MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB5 chromosome

Total Repeats: 13948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007958	GGC	2	6	1427867	1427872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_007958	TGC	2	6	1427894	1427899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4003	NC_007958	GCT	2	6	1427926	1427931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_007958	TCC	2	6	1429781	1429786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_007958	GGC	2	6	1429809	1429814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_007958	CAATCG	2	12	1431619	1431630	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_007958	GCC	2	6	1431698	1431703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4008	NC_007958	GTT	2	6	1431748	1431753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_007958	GGC	2	6	1431806	1431811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_007958	CCG	2	6	1431813	1431818	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4011	NC_007958	CTGCC	2	10	1431829	1431838	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4012	NC_007958	CGG	2	6	1431863	1431868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_007958	GCC	2	6	1431905	1431910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4014	NC_007958	AGCGA	2	10	1432951	1432960	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4015	NC_007958	AGC	2	6	1433464	1433469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_007958	GGT	2	6	1433494	1433499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4017	NC_007958	GC	3	6	1433545	1433550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4018	NC_007958	GTG	2	6	1433594	1433599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_007958	TGG	2	6	1433626	1433631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4020	NC_007958	CGC	2	6	1433648	1433653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4021	NC_007958	GCG	2	6	1433657	1433662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_007958	GAAGC	2	10	1433695	1433704	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4023	NC_007958	CCA	2	6	1433723	1433728	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_007958	GGC	3	9	1433744	1433752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_007958	GCC	2	6	1433757	1433762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4026	NC_007958	ATT	2	6	1433810	1433815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4027	NC_007958	CAT	2	6	1433859	1433864	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_007958	CCGG	2	8	1433905	1433912	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4029	NC_007958	GC	3	6	1433968	1433973	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4030	NC_007958	CCG	2	6	1434016	1434021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4031	NC_007958	CTA	2	6	1434022	1434027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4032	NC_007958	GCA	2	6	1434060	1434065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_007958	GAA	2	6	1434102	1434107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_007958	CCG	2	6	1434126	1434131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4035	NC_007958	GC	3	6	1434138	1434143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4036	NC_007958	CAC	2	6	1434186	1434191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4037	NC_007958	GC	3	6	1434206	1434211	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4038	NC_007958	CGA	2	6	1434311	1434316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_007958	GC	4	8	1434414	1434421	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4040	NC_007958	CG	3	6	1434475	1434480	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4041	NC_007958	GCG	2	6	1434513	1434518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_007958	CGT	2	6	1435074	1435079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_007958	GTC	2	6	1438197	1438202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_007958	CGG	2	6	1438215	1438220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_007958	CTG	2	6	1438239	1438244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_007958	TCC	2	6	1439228	1439233	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4047	NC_007958	ATC	2	6	1439271	1439276	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_007958	ACG	3	9	1439301	1439309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_007958	TCC	2	6	1440467	1440472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4050	NC_007958	TTTG	2	8	1440476	1440483	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_007958	ACG	2	6	1440546	1440551	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_007958	GCC	2	6	1440571	1440576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4053	NC_007958	CGC	2	6	1440642	1440647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4054	NC_007958	GC	3	6	1440653	1440658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4055	NC_007958	GTT	2	6	1440668	1440673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_007958	CTGTG	2	10	1440729	1440738	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
4057	NC_007958	ATC	2	6	1442208	1442213	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_007958	GC	3	6	1442218	1442223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4059	NC_007958	GCCGC	2	10	1443199	1443208	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4060	NC_007958	CG	4	8	1445384	1445391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4061	NC_007958	CGGC	2	8	1445397	1445404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4062	NC_007958	CGC	2	6	1445416	1445421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4063	NC_007958	AAC	2	6	1445447	1445452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_007958	AAC	2	6	1445477	1445482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4065	NC_007958	CTTAA	2	10	1445485	1445494	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4066	NC_007958	A	6	6	1445517	1445522	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_007958	GC	3	6	1445590	1445595	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4068	NC_007958	GAG	2	6	1445617	1445622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_007958	CGA	2	6	1446259	1446264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_007958	ATC	2	6	1446266	1446271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4071	NC_007958	ATC	2	6	1446291	1446296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_007958	T	7	7	1446320	1446326	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_007958	GAC	2	6	1446367	1446372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_007958	CG	3	6	1446379	1446384	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4075	NC_007958	TCG	2	6	1446394	1446399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4076	NC_007958	CAT	2	6	1446420	1446425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_007958	CGG	2	6	1446493	1446498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4078	NC_007958	CG	3	6	1446747	1446752	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4079	NC_007958	GTA	2	6	1446831	1446836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_007958	CCG	2	6	1446850	1446855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4081	NC_007958	ATA	2	6	1446902	1446907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4082	NC_007958	TCGCT	2	10	1447926	1447935	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4083	NC_007958	AGC	2	6	1447948	1447953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_007958	CGC	2	6	1447954	1447959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4085	NC_007958	CGC	2	6	1447988	1447993	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4086	NC_007958	CCG	2	6	1448037	1448042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4087	NC_007958	GTTTTT	2	12	1448713	1448724	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_007958	TC	3	6	1448774	1448779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4089	NC_007958	GCGCA	2	10	1448817	1448826	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4090	NC_007958	TCG	2	6	1448839	1448844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_007958	GAG	2	6	1448849	1448854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4092	NC_007958	CAT	2	6	1451231	1451236	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4093	NC_007958	CGG	2	6	1451245	1451250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_007958	AGGC	2	8	1451288	1451295	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4095	NC_007958	CTC	2	6	1452651	1452656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4096	NC_007958	ATGC	2	8	1452657	1452664	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4097	NC_007958	GCGG	2	8	1452665	1452672	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4098	NC_007958	AGC	2	6	1452695	1452700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_007958	CA	3	6	1452795	1452800	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4100	NC_007958	GGC	2	6	1452823	1452828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_007958	GAC	2	6	1452856	1452861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4102	NC_007958	AAC	2	6	1454611	1454616	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_007958	GA	3	6	1454641	1454646	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_007958	CGA	2	6	1454864	1454869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4105	NC_007958	TCGT	2	8	1454874	1454881	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4106	NC_007958	GCGA	2	8	1454893	1454900	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4107	NC_007958	GC	3	6	1457568	1457573	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4108	NC_007958	GCG	2	6	1457641	1457646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_007958	TC	3	6	1462451	1462456	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4110	NC_007958	CGG	2	6	1462494	1462499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_007958	CGT	2	6	1462500	1462505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4112	NC_007958	GCG	2	6	1462537	1462542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4113	NC_007958	TTA	2	6	1462560	1462565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_007958	TCAGGG	2	12	1462680	1462691	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4115	NC_007958	GAT	2	6	1463337	1463342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_007958	TGACA	2	10	1466658	1466667	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
4117	NC_007958	CTGT	2	8	1466754	1466761	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4118	NC_007958	TTC	2	6	1466762	1466767	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_007958	AGC	2	6	1466785	1466790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_007958	CGG	2	6	1466816	1466821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_007958	GCCG	2	8	1466865	1466872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4122	NC_007958	GTCGC	2	10	1467430	1467439	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
4123	NC_007958	ACG	2	6	1469540	1469545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_007958	T	6	6	1469590	1469595	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_007958	CAGT	2	8	1469645	1469652	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4126	NC_007958	GGA	2	6	1469689	1469694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4127	NC_007958	CCG	2	6	1470374	1470379	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4128	NC_007958	GAA	2	6	1470416	1470421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_007958	TGC	2	6	1470427	1470432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4130	NC_007958	CAAA	2	8	1470696	1470703	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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