MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Rubrobacter xylanophilus DSM 9941 chromosome

Total Repeats: 7218

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_008148	GTC	2	6	2300598	2300603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5002	NC_008148	GAT	2	6	2300642	2300647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_008148	ACCA	2	8	2300691	2300698	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5004	NC_008148	GGA	2	6	2300703	2300708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_008148	CCA	2	6	2300733	2300738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5006	NC_008148	TAGG	2	8	2300797	2300804	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_008148	CTC	2	6	2300842	2300847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5008	NC_008148	TAGG	2	8	2300865	2300872	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_008148	CAT	2	6	2300881	2300886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_008148	GGC	2	6	2300909	2300914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5011	NC_008148	TAGG	2	8	2300932	2300939	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5012	NC_008148	GAA	2	6	2300960	2300965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_008148	GGA	3	9	2300966	2300974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_008148	TAGG	2	8	2300998	2301005	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_008148	CGC	2	6	2301017	2301022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5016	NC_008148	GCG	2	6	2301034	2301039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_008148	GTGTT	2	10	2301046	2301055	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_008148	TAGG	2	8	2301067	2301074	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5019	NC_008148	TAGG	2	8	2301135	2301142	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5020	NC_008148	TAGG	2	8	2301202	2301209	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_008148	C	6	6	2301227	2301232	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5022	NC_008148	TAGG	2	8	2301269	2301276	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_008148	TAGG	2	8	2301334	2301341	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_008148	TAGG	2	8	2301401	2301408	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_008148	TAGG	2	8	2301467	2301474	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5026	NC_008148	TAGG	2	8	2301536	2301543	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5027	NC_008148	GATA	2	8	2301559	2301566	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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5029	NC_008148	G	6	6	2301576	2301581	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5030	NC_008148	TAGG	2	8	2301603	2301610	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5032	NC_008148	TAGG	2	8	2301670	2301677	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5033	NC_008148	TAGG	2	8	2301737	2301744	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5034	NC_008148	CTC	2	6	2301763	2301768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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5037	NC_008148	TAGG	2	8	2301803	2301810	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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5039	NC_008148	TAGG	2	8	2301869	2301876	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5040	NC_008148	C	6	6	2301889	2301894	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5041	NC_008148	G	6	6	2301899	2301904	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_008148	TAGG	2	8	2301936	2301943	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5043	NC_008148	GAG	2	6	2301952	2301957	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5044	NC_008148	GC	3	6	2301958	2301963	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5045	NC_008148	GCA	2	6	2301980	2301985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5046	NC_008148	TAGG	2	8	2302003	2302010	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5047	NC_008148	GAC	2	6	2302034	2302039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5048	NC_008148	TAGG	2	8	2302070	2302077	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_008148	GCC	2	6	2302088	2302093	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5050	NC_008148	TCA	2	6	2302097	2302102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_008148	TAGG	2	8	2302137	2302144	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_008148	TAGG	2	8	2302601	2302608	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_008148	CGT	3	9	2302627	2302635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_008148	TAGG	2	8	2302670	2302677	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_008148	GCC	2	6	2302695	2302700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5056	NC_008148	TAGG	2	8	2302736	2302743	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_008148	TAGG	2	8	2302803	2302810	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5058	NC_008148	AGT	2	6	2302852	2302857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5059	NC_008148	TAGG	2	8	2302870	2302877	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
5060	NC_008148	AACC	2	8	2302883	2302890	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5061	NC_008148	TTC	2	6	2302915	2302920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5062	NC_008148	TCCC	2	8	2302926	2302933	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5063	NC_008148	GTC	2	6	2302998	2303003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5064	NC_008148	AGA	2	6	2303071	2303076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5065	NC_008148	GAG	2	6	2304061	2304066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_008148	GCT	2	6	2304114	2304119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_008148	CGG	3	9	2304194	2304202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5068	NC_008148	GCAA	2	8	2306266	2306273	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5069	NC_008148	GGC	2	6	2306290	2306295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5070	NC_008148	CTC	2	6	2308151	2308156	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5071	NC_008148	CGC	2	6	2308168	2308173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5072	NC_008148	GAG	2	6	2308206	2308211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5073	NC_008148	CCT	2	6	2308239	2308244	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5074	NC_008148	GC	3	6	2308258	2308263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5075	NC_008148	AGC	2	6	2308302	2308307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5077	NC_008148	GCCC	2	8	2309472	2309479	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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5079	NC_008148	CCGGA	2	10	2309882	2309891	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5080	NC_008148	CGA	2	6	2310234	2310239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5081	NC_008148	CCGC	2	8	2310265	2310272	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5082	NC_008148	CGG	2	6	2312416	2312421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_008148	C	6	6	2312442	2312447	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
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5086	NC_008148	CCG	2	6	2313026	2313031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5087	NC_008148	G	6	6	2313038	2313043	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_008148	GA	3	6	2313067	2313072	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5089	NC_008148	TGG	2	6	2313095	2313100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_008148	TGG	2	6	2313116	2313121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_008148	GA	4	8	2313165	2313172	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_008148	ACACGG	2	12	2314031	2314042	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_008148	CG	3	6	2314049	2314054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5094	NC_008148	TCCC	2	8	2314065	2314072	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
5095	NC_008148	CG	3	6	2314073	2314078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5096	NC_008148	CCT	2	6	2314392	2314397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5097	NC_008148	CTCTC	2	10	2314409	2314418	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
5098	NC_008148	GCACCG	2	12	2315473	2315484	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
5099	NC_008148	CCA	3	9	2315485	2315493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5100	NC_008148	CAG	2	6	2315501	2315506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5101	NC_008148	GCAA	2	8	2317308	2317315	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
5102	NC_008148	G	6	6	2317328	2317333	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5103	NC_008148	GGCA	2	8	2317346	2317353	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5104	NC_008148	GT	3	6	2317391	2317396	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_008148	T	6	6	2317413	2317418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_008148	CGA	2	6	2317455	2317460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5107	NC_008148	TAT	2	6	2321701	2321706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5108	NC_008148	GAG	2	6	2321733	2321738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_008148	GCG	2	6	2321807	2321812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5110	NC_008148	C	6	6	2321820	2321825	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5111	NC_008148	CGG	2	6	2321830	2321835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5112	NC_008148	GCC	2	6	2321854	2321859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5113	NC_008148	TGC	2	6	2321869	2321874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_008148	GAG	2	6	2321941	2321946	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5115	NC_008148	CTG	2	6	2321956	2321961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5116	NC_008148	GGA	2	6	2321973	2321978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_008148	GAT	2	6	2324375	2324380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5118	NC_008148	ACC	2	6	2324384	2324389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5119	NC_008148	GCC	2	6	2326696	2326701	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5120	NC_008148	GCAG	2	8	2326716	2326723	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5121	NC_008148	CTC	2	6	2327290	2327295	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5122	NC_008148	CGC	2	6	2327304	2327309	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5123	NC_008148	GGA	2	6	2328205	2328210	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5124	NC_008148	GGGC	2	8	2328262	2328269	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5125	NC_008148	GCG	2	6	2328273	2328278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5126	NC_008148	GCCCG	2	10	2328283	2328292	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5127	NC_008148	GAGGG	2	10	2328293	2328302	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5128	NC_008148	CCT	2	6	2330359	2330364	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5129	NC_008148	CTC	3	9	2330376	2330384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5130	NC_008148	CCGG	2	8	2330405	2330412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5131	NC_008148	ACGC	2	8	2330426	2330433	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5132	NC_008148	GGC	2	6	2330434	2330439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5133	NC_008148	AGA	2	6	2330450	2330455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5134	NC_008148	CTAC	2	8	2331701	2331708	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5135	NC_008148	CT	3	6	2331729	2331734	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5136	NC_008148	CG	3	6	2331810	2331815	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5137	NC_008148	CT	3	6	2331828	2331833	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5168	NC_008148	GCC	2	6	2333956	2333961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5265	NC_008148	GGA	2	6	2384630	2384635	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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