MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 chromosome

Total Repeats: 6692

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_008044	GC	3	6	2017777	2017782	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4502	NC_008044	GC	3	6	2017833	2017838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4503	NC_008044	AGA	3	9	2017863	2017871	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4504	NC_008044	TGC	2	6	2019307	2019312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_008044	GC	3	6	2021172	2021177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4506	NC_008044	GCCT	2	8	2021183	2021190	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4507	NC_008044	CAG	2	6	2021205	2021210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_008044	CGC	2	6	2021219	2021224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4509	NC_008044	CG	3	6	2021340	2021345	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4510	NC_008044	CTC	2	6	2021413	2021418	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4511	NC_008044	TTC	2	6	2021422	2021427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_008044	ACTC	2	8	2021496	2021503	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4513	NC_008044	TCG	2	6	2023400	2023405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4514	NC_008044	CCCG	2	8	2023443	2023450	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4515	NC_008044	GTT	2	6	2023456	2023461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4516	NC_008044	A	6	6	2023465	2023470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_008044	CG	3	6	2023496	2023501	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4518	NC_008044	GC	3	6	2023510	2023515	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4519	NC_008044	GCACA	2	10	2023533	2023542	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
4520	NC_008044	TCC	2	6	2024517	2024522	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4521	NC_008044	TTA	2	6	2025168	2025173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4522	NC_008044	GCA	3	9	2025250	2025258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_008044	CAT	2	6	2026057	2026062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_008044	C	6	6	2027367	2027372	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4525	NC_008044	GGT	2	6	2033154	2033159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4526	NC_008044	AC	3	6	2033198	2033203	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4527	NC_008044	GTC	2	6	2033211	2033216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4528	NC_008044	GC	3	6	2033382	2033387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4529	NC_008044	CTT	2	6	2033476	2033481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_008044	AAG	2	6	2033606	2033611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4531	NC_008044	CCG	2	6	2033618	2033623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4532	NC_008044	GGC	2	6	2033644	2033649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4533	NC_008044	TCT	2	6	2035917	2035922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4534	NC_008044	CTGCA	2	10	2036140	2036149	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4535	NC_008044	AG	3	6	2036154	2036159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_008044	A	6	6	2036189	2036194	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_008044	CG	3	6	2037518	2037523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4538	NC_008044	GCAAGA	2	12	2037543	2037554	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4539	NC_008044	CAGGC	2	10	2039916	2039925	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4540	NC_008044	TCC	2	6	2040025	2040030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4541	NC_008044	CAG	2	6	2041226	2041231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_008044	ATC	2	6	2041248	2041253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_008044	GTA	2	6	2041258	2041263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_008044	A	6	6	2041290	2041295	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_008044	GGC	2	6	2041369	2041374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4546	NC_008044	CCG	2	6	2042608	2042613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4547	NC_008044	A	7	7	2042644	2042650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4548	NC_008044	CGT	2	6	2042680	2042685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4549	NC_008044	C	6	6	2042791	2042796	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4550	NC_008044	CGCC	2	8	2042824	2042831	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4551	NC_008044	TGCGC	2	10	2042835	2042844	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4552	NC_008044	CT	4	8	2042913	2042920	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4553	NC_008044	CACCG	2	10	2042982	2042991	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4554	NC_008044	GTC	2	6	2043010	2043015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4555	NC_008044	GC	3	6	2044045	2044050	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4556	NC_008044	CG	3	6	2044180	2044185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4557	NC_008044	GAT	2	6	2044190	2044195	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4558	NC_008044	ATC	2	6	2044858	2044863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4559	NC_008044	GGCGC	2	10	2045809	2045818	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4560	NC_008044	ATGC	2	8	2047851	2047858	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4561	NC_008044	TGG	2	6	2047863	2047868	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4562	NC_008044	T	6	6	2048325	2048330	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_008044	AGA	2	6	2048334	2048339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_008044	CCTG	2	8	2048344	2048351	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4565	NC_008044	AAG	2	6	2049865	2049870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_008044	AGG	2	6	2049887	2049892	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4567	NC_008044	G	6	6	2049891	2049896	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4568	NC_008044	CCA	2	6	2049915	2049920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4569	NC_008044	CGGG	2	8	2051372	2051379	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4570	NC_008044	CTC	2	6	2051390	2051395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4571	NC_008044	GGCG	2	8	2051438	2051445	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4572	NC_008044	GC	3	6	2051461	2051466	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4573	NC_008044	TGT	2	6	2051468	2051473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4575	NC_008044	GC	3	6	2051592	2051597	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4576	NC_008044	CAC	3	9	2051690	2051698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4577	NC_008044	GACC	2	8	2051712	2051719	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4578	NC_008044	CG	3	6	2052947	2052952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4579	NC_008044	CTGCG	2	10	2053032	2053041	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4580	NC_008044	CTGCG	2	10	2053077	2053086	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4581	NC_008044	CTG	2	6	2053151	2053156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4584	NC_008044	TGC	2	6	2053248	2053253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4587	NC_008044	CGGT	2	8	2054571	2054578	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4588	NC_008044	CT	3	6	2054607	2054612	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4589	NC_008044	GC	3	6	2054626	2054631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4590	NC_008044	TCA	2	6	2054648	2054653	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4592	NC_008044	CGC	2	6	2054749	2054754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4593	NC_008044	CGTGC	2	10	2054775	2054784	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4594	NC_008044	TGC	2	6	2054814	2054819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4595	NC_008044	CG	3	6	2054843	2054848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4596	NC_008044	GCC	2	6	2054866	2054871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4597	NC_008044	GCG	2	6	2054873	2054878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4598	NC_008044	CGG	2	6	2054879	2054884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_008044	AC	3	6	2054889	2054894	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4600	NC_008044	TCT	2	6	2054928	2054933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4601	NC_008044	GGA	2	6	2054942	2054947	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_008044	GC	3	6	2054984	2054989	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4603	NC_008044	ACGCCC	2	12	2055046	2055057	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
4604	NC_008044	GGT	2	6	2055078	2055083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_008044	CCTGA	2	10	2056240	2056249	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
4606	NC_008044	A	7	7	2056334	2056340	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4607	NC_008044	A	8	8	2056353	2056360	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4608	NC_008044	AATG	2	8	2056364	2056371	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4609	NC_008044	ATCC	2	8	2056436	2056443	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4610	NC_008044	CGTC	2	8	2056451	2056458	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4611	NC_008044	TCT	2	6	2056515	2056520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_008044	GCCG	2	8	2056556	2056563	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4613	NC_008044	CCGC	2	8	2058152	2058159	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4614	NC_008044	CGACGC	2	12	2058201	2058212	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
4615	NC_008044	CT	3	6	2058257	2058262	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4616	NC_008044	GC	3	6	2058263	2058268	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4617	NC_008044	CG	3	6	2058322	2058327	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4618	NC_008044	GC	4	8	2058353	2058360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4619	NC_008044	GC	3	6	2058398	2058403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4620	NC_008044	GCC	2	6	2058467	2058472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4622	NC_008044	CG	3	6	2058495	2058500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4623	NC_008044	CGA	2	6	2058509	2058514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4625	NC_008044	GCC	2	6	2059145	2059150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4626	NC_008044	GGC	2	6	2059157	2059162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_008044	AGC	2	6	2059183	2059188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4629	NC_008044	CTT	2	6	2062711	2062716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4630	NC_008044	GC	3	6	2062741	2062746	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4631	NC_008044	CG	3	6	2062843	2062848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4632	NC_008044	GCC	2	6	2063501	2063506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4633	NC_008044	GCAAA	2	10	2063509	2063518	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
4634	NC_008044	TCCCCC	2	12	2063539	2063550	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
4635	NC_008044	GAC	2	6	2063569	2063574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4636	NC_008044	GAC	2	6	2063623	2063628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4642	NC_008044	CCGC	2	8	2064994	2065001	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4643	NC_008044	GCCC	2	8	2065007	2065014	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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