MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Ruegeria sp. TM1040 mega plasmid

Total Repeats: 1978

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_008043	TC	3	6	179133	179138	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
502	NC_008043	CAG	2	6	179169	179174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_008043	CGC	2	6	179181	179186	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
504	NC_008043	GCC	2	6	179205	179210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_008043	A	7	7	179254	179260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_008043	CAA	2	6	179264	179269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_008043	CAA	2	6	179271	179276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_008043	ATA	2	6	179301	179306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
509	NC_008043	CCA	2	6	179376	179381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
510	NC_008043	GAA	2	6	179465	179470	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_008043	CAA	2	6	179485	179490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_008043	AAAC	2	8	179495	179502	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
513	NC_008043	ACAA	2	8	180517	180524	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
514	NC_008043	GCT	2	6	180886	180891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_008043	GGCC	2	8	180971	180978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
516	NC_008043	CCA	2	6	181014	181019	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
517	NC_008043	CGCC	2	8	181050	181057	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
518	NC_008043	ATC	2	6	181058	181063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_008043	ATG	2	6	185644	185649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_008043	GCC	2	6	186483	186488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_008043	TGG	2	6	186501	186506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
522	NC_008043	ATC	2	6	186546	186551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_008043	ACCG	2	8	186674	186681	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
524	NC_008043	GC	4	8	186767	186774	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
525	NC_008043	AATT	2	8	186783	186790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
526	NC_008043	CT	3	6	186801	186806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
527	NC_008043	GC	3	6	189341	189346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
528	NC_008043	CG	3	6	189357	189362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
529	NC_008043	A	6	6	189510	189515	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
530	NC_008043	CGAAT	2	10	189613	189622	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
531	NC_008043	CG	3	6	189724	189729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
532	NC_008043	ACC	2	6	189746	189751	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_008043	TATAAG	2	12	189871	189882	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_008043	GGGA	2	8	189896	189903	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
535	NC_008043	CCG	2	6	190021	190026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
536	NC_008043	GA	3	6	191153	191158	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
537	NC_008043	CTG	2	6	191166	191171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_008043	CAA	2	6	191204	191209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_008043	GAGG	2	8	191210	191217	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
540	NC_008043	AC	3	6	193066	193071	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
541	NC_008043	CGA	2	6	193103	193108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_008043	GTG	2	6	193126	193131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
543	NC_008043	AGG	2	6	193304	193309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
544	NC_008043	GCA	2	6	193310	193315	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_008043	GCA	2	6	197579	197584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_008043	CAC	2	6	197605	197610	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_008043	GCC	2	6	197730	197735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_008043	CTG	2	6	197737	197742	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_008043	C	6	6	197770	197775	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
550	NC_008043	CG	3	6	197816	197821	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
551	NC_008043	GCA	2	6	197902	197907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_008043	TGC	2	6	197932	197937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
553	NC_008043	GAA	2	6	197944	197949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
554	NC_008043	T	6	6	198684	198689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
555	NC_008043	GTGA	2	8	198715	198722	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
556	NC_008043	AC	3	6	202946	202951	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
557	NC_008043	GCC	2	6	202966	202971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_008043	GC	3	6	202973	202978	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
559	NC_008043	CCT	2	6	203036	203041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
560	NC_008043	CG	3	6	203042	203047	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
561	NC_008043	TGA	2	6	203124	203129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
562	NC_008043	GA	4	8	203128	203135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
563	NC_008043	TC	3	6	205572	205577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
564	NC_008043	GGAA	2	8	206647	206654	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
565	NC_008043	CGC	3	9	207225	207233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
566	NC_008043	GC	3	6	207232	207237	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
567	NC_008043	CT	3	6	207303	207308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
568	NC_008043	AC	3	6	208022	208027	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
569	NC_008043	GC	3	6	211329	211334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
570	NC_008043	CG	3	6	211350	211355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
571	NC_008043	CAGC	2	8	212667	212674	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
572	NC_008043	CTC	2	6	212694	212699	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_008043	CCT	2	6	213841	213846	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
574	NC_008043	AGA	2	6	213876	213881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_008043	CGC	2	6	214012	214017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
576	NC_008043	GAGG	2	8	216449	216456	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
577	NC_008043	CCG	2	6	216485	216490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
578	NC_008043	CTG	2	6	216542	216547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_008043	TCC	3	9	216572	216580	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
580	NC_008043	TCCG	2	8	216657	216664	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
581	NC_008043	GTT	2	6	216736	216741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
582	NC_008043	CATG	2	8	216781	216788	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
583	NC_008043	GC	3	6	216847	216852	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
584	NC_008043	GGA	2	6	216954	216959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
585	NC_008043	AAT	2	6	218046	218051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_008043	AAT	2	6	220163	220168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_008043	GTC	2	6	220263	220268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_008043	CCGC	2	8	220338	220345	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
589	NC_008043	ATC	2	6	220353	220358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_008043	GATA	2	8	220361	220368	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
591	NC_008043	CACC	2	8	220399	220406	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
592	NC_008043	GCA	2	6	220463	220468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_008043	CA	3	6	220508	220513	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
594	NC_008043	AGC	2	6	220534	220539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_008043	GAA	2	6	220558	220563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
596	NC_008043	CCA	2	6	220567	220572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
597	NC_008043	GCAC	2	8	220626	220633	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
598	NC_008043	AG	3	6	220695	220700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
599	NC_008043	AGG	2	6	221520	221525	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
600	NC_008043	TTG	2	6	224890	224895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_008043	CCTTG	2	10	227556	227565	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
602	NC_008043	ATT	2	6	227629	227634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_008043	GGA	2	6	227636	227641	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_008043	AGGCA	2	10	227644	227653	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
605	NC_008043	GC	3	6	227665	227670	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
606	NC_008043	CGC	2	6	227757	227762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_008043	GCA	2	6	227796	227801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
608	NC_008043	ATC	2	6	230524	230529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_008043	TGGC	2	8	230607	230614	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
610	NC_008043	ACA	3	9	230617	230625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
611	NC_008043	TG	4	8	230646	230653	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
612	NC_008043	CGC	2	6	230659	230664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_008043	CG	5	10	230688	230697	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
614	NC_008043	TC	3	6	230730	230735	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
615	NC_008043	CTC	2	6	233963	233968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_008043	CCT	2	6	233993	233998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_008043	CGA	2	6	233999	234004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_008043	CCG	2	6	234086	234091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_008043	CGGCC	2	10	234165	234174	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
620	NC_008043	CT	3	6	234181	234186	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
621	NC_008043	GGA	2	6	234190	234195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
622	NC_008043	GC	4	8	235212	235219	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
623	NC_008043	ATG	2	6	237746	237751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
624	NC_008043	GC	3	6	237760	237765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
625	NC_008043	G	8	8	237770	237777	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
626	NC_008043	GC	3	6	237811	237816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
627	NC_008043	TGC	2	6	237817	237822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_008043	TGA	2	6	240477	240482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_008043	CAT	2	6	240506	240511	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_008043	ACTGAA	2	12	240528	240539	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
631	NC_008043	A	6	6	240547	240552	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_008043	CAG	2	6	241497	241502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
633	NC_008043	GGT	2	6	241576	241581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
634	NC_008043	AAAGC	2	10	241638	241647	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
635	NC_008043	CCA	3	9	241798	241806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
636	NC_008043	CCA	2	6	241969	241974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
637	NC_008043	CTT	2	6	242000	242005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
638	NC_008043	CGC	2	6	242083	242088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
639	NC_008043	TGC	2	6	242107	242112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
640	NC_008043	CCCG	2	8	242246	242253	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
641	NC_008043	ACC	2	6	242301	242306	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
642	NC_008043	ACT	2	6	242330	242335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
643	NC_008043	GCA	2	6	242780	242785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
644	NC_008043	CG	3	6	242822	242827	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
645	NC_008043	TCAT	2	8	242897	242904	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
646	NC_008043	ACC	2	6	242938	242943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
647	NC_008043	CGG	2	6	242980	242985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
648	NC_008043	CGG	2	6	243025	243030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
649	NC_008043	AGC	2	6	243079	243084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
650	NC_008043	CGC	2	6	243247	243252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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652	NC_008043	GCA	2	6	243519	243524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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659	NC_008043	GGC	3	9	249653	249661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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661	NC_008043	GAG	2	6	249728	249733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
662	NC_008043	AAC	2	6	250864	250869	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
663	NC_008043	G	6	6	250935	250940	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
664	NC_008043	GCC	2	6	251517	251522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
665	NC_008043	GCC	2	6	251563	251568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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671	NC_008043	TGC	2	6	251721	251726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
672	NC_008043	GC	3	6	251725	251730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
673	NC_008043	CT	3	6	252294	252299	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
674	NC_008043	GC	3	6	252574	252579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
675	NC_008043	A	6	6	255124	255129	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
676	NC_008043	TTG	2	6	256255	256260	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
677	NC_008043	TCA	2	6	256263	256268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
678	NC_008043	TGT	3	9	259792	259800	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
679	NC_008043	GAG	2	6	260631	260636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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683	NC_008043	GC	3	6	265299	265304	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
684	NC_008043	GC	4	8	265326	265333	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
685	NC_008043	GT	3	6	265363	265368	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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690	NC_008043	GGA	2	6	270079	270084	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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722	NC_008043	T	6	6	281347	281352	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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