MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris BisB5 chromosome

Total Repeats: 13948

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_007958	GAT	2	6	4033713	4033718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11502	NC_007958	ACGCG	2	10	4033752	4033761	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11503	NC_007958	CCGCG	2	10	4033792	4033801	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11504	NC_007958	GCT	2	6	4033810	4033815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11505	NC_007958	CGC	2	6	4033849	4033854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11506	NC_007958	CG	3	6	4036730	4036735	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11507	NC_007958	CGG	2	6	4036740	4036745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11508	NC_007958	GCA	2	6	4036757	4036762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11509	NC_007958	GGC	2	6	4036797	4036802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11510	NC_007958	GCC	2	6	4036812	4036817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11511	NC_007958	TCA	2	6	4037476	4037481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11512	NC_007958	TGG	2	6	4037491	4037496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11513	NC_007958	GT	3	6	4037570	4037575	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11514	NC_007958	GCG	2	6	4037580	4037585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11515	NC_007958	GC	4	8	4037600	4037607	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11516	NC_007958	GCC	2	6	4038996	4039001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11517	NC_007958	CTG	2	6	4039017	4039022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11518	NC_007958	GCG	2	6	4039023	4039028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11519	NC_007958	GGC	2	6	4039031	4039036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11520	NC_007958	GCC	2	6	4039107	4039112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11521	NC_007958	CGC	2	6	4040531	4040536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11522	NC_007958	GTCA	2	8	4040540	4040547	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11523	NC_007958	GC	3	6	4040582	4040587	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11524	NC_007958	CGCGC	2	10	4040605	4040614	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
11525	NC_007958	GGA	2	6	4040629	4040634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11526	NC_007958	GAA	2	6	4041116	4041121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11527	NC_007958	CAGAA	2	10	4041129	4041138	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
11528	NC_007958	A	6	6	4041137	4041142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11529	NC_007958	ACG	2	6	4042394	4042399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11530	NC_007958	GAGCTT	2	12	4042600	4042611	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11531	NC_007958	AAGG	2	8	4042697	4042704	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11532	NC_007958	TGCG	2	8	4042714	4042721	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11533	NC_007958	GACC	2	8	4042784	4042791	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11534	NC_007958	GCCG	2	8	4047488	4047495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11535	NC_007958	CTGA	2	8	4047520	4047527	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11536	NC_007958	T	6	6	4047637	4047642	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11537	NC_007958	ATG	2	6	4047673	4047678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11538	NC_007958	GGC	2	6	4047690	4047695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11539	NC_007958	GCG	2	6	4047700	4047705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11540	NC_007958	TGAA	2	8	4047749	4047756	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11541	NC_007958	GGC	2	6	4047764	4047769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11542	NC_007958	CAA	2	6	4047792	4047797	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11543	NC_007958	CGA	2	6	4047808	4047813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11544	NC_007958	TTG	2	6	4047835	4047840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11545	NC_007958	TGC	2	6	4047899	4047904	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11546	NC_007958	CGT	2	6	4047935	4047940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11547	NC_007958	TTC	2	6	4048348	4048353	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11548	NC_007958	CTG	2	6	4048408	4048413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11549	NC_007958	G	6	6	4048597	4048602	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11550	NC_007958	AGA	2	6	4052898	4052903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11551	NC_007958	TTG	2	6	4052915	4052920	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11552	NC_007958	CTT	2	6	4055938	4055943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11553	NC_007958	ACG	2	6	4055950	4055955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11555	NC_007958	CGG	2	6	4056082	4056087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11556	NC_007958	CGG	2	6	4056091	4056096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11557	NC_007958	GCA	2	6	4056128	4056133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11558	NC_007958	TCGG	2	8	4056160	4056167	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11559	NC_007958	GCC	3	9	4056676	4056684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11560	NC_007958	CCG	2	6	4057890	4057895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11561	NC_007958	AGG	2	6	4057904	4057909	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11562	NC_007958	GTG	2	6	4057961	4057966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11563	NC_007958	CGC	2	6	4059393	4059398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11564	NC_007958	CGG	2	6	4061460	4061465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11565	NC_007958	GGA	2	6	4061477	4061482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11566	NC_007958	CT	3	6	4061531	4061536	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11567	NC_007958	GGAA	2	8	4063069	4063076	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11568	NC_007958	AAGC	2	8	4063081	4063088	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11569	NC_007958	AGC	2	6	4063114	4063119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11570	NC_007958	ATG	2	6	4064619	4064624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11572	NC_007958	TCGA	2	8	4066854	4066861	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11573	NC_007958	CTT	2	6	4066865	4066870	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11574	NC_007958	GAT	2	6	4066878	4066883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11576	NC_007958	GCG	2	6	4068110	4068115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11577	NC_007958	TG	3	6	4068127	4068132	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11578	NC_007958	TGG	2	6	4068525	4068530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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11581	NC_007958	AG	3	6	4071803	4071808	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11582	NC_007958	GC	3	6	4071809	4071814	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11583	NC_007958	GAA	2	6	4074068	4074073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11584	NC_007958	ATGC	2	8	4074612	4074619	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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11590	NC_007958	GCC	2	6	4075955	4075960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11591	NC_007958	ACCGTA	2	12	4075961	4075972	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11592	NC_007958	CCG	2	6	4075986	4075991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11593	NC_007958	ATA	2	6	4076015	4076020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11594	NC_007958	CCG	2	6	4076046	4076051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11595	NC_007958	GGCT	2	8	4076075	4076082	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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11597	NC_007958	GGC	2	6	4076155	4076160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11598	NC_007958	CTTG	2	8	4076212	4076219	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11599	NC_007958	TGC	2	6	4076235	4076240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11600	NC_007958	TGCGG	2	10	4076247	4076256	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
11601	NC_007958	GAGC	2	8	4076276	4076283	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
11602	NC_007958	GAA	2	6	4076381	4076386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11603	NC_007958	TGCT	2	8	4076387	4076394	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11604	NC_007958	ACT	2	6	4076511	4076516	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11605	NC_007958	CTTT	2	8	4076525	4076532	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11606	NC_007958	GGC	2	6	4076536	4076541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11608	NC_007958	TGC	2	6	4076624	4076629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11609	NC_007958	TCA	2	6	4076631	4076636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11610	NC_007958	CCG	2	6	4076679	4076684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11611	NC_007958	AG	3	6	4077002	4077007	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11612	NC_007958	GAT	2	6	4077086	4077091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11613	NC_007958	CGC	2	6	4077099	4077104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11614	NC_007958	CGA	2	6	4077134	4077139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11615	NC_007958	CGA	3	9	4077148	4077156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11618	NC_007958	CGC	2	6	4077811	4077816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11619	NC_007958	GACATG	2	12	4079167	4079178	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11620	NC_007958	CCCG	2	8	4079187	4079194	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11621	NC_007958	GTC	2	6	4079220	4079225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11622	NC_007958	GAAG	2	8	4081921	4081928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11623	NC_007958	TTGC	2	8	4082252	4082259	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11624	NC_007958	CAA	2	6	4082291	4082296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11625	NC_007958	AAT	2	6	4089769	4089774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11626	NC_007958	GC	3	6	4089789	4089794	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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