MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 6692

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_008044	CTT	2	6	2718374	2718379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6003	NC_008044	CAC	2	6	2718475	2718480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6004	NC_008044	GC	3	6	2719682	2719687	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6005	NC_008044	CG	3	6	2719702	2719707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6006	NC_008044	CGA	2	6	2719767	2719772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6007	NC_008044	TTCACA	2	12	2720231	2720242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6008	NC_008044	CGC	2	6	2720256	2720261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6009	NC_008044	GCG	2	6	2720281	2720286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6010	NC_008044	GCA	2	6	2720315	2720320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6011	NC_008044	GCGCT	2	10	2721381	2721390	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6012	NC_008044	GCC	2	6	2721444	2721449	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6013	NC_008044	CAT	2	6	2723374	2723379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6014	NC_008044	GTG	2	6	2724627	2724632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6016	NC_008044	CCA	2	6	2728216	2728221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6017	NC_008044	TAT	2	6	2729528	2729533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6018	NC_008044	TGG	2	6	2729567	2729572	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6019	NC_008044	ATA	2	6	2731256	2731261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6020	NC_008044	A	6	6	2731279	2731284	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6021	NC_008044	CT	3	6	2731315	2731320	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6022	NC_008044	GCCC	2	8	2731331	2731338	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6023	NC_008044	AG	4	8	2731340	2731347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6025	NC_008044	CGGG	2	8	2732573	2732580	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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6031	NC_008044	GCC	2	6	2734264	2734269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6032	NC_008044	GC	3	6	2735194	2735199	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6038	NC_008044	GCCGC	2	10	2738265	2738274	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
6039	NC_008044	GC	3	6	2738920	2738925	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6061	NC_008044	GTC	2	6	2750455	2750460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6062	NC_008044	CGG	2	6	2751414	2751419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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6065	NC_008044	GC	4	8	2751515	2751522	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6096	NC_008044	G	6	6	2771376	2771381	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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6102	NC_008044	CT	4	8	2781185	2781192	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6106	NC_008044	GC	3	6	2784307	2784312	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6107	NC_008044	GC	3	6	2784327	2784332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6108	NC_008044	T	6	6	2785565	2785570	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6109	NC_008044	CAG	2	6	2785575	2785580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6110	NC_008044	CTG	2	6	2786296	2786301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6111	NC_008044	CGC	3	9	2786865	2786873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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6113	NC_008044	TGT	2	6	2786925	2786930	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6115	NC_008044	ATG	2	6	2786957	2786962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6117	NC_008044	CCCG	2	8	2787988	2787995	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6118	NC_008044	C	6	6	2788063	2788068	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
6119	NC_008044	TCCC	2	8	2788134	2788141	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
6120	NC_008044	CGCC	2	8	2789783	2789790	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6121	NC_008044	GC	3	6	2789822	2789827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6122	NC_008044	GCCA	2	8	2789832	2789839	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
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6127	NC_008044	GCG	2	6	2796041	2796046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6128	NC_008044	GCC	2	6	2796063	2796068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6129	NC_008044	GTG	2	6	2796457	2796462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6130	NC_008044	AGA	2	6	2796477	2796482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6131	NC_008044	CCAG	2	8	2800348	2800355	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6132	NC_008044	A	6	6	2800472	2800477	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6133	NC_008044	CG	3	6	2801125	2801130	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6134	NC_008044	AACAGA	2	12	2801174	2801185	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
6135	NC_008044	GA	3	6	2801184	2801189	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6136	NC_008044	AGG	2	6	2801192	2801197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6137	NC_008044	AGC	2	6	2801231	2801236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6138	NC_008044	ACC	2	6	2801238	2801243	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6139	NC_008044	CT	3	6	2801269	2801274	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6140	NC_008044	GCC	2	6	2801487	2801492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6141	NC_008044	CG	3	6	2801529	2801534	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6142	NC_008044	GC	3	6	2801550	2801555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6143	NC_008044	CG	3	6	2801568	2801573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6144	NC_008044	GC	4	8	2801622	2801629	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6145	NC_008044	GAC	2	6	2802282	2802287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6146	NC_008044	GAG	2	6	2803385	2803390	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6147	NC_008044	GC	3	6	2803407	2803412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6148	NC_008044	AG	3	6	2803480	2803485	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6149	NC_008044	GGC	2	6	2803486	2803491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6150	NC_008044	GCC	2	6	2803492	2803497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6151	NC_008044	TCC	2	6	2803524	2803529	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6152	NC_008044	AGA	3	9	2803723	2803731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6154	NC_008044	CAT	2	6	2809819	2809824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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6156	NC_008044	GGC	2	6	2811906	2811911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6157	NC_008044	CCCGT	2	10	2811964	2811973	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
6158	NC_008044	GCCC	2	8	2811991	2811998	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6159	NC_008044	CTT	2	6	2813978	2813983	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6160	NC_008044	CGG	2	6	2814045	2814050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6161	NC_008044	CA	3	6	2817198	2817203	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6162	NC_008044	GCC	2	6	2817224	2817229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6163	NC_008044	CCGG	2	8	2817247	2817254	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6164	NC_008044	CAC	2	6	2817281	2817286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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6166	NC_008044	CG	3	6	2818316	2818321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6167	NC_008044	CGCT	2	8	2818417	2818424	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6168	NC_008044	CG	4	8	2818471	2818478	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6169	NC_008044	CG	3	6	2819263	2819268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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6173	NC_008044	GC	4	8	2819824	2819831	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6174	NC_008044	TGC	2	6	2820962	2820967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6189	NC_008044	A	6	6	2832069	2832074	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6201	NC_008044	T	6	6	2839688	2839693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6204	NC_008044	A	6	6	2840663	2840668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6205	NC_008044	A	7	7	2840676	2840682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6230	NC_008044	TTG	2	6	2865191	2865196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6232	NC_008044	CG	3	6	2866075	2866080	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6233	NC_008044	T	7	7	2866100	2866106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6234	NC_008044	GC	3	6	2866107	2866112	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6235	NC_008044	GA	3	6	2866133	2866138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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6261	NC_008044	TGCC	2	8	2883163	2883170	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6262	NC_008044	ATG	2	6	2883171	2883176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6263	NC_008044	CA	3	6	2883183	2883188	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6264	NC_008044	GA	3	6	2883193	2883198	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6265	NC_008044	GGA	2	6	2889834	2889839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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6267	NC_008044	CCCG	2	8	2891548	2891555	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6268	NC_008044	G	6	6	2891583	2891588	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6269	NC_008044	TTC	2	6	2896117	2896122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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