MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB5 chromosome

Total Repeats: 13948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007958	CAG	2	6	1214339	1214344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_007958	TGGC	2	8	1214367	1214374	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3503	NC_007958	GC	3	6	1214421	1214426	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3504	NC_007958	ATT	2	6	1215407	1215412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3505	NC_007958	GTT	2	6	1215462	1215467	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_007958	CGA	2	6	1215548	1215553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_007958	G	6	6	1215654	1215659	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3508	NC_007958	CGA	2	6	1217438	1217443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3509	NC_007958	TTCGGC	2	12	1217452	1217463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_007958	GAC	2	6	1217879	1217884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_007958	GCG	2	6	1217912	1217917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_007958	CGC	2	6	1217940	1217945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3513	NC_007958	CG	3	6	1218003	1218008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3514	NC_007958	GCG	2	6	1219597	1219602	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3515	NC_007958	GTC	2	6	1223555	1223560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_007958	GAG	2	6	1223566	1223571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3517	NC_007958	CAAT	2	8	1223617	1223624	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3518	NC_007958	ACG	2	6	1223672	1223677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_007958	GTT	2	6	1223737	1223742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3520	NC_007958	ACCC	2	8	1223815	1223822	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3521	NC_007958	GA	4	8	1224030	1224037	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3522	NC_007958	GCCGG	2	10	1224947	1224956	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3523	NC_007958	CGGC	2	8	1224967	1224974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3524	NC_007958	CGG	2	6	1224979	1224984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_007958	AAC	2	6	1225000	1225005	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_007958	ACC	2	6	1228148	1228153	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3527	NC_007958	CAA	2	6	1231046	1231051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_007958	GCC	2	6	1232154	1232159	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3529	NC_007958	CG	3	6	1232186	1232191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3530	NC_007958	GGA	2	6	1232557	1232562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_007958	CGC	2	6	1233294	1233299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3532	NC_007958	GGAGGG	2	12	1233381	1233392	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_007958	AGCG	2	8	1233403	1233410	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3534	NC_007958	GGGTG	2	10	1233411	1233420	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3535	NC_007958	CCG	2	6	1233434	1233439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3536	NC_007958	CACC	2	8	1233451	1233458	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3537	NC_007958	CG	3	6	1233477	1233482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3538	NC_007958	CCG	2	6	1233487	1233492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3539	NC_007958	TGC	2	6	1233620	1233625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_007958	CGT	2	6	1234030	1234035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3541	NC_007958	GCG	2	6	1237447	1237452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3542	NC_007958	CG	3	6	1237835	1237840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3543	NC_007958	ATCG	2	8	1237852	1237859	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3544	NC_007958	TC	3	6	1237933	1237938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3545	NC_007958	GCC	2	6	1238016	1238021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3546	NC_007958	AG	3	6	1238995	1239000	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3547	NC_007958	TCG	3	9	1241834	1241842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_007958	CGC	2	6	1242446	1242451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3549	NC_007958	AAT	2	6	1242470	1242475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3550	NC_007958	GTCGC	2	10	1242523	1242532	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
3551	NC_007958	CAA	2	6	1242576	1242581	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_007958	CGAG	2	8	1242605	1242612	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3553	NC_007958	TGTT	2	8	1242624	1242631	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3554	NC_007958	GGC	2	6	1243162	1243167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_007958	TGA	2	6	1243174	1243179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3556	NC_007958	CGG	2	6	1243526	1243531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3557	NC_007958	TCGAAT	2	12	1243670	1243681	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3558	NC_007958	CGC	2	6	1243783	1243788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3559	NC_007958	TCAG	2	8	1243795	1243802	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3560	NC_007958	GAG	2	6	1243817	1243822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_007958	ACC	2	6	1245075	1245080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3562	NC_007958	GAG	2	6	1245081	1245086	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_007958	CG	3	6	1246068	1246073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3564	NC_007958	TCA	2	6	1246096	1246101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3565	NC_007958	ACA	2	6	1248480	1248485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_007958	ACG	2	6	1248547	1248552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3567	NC_007958	CGC	2	6	1249440	1249445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3568	NC_007958	ACA	2	6	1249448	1249453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3569	NC_007958	GCG	2	6	1251158	1251163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_007958	TGCG	2	8	1251194	1251201	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3571	NC_007958	GCC	2	6	1251218	1251223	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3572	NC_007958	CGCGG	2	10	1251317	1251326	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3573	NC_007958	TGC	2	6	1251340	1251345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_007958	GC	3	6	1251373	1251378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3575	NC_007958	CG	4	8	1251475	1251482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3576	NC_007958	CGG	2	6	1251518	1251523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_007958	ACC	2	6	1251540	1251545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3578	NC_007958	GCC	2	6	1251648	1251653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3579	NC_007958	CGC	2	6	1251656	1251661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3580	NC_007958	GTC	2	6	1251668	1251673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3581	NC_007958	CG	3	6	1251683	1251688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3582	NC_007958	CCCGC	2	10	1251744	1251753	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
3583	NC_007958	GCC	2	6	1251771	1251776	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3584	NC_007958	G	6	6	1251831	1251836	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3585	NC_007958	GC	3	6	1251841	1251846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3586	NC_007958	TCG	2	6	1251862	1251867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3587	NC_007958	CG	4	8	1251866	1251873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3588	NC_007958	GCT	2	6	1252778	1252783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3591	NC_007958	CAA	2	6	1254724	1254729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3592	NC_007958	TGT	2	6	1254812	1254817	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_007958	TTG	2	6	1254830	1254835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_007958	AGG	2	6	1254862	1254867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3596	NC_007958	TTC	2	6	1257829	1257834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_007958	CG	3	6	1257839	1257844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3598	NC_007958	AGC	2	6	1259408	1259413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3599	NC_007958	GTT	2	6	1259425	1259430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3600	NC_007958	CGC	2	6	1259827	1259832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3601	NC_007958	GC	3	6	1259831	1259836	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3602	NC_007958	CGT	2	6	1262651	1262656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3603	NC_007958	CCG	2	6	1262664	1262669	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3604	NC_007958	TGC	2	6	1262740	1262745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_007958	GCC	2	6	1262773	1262778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3606	NC_007958	CCG	2	6	1262850	1262855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3607	NC_007958	CTTTA	2	10	1262869	1262878	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3608	NC_007958	GCC	2	6	1262897	1262902	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3609	NC_007958	CGC	2	6	1262911	1262916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3610	NC_007958	GT	3	6	1262979	1262984	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3611	NC_007958	TTC	2	6	1267783	1267788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3612	NC_007958	CG	3	6	1267799	1267804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3613	NC_007958	GC	3	6	1267813	1267818	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3614	NC_007958	GCC	2	6	1268781	1268786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3615	NC_007958	CG	3	6	1268947	1268952	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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3617	NC_007958	GC	3	6	1271349	1271354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3618	NC_007958	TCGG	2	8	1272515	1272522	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3619	NC_007958	CGC	2	6	1272532	1272537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3620	NC_007958	TCG	3	9	1273637	1273645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_007958	CG	3	6	1273683	1273688	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3622	NC_007958	AG	3	6	1273695	1273700	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3623	NC_007958	CGG	2	6	1277302	1277307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3624	NC_007958	TCG	2	6	1277360	1277365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3627	NC_007958	CGTCC	2	10	1277713	1277722	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
3628	NC_007958	CGAT	2	8	1277756	1277763	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3629	NC_007958	GC	3	6	1277824	1277829	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3630	NC_007958	CCG	2	6	1277872	1277877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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