MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 7218

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_008148	CGG	2	6	3110496	3110501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7002	NC_008148	CGC	2	6	3112670	3112675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7003	NC_008148	GCC	2	6	3113783	3113788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7004	NC_008148	CGC	2	6	3113819	3113824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7005	NC_008148	CCT	2	6	3115002	3115007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7006	NC_008148	TA	3	6	3118347	3118352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_008148	TTC	2	6	3121824	3121829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7008	NC_008148	GCA	2	6	3121877	3121882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7009	NC_008148	TCC	2	6	3126680	3126685	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7010	NC_008148	CTT	2	6	3126732	3126737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7011	NC_008148	CGG	2	6	3126792	3126797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7012	NC_008148	GCAC	2	8	3126798	3126805	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
7013	NC_008148	GCA	2	6	3126864	3126869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_008148	CGG	2	6	3126879	3126884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7015	NC_008148	CTA	2	6	3133431	3133436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7016	NC_008148	CCT	3	9	3133444	3133452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7017	NC_008148	AGG	3	9	3133456	3133464	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_008148	GCCC	3	12	3133484	3133495	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7019	NC_008148	TTC	2	6	3133507	3133512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7020	NC_008148	CGC	2	6	3133544	3133549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7021	NC_008148	CG	3	6	3133552	3133557	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7022	NC_008148	GC	3	6	3133580	3133585	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7023	NC_008148	AGA	3	9	3133615	3133623	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7024	NC_008148	CAGGA	2	10	3133626	3133635	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7025	NC_008148	AG	3	6	3133637	3133642	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_008148	CG	3	6	3133650	3133655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7027	NC_008148	TCC	2	6	3135659	3135664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7028	NC_008148	CGG	2	6	3135668	3135673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7029	NC_008148	CGCCC	2	10	3135701	3135710	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
7030	NC_008148	GCT	2	6	3135716	3135721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7031	NC_008148	C	6	6	3135755	3135760	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7032	NC_008148	AAC	2	6	3135765	3135770	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7033	NC_008148	TCCC	2	8	3135790	3135797	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7034	NC_008148	AG	3	6	3135861	3135866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_008148	CA	3	6	3135896	3135901	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7036	NC_008148	GGC	2	6	3135918	3135923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7037	NC_008148	CCG	2	6	3135984	3135989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7038	NC_008148	CTA	3	9	3136007	3136015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7039	NC_008148	GGGC	2	8	3136026	3136033	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7040	NC_008148	ACCC	2	8	3136090	3136097	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7041	NC_008148	CCT	2	6	3136115	3136120	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7042	NC_008148	AGGA	2	8	3136140	3136147	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7043	NC_008148	GCG	2	6	3140292	3140297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7044	NC_008148	GCG	2	6	3140301	3140306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7045	NC_008148	GCC	2	6	3140319	3140324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7046	NC_008148	CTA	2	6	3140343	3140348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7047	NC_008148	CCGGCC	2	12	3140412	3140423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7048	NC_008148	CCA	2	6	3140447	3140452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7049	NC_008148	ACC	2	6	3140454	3140459	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7050	NC_008148	GAA	2	6	3140466	3140471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7051	NC_008148	AGG	2	6	3140497	3140502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7052	NC_008148	GC	3	6	3142052	3142057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7053	NC_008148	GCC	2	6	3142067	3142072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7054	NC_008148	GAG	3	9	3142126	3142134	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_008148	AG	3	6	3142148	3142153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7056	NC_008148	AG	3	6	3142163	3142168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7057	NC_008148	GAG	2	6	3147085	3147090	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7058	NC_008148	GC	3	6	3147173	3147178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7059	NC_008148	G	6	6	3147192	3147197	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7060	NC_008148	GAG	2	6	3147206	3147211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7061	NC_008148	AG	3	6	3147210	3147215	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7062	NC_008148	CGC	2	6	3147222	3147227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7063	NC_008148	AGCG	2	8	3151737	3151744	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7064	NC_008148	CGAT	2	8	3151764	3151771	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7065	NC_008148	CT	4	8	3151774	3151781	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7066	NC_008148	CTC	2	6	3152920	3152925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7067	NC_008148	TA	3	6	3152945	3152950	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7068	NC_008148	GGGA	2	8	3152968	3152975	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7069	NC_008148	TGCT	2	8	3153003	3153010	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7070	NC_008148	CCG	2	6	3154092	3154097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7071	NC_008148	TC	3	6	3155054	3155059	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7072	NC_008148	CCT	2	6	3155695	3155700	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7073	NC_008148	CT	3	6	3155699	3155704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7074	NC_008148	GCG	2	6	3160704	3160709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7075	NC_008148	CCTC	2	8	3160722	3160729	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7076	NC_008148	CGT	2	6	3160745	3160750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7077	NC_008148	CCTC	2	8	3160771	3160778	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7078	NC_008148	CCGC	2	8	3160795	3160802	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
7079	NC_008148	CTC	2	6	3168022	3168027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7080	NC_008148	C	6	6	3169412	3169417	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7081	NC_008148	TCC	2	6	3169419	3169424	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7082	NC_008148	TCC	3	9	3170371	3170379	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7083	NC_008148	TCC	2	6	3170386	3170391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7084	NC_008148	C	6	6	3170390	3170395	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7085	NC_008148	G	6	6	3170396	3170401	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7086	NC_008148	CGG	2	6	3170416	3170421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7087	NC_008148	GC	4	8	3170432	3170439	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7088	NC_008148	TCC	2	6	3170443	3170448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7089	NC_008148	TC	3	6	3170495	3170500	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7090	NC_008148	CGC	2	6	3170513	3170518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7093	NC_008148	C	6	6	3170555	3170560	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7094	NC_008148	TTGG	2	8	3173190	3173197	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7095	NC_008148	GGGC	2	8	3173198	3173205	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7096	NC_008148	GATG	2	8	3173219	3173226	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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7098	NC_008148	CTC	2	6	3175173	3175178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7099	NC_008148	TGC	2	6	3175180	3175185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7100	NC_008148	GCT	2	6	3175223	3175228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7101	NC_008148	GCG	2	6	3175249	3175254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7102	NC_008148	G	6	6	3175276	3175281	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7103	NC_008148	CGC	2	6	3175331	3175336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7104	NC_008148	CTG	2	6	3175347	3175352	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7108	NC_008148	CCGCC	2	10	3181257	3181266	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
7109	NC_008148	CTC	2	6	3182881	3182886	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7110	NC_008148	CTT	2	6	3182897	3182902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7112	NC_008148	GCG	2	6	3184101	3184106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7113	NC_008148	CCT	2	6	3185297	3185302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7114	NC_008148	CA	3	6	3185321	3185326	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
7115	NC_008148	CG	4	8	3185347	3185354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7116	NC_008148	CGG	2	6	3185372	3185377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7117	NC_008148	CTTC	2	8	3186703	3186710	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7118	NC_008148	CCG	2	6	3186723	3186728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7119	NC_008148	CG	3	6	3186755	3186760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7120	NC_008148	CCT	2	6	3188169	3188174	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7121	NC_008148	CGC	2	6	3188176	3188181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7122	NC_008148	GCC	2	6	3188184	3188189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7123	NC_008148	AT	3	6	3188200	3188205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7124	NC_008148	GCC	2	6	3188216	3188221	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7125	NC_008148	GCG	2	6	3191859	3191864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7126	NC_008148	GGAG	2	8	3191885	3191892	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7127	NC_008148	CCGG	2	8	3191900	3191907	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7128	NC_008148	CCT	2	6	3191912	3191917	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7129	NC_008148	ACG	2	6	3191939	3191944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7130	NC_008148	GAG	2	6	3191986	3191991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7131	NC_008148	GCC	2	6	3192035	3192040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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7133	NC_008148	GAA	2	6	3192124	3192129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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