MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 7218

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_008148	TCC	2	6	2502579	2502584	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5502	NC_008148	GCCC	2	8	2502628	2502635	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5503	NC_008148	CTC	2	6	2502640	2502645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5504	NC_008148	CGC	2	6	2502649	2502654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5505	NC_008148	GC	3	6	2502669	2502674	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5506	NC_008148	GGC	2	6	2502697	2502702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5507	NC_008148	GAG	2	6	2502715	2502720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5508	NC_008148	GTA	2	6	2502735	2502740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5509	NC_008148	CGC	2	6	2502755	2502760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5510	NC_008148	CGG	2	6	2502797	2502802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5511	NC_008148	GAC	2	6	2502882	2502887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5512	NC_008148	CGC	2	6	2502978	2502983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5513	NC_008148	GCGCC	2	10	2502986	2502995	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5514	NC_008148	GCC	2	6	2503014	2503019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5515	NC_008148	AGG	2	6	2503030	2503035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5516	NC_008148	CCCG	2	8	2503043	2503050	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5517	NC_008148	TCCC	2	8	2503053	2503060	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5518	NC_008148	CCA	2	6	2503124	2503129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5519	NC_008148	CA	3	6	2503167	2503172	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5520	NC_008148	GCA	2	6	2503175	2503180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5521	NC_008148	CCT	2	6	2503196	2503201	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5522	NC_008148	GAG	2	6	2503204	2503209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5523	NC_008148	CGAGG	2	10	2503269	2503278	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5524	NC_008148	GAA	2	6	2503297	2503302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_008148	ACC	2	6	2503356	2503361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5526	NC_008148	CTT	2	6	2503396	2503401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5527	NC_008148	TACC	2	8	2503423	2503430	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5528	NC_008148	CCG	2	6	2503488	2503493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5529	NC_008148	CGG	2	6	2503502	2503507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5530	NC_008148	TCT	2	6	2503549	2503554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5531	NC_008148	CCT	2	6	2503556	2503561	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5532	NC_008148	ACT	3	9	2503621	2503629	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5533	NC_008148	TGC	2	6	2503675	2503680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5534	NC_008148	GA	3	6	2504625	2504630	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5535	NC_008148	TGG	2	6	2504642	2504647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5536	NC_008148	CTT	2	6	2504694	2504699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5537	NC_008148	GGC	2	6	2504756	2504761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5538	NC_008148	ACG	2	6	2504772	2504777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5539	NC_008148	GAA	2	6	2504782	2504787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5540	NC_008148	TGG	2	6	2504814	2504819	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5541	NC_008148	GCG	2	6	2504855	2504860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5542	NC_008148	GCG	2	6	2504876	2504881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5543	NC_008148	GAC	2	6	2504978	2504983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5544	NC_008148	TGC	2	6	2505018	2505023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_008148	TCT	2	6	2505026	2505031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5546	NC_008148	GAA	2	6	2505091	2505096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5547	NC_008148	TCT	2	6	2505158	2505163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5548	NC_008148	CCT	2	6	2505176	2505181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5549	NC_008148	GCC	2	6	2505201	2505206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5550	NC_008148	TCTG	2	8	2506217	2506224	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5551	NC_008148	ACCA	2	8	2506235	2506242	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5552	NC_008148	GGAGC	2	10	2506247	2506256	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
5553	NC_008148	AGG	2	6	2506295	2506300	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5554	NC_008148	GGCG	2	8	2506869	2506876	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5555	NC_008148	GCTG	2	8	2506887	2506894	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5556	NC_008148	GTG	2	6	2506916	2506921	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5557	NC_008148	AAG	2	6	2506928	2506933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5558	NC_008148	GAG	2	6	2506980	2506985	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5559	NC_008148	CGG	2	6	2507485	2507490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5560	NC_008148	AGG	2	6	2507580	2507585	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5561	NC_008148	AGA	2	6	2507586	2507591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_008148	ATT	2	6	2508838	2508843	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_008148	ACT	2	6	2512767	2512772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5564	NC_008148	AG	3	6	2512773	2512778	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_008148	AGA	2	6	2517185	2517190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5566	NC_008148	GGA	2	6	2517199	2517204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5567	NC_008148	CCG	2	6	2517211	2517216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5568	NC_008148	CAA	2	6	2517294	2517299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5569	NC_008148	AAG	2	6	2517423	2517428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5570	NC_008148	CCA	2	6	2517479	2517484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5571	NC_008148	AG	3	6	2517545	2517550	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_008148	GGC	2	6	2517568	2517573	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5573	NC_008148	TGG	2	6	2517585	2517590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5574	NC_008148	CCTC	2	8	2517647	2517654	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5575	NC_008148	TC	3	6	2517769	2517774	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5576	NC_008148	GGAG	2	8	2517782	2517789	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
5577	NC_008148	GGA	2	6	2517823	2517828	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_008148	TCC	2	6	2517879	2517884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5579	NC_008148	CTC	2	6	2517938	2517943	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5580	NC_008148	CTC	2	6	2518001	2518006	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5581	NC_008148	CAC	2	6	2518072	2518077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5582	NC_008148	CTG	2	6	2518079	2518084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_008148	CGC	2	6	2518085	2518090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5584	NC_008148	TGG	2	6	2518122	2518127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5585	NC_008148	CTC	2	6	2518177	2518182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5586	NC_008148	GCG	2	6	2518252	2518257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5587	NC_008148	GCG	2	6	2518285	2518290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5588	NC_008148	CCA	2	6	2518337	2518342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5589	NC_008148	GAG	2	6	2518347	2518352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_008148	T	6	6	2518354	2518359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5591	NC_008148	TGG	2	6	2518382	2518387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5592	NC_008148	GCGA	2	8	2518405	2518412	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5593	NC_008148	GTC	2	6	2518435	2518440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5594	NC_008148	CTC	2	6	2518472	2518477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5595	NC_008148	AGCG	2	8	2518481	2518488	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5596	NC_008148	TCT	2	6	2518523	2518528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5598	NC_008148	GAC	2	6	2518579	2518584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5599	NC_008148	CAC	2	6	2518600	2518605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5600	NC_008148	TCC	2	6	2518685	2518690	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5601	NC_008148	AGG	2	6	2518748	2518753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5602	NC_008148	CAG	2	6	2518905	2518910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5603	NC_008148	AGC	2	6	2518974	2518979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5604	NC_008148	GGC	2	6	2518995	2519000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_008148	CGA	2	6	2519051	2519056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5606	NC_008148	GCT	2	6	2519102	2519107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5607	NC_008148	GAT	2	6	2519120	2519125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5609	NC_008148	GGA	2	6	2519180	2519185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5610	NC_008148	CCA	2	6	2519210	2519215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5611	NC_008148	AGA	2	6	2519222	2519227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5612	NC_008148	GAG	2	6	2519262	2519267	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5613	NC_008148	AGA	2	6	2519327	2519332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5614	NC_008148	ACCT	2	8	2519340	2519347	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5615	NC_008148	CCA	2	6	2519366	2519371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5616	NC_008148	CAC	2	6	2519384	2519389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5617	NC_008148	AGG	2	6	2519424	2519429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5618	NC_008148	GTG	2	6	2519436	2519441	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5619	NC_008148	ACGAG	2	10	2519455	2519464	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5620	NC_008148	GAG	2	6	2519495	2519500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5621	NC_008148	GAG	2	6	2519505	2519510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5622	NC_008148	CAG	2	6	2519551	2519556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5623	NC_008148	AAACC	2	10	2519559	2519568	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
5624	NC_008148	TCG	2	6	2519646	2519651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5625	NC_008148	GAA	2	6	2519665	2519670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5626	NC_008148	GA	3	6	2519694	2519699	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5627	NC_008148	GCC	2	6	2519717	2519722	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5628	NC_008148	CGCT	2	8	2519738	2519745	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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