC	2	8	495826	495833	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1033	NC_008148	CGC	2	6	497965	497970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1034	NC_008148	CCT	2	6	499303	499308	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1035	NC_008148	GT	3	6	499324	499329	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_008148	CGA	2	6	499394	499399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_008148	GCG	2	6	499415	499420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_008148	GCTG	2	8	499450	499457	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1039	NC_008148	TG	3	6	500328	500333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_008148	TGCCG	2	10	500364	500373	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
1041	NC_008148	GC	3	6	500380	500385	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1042	NC_008148	CGG	2	6	500435	500440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_008148	CTCC	2	8	503141	503148	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1044	NC_008148	TC	3	6	503152	503157	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1045	NC_008148	TTGCG	2	10	503160	503169	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1046	NC_008148	TCC	2	6	504530	504535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1047	NC_008148	CAC	2	6	504569	504574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_008148	GAT	2	6	504639	504644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_008148	CTC	2	6	506097	506102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_008148	ACA	2	6	506113	506118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_008148	TTACA	2	10	506132	506141	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1052	NC_008148	G	7	7	506214	506220	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_008148	AGG	2	6	506254	506259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_008148	GCC	2	6	508928	508933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_008148	CGG	2	6	508941	508946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_008148	ACGG	2	8	509230	509237	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1057	NC_008148	GCG	2	6	509244	509249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_008148	GAC	2	6	509250	509255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_008148	GGC	2	6	509265	509270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1060	NC_008148	TCC	2	6	511386	511391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_008148	CTC	3	9	511478	511486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_008148	T	6	6	511559	511564	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_008148	CGC	2	6	513132	513137	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_008148	GCG	2	6	513167	513172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1065	NC_008148	AG	3	6	513225	513230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_008148	AGGG	2	8	513476	513483	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_008148	TC	3	6	513487	513492	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_008148	CGGG	2	8	515441	515448	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1069	NC_008148	GGT	2	6	515486	515491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1070	NC_008148	CCG	2	6	520689	520694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_008148	CGC	2	6	523911	523916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1072	NC_008148	TAT	2	6	523932	523937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_008148	CCCG	2	8	523948	523955	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1074	NC_008148	GGCG	2	8	524466	524473	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1075	NC_008148	CCT	3	9	530287	530295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_008148	CT	3	6	532344	532349	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1077	NC_008148	CGT	2	6	532364	532369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_008148	CGG	2	6	532418	532423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1079	NC_008148	GGA	2	6	532428	532433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_008148	GTT	2	6	532470	532475	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_008148	TCCC	2	8	532489	532496	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1082	NC_008148	G	7	7	532520	532526	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1083	NC_008148	AT	3	6	532527	532532	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_008148	TCC	2	6	534345	534350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_008148	TCT	2	6	534351	534356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_008148	GCC	2	6	534863	534868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_008148	CCG	2	6	536030	536035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1088	NC_008148	TTC	2	6	536900	536905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_008148	CCCT	2	8	536910	536917	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
1090	NC_008148	GGGC	2	8	536921	536928	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1091	NC_008148	CTT	2	6	536959	536964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_008148	GGGC	2	8	537764	537771	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1093	NC_008148	GAT	2	6	537812	537817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_008148	AGG	2	6	537822	537827	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_008148	TGCT	2	8	539601	539608	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1096	NC_008148	GGCA	2	8	539639	539646	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1097	NC_008148	CGG	2	6	540743	540748	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_008148	GC	4	8	541525	541532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_008148	CCT	2	6	543645	543650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_008148	CGT	2	6	543653	543658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_008148	CGGGG	2	10	543665	543674	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
1102	NC_008148	GCC	2	6	543676	543681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1103	NC_008148	CAT	2	6	543686	543691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_008148	CTGG	2	8	543702	543709	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1105	NC_008148	GAG	2	6	543724	543729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_008148	CCT	2	6	544690	544695	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_008148	AGG	2	6	547413	547418	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_008148	CGA	2	6	548142	548147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_008148	CCT	2	6	554634	554639	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1110	NC_008148	CAA	2	6	554657	554662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_008148	A	6	6	554661	554666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_008148	GCC	2	6	554713	554718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1113	NC_008148	TCT	2	6	554774	554779	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_008148	GTG	2	6	554780	554785	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_008148	CGG	2	6	554830	554835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_008148	GGGA	2	8	554855	554862	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_008148	GCC	2	6	555291	555296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1118	NC_008148	CTC	2	6	555833	555838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1119	NC_008148	AT	3	6	555874	555879	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_008148	G	7	7	555896	555902	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_008148	CT	3	6	555906	555911	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1122	NC_008148	CGGG	2	8	555931	555938	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1123	NC_008148	C	6	6	556944	556949	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1124	NC_008148	CGATC	2	10	556970	556979	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1125	NC_008148	G	6	6	557795	557800	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_008148	GAA	2	6	558769	558774	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_008148	GAGG	2	8	564437	564444	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_008148	C	6	6	568435	568440	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1129	NC_008148	ATC	2	6	568483	568488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1130	NC_008148	GA	3	6	570120	570125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1131	NC_008148	GAG	2	6	572327	572332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1132	NC_008148	CTT	2	6	572350	572355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1133	NC_008148	GCG	2	6	572356	572361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1134	NC_008148	GGC	2	6	572376	572381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1135	NC_008148	GCG	2	6	572390	572395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1136	NC_008148	GGAC	2	8	572415	572422	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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1138	NC_008148	CG	4	8	572516	572523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1408	NC_008148	AGT	2	6	707912	707917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1409	NC_008148	GGCCC	2	10	708490	708499	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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