MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 6692

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_008044	ACG	2	6	681813	681818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_008044	GAGC	2	8	681858	681865	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1503	NC_008044	AGCA	2	8	681885	681892	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1504	NC_008044	TTGA	2	8	681896	681903	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_008044	TAA	2	6	682919	682924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_008044	TAA	2	6	682930	682935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_008044	ATGC	2	8	682962	682969	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1508	NC_008044	TGT	2	6	683060	683065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_008044	ACT	2	6	683070	683075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1510	NC_008044	AACCC	2	10	683091	683100	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
1511	NC_008044	GCG	2	6	683120	683125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1512	NC_008044	GC	3	6	683173	683178	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1513	NC_008044	GC	3	6	683217	683222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1514	NC_008044	T	6	6	683249	683254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1515	NC_008044	A	6	6	683308	683313	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1516	NC_008044	TGG	2	6	683361	683366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1517	NC_008044	GCG	2	6	683412	683417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1518	NC_008044	CCT	2	6	683773	683778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1519	NC_008044	TC	3	6	685613	685618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1520	NC_008044	CA	3	6	685726	685731	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1521	NC_008044	CCG	2	6	685735	685740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1522	NC_008044	GAG	2	6	685765	685770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_008044	CA	3	6	685777	685782	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1524	NC_008044	GCC	2	6	685807	685812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1525	NC_008044	CATC	2	8	685814	685821	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1526	NC_008044	GC	3	6	685941	685946	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1527	NC_008044	CTTGT	2	10	689035	689044	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1528	NC_008044	CG	3	6	689112	689117	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1529	NC_008044	A	6	6	689201	689206	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1530	NC_008044	CAG	2	6	689225	689230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1531	NC_008044	CAG	2	6	689932	689937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_008044	CGCC	2	8	690059	690066	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1533	NC_008044	CTTG	2	8	690107	690114	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1534	NC_008044	CAA	2	6	690146	690151	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_008044	AGG	2	6	690160	690165	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_008044	GCA	2	6	690834	690839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_008044	GA	3	6	690856	690861	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_008044	G	6	6	690867	690872	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1539	NC_008044	AAC	2	6	690889	690894	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1540	NC_008044	AGT	2	6	690901	690906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_008044	GCA	2	6	690907	690912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_008044	AGC	2	6	691822	691827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_008044	GC	3	6	691848	691853	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1544	NC_008044	CTG	2	6	693122	693127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_008044	GAG	2	6	693151	693156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1546	NC_008044	GCC	2	6	693213	693218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1548	NC_008044	GGA	2	6	694659	694664	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_008044	GGCT	2	8	694761	694768	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1550	NC_008044	TGA	2	6	694781	694786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_008044	GC	3	6	696092	696097	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1552	NC_008044	GGC	2	6	696100	696105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_008044	CG	4	8	696122	696129	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1554	NC_008044	GAT	2	6	698231	698236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_008044	GGC	2	6	703083	703088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1556	NC_008044	TGT	2	6	703100	703105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_008044	CG	3	6	703115	703120	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1558	NC_008044	AACC	2	8	703173	703180	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1559	NC_008044	TGT	2	6	703213	703218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_008044	AGTT	2	8	703234	703241	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_008044	GCTG	2	8	703298	703305	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1562	NC_008044	TGT	2	6	703311	703316	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1563	NC_008044	GC	3	6	703335	703340	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1564	NC_008044	G	6	6	704803	704808	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1565	NC_008044	GTC	2	6	705817	705822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1566	NC_008044	GCC	2	6	705825	705830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1567	NC_008044	CGT	2	6	705841	705846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1568	NC_008044	A	6	6	705901	705906	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_008044	GCCA	2	8	705958	705965	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1570	NC_008044	GC	3	6	705967	705972	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1571	NC_008044	GA	4	8	706009	706016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1573	NC_008044	TCT	2	6	707272	707277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1574	NC_008044	CG	4	8	707305	707312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1575	NC_008044	GAA	2	6	707995	708000	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1576	NC_008044	ATG	2	6	708062	708067	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1579	NC_008044	TGA	2	6	708835	708840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1581	NC_008044	TTG	2	6	710721	710726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_008044	TCC	2	6	710801	710806	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1583	NC_008044	GCC	2	6	710872	710877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1584	NC_008044	CGA	2	6	712241	712246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1591	NC_008044	GC	3	6	714909	714914	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1592	NC_008044	CG	4	8	714931	714938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1593	NC_008044	GGA	2	6	715491	715496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_008044	ATG	2	6	715607	715612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1596	NC_008044	GCCC	2	8	718352	718359	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1597	NC_008044	GC	3	6	718394	718399	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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1601	NC_008044	GC	3	6	719489	719494	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1602	NC_008044	GTC	2	6	719522	719527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_008044	TCC	2	6	719574	719579	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1604	NC_008044	CGC	2	6	719679	719684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1608	NC_008044	TGA	2	6	721867	721872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1609	NC_008044	TA	4	8	721898	721905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1611	NC_008044	GAAA	2	8	723656	723663	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1612	NC_008044	A	6	6	723661	723666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1613	NC_008044	T	6	6	723693	723698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_008044	GAT	2	6	724041	724046	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1616	NC_008044	GCG	2	6	724159	724164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1617	NC_008044	GA	3	6	726087	726092	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_008044	GC	3	6	728798	728803	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1619	NC_008044	GCA	2	6	728816	728821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_008044	TAA	2	6	728925	728930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_008044	CAA	2	6	728982	728987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_008044	TGG	2	6	730174	730179	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_008044	AAG	2	6	730194	730199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_008044	AGGC	2	8	730204	730211	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1625	NC_008044	CCT	2	6	732731	732736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1626	NC_008044	AAGCG	2	10	732818	732827	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1627	NC_008044	GCG	2	6	732835	732840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_008044	CGG	2	6	732857	732862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1629	NC_008044	GC	3	6	733147	733152	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1630	NC_008044	CG	3	6	733157	733162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1631	NC_008044	GCT	2	6	734291	734296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1632	NC_008044	GC	3	6	734376	734381	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1633	NC_008044	ACT	2	6	734391	734396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1634	NC_008044	AGAC	2	8	734424	734431	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
1635	NC_008044	GCG	2	6	737666	737671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1637	NC_008044	CG	4	8	737867	737874	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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2000	NC_008044	GTA	2	6	936617	936622	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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