MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris HaA2 chromosome

Total Repeats: 15935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_007778	GCG	2	6	1354427	1354432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4002	NC_007778	GC	3	6	1355030	1355035	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4003	NC_007778	TTTG	2	8	1355053	1355060	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4004	NC_007778	CATC	2	8	1355091	1355098	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4005	NC_007778	GGAT	2	8	1355142	1355149	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4006	NC_007778	CGG	2	6	1355173	1355178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_007778	CAT	2	6	1357557	1357562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_007778	CGG	2	6	1357571	1357576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4009	NC_007778	CCG	2	6	1357596	1357601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4010	NC_007778	GGC	2	6	1357616	1357621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_007778	CTC	2	6	1358976	1358981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_007778	AGC	2	6	1359022	1359027	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_007778	CAGCC	2	10	1359166	1359175	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
4014	NC_007778	TGC	2	6	1359177	1359182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_007778	GGC	2	6	1359190	1359195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_007778	CGG	2	6	1360811	1360816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4017	NC_007778	GC	3	6	1360820	1360825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4018	NC_007778	CGAAG	2	10	1360864	1360873	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4019	NC_007778	CG	3	6	1360988	1360993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4020	NC_007778	CAC	2	6	1361006	1361011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4021	NC_007778	GCGA	2	8	1361231	1361238	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4022	NC_007778	TCG	2	6	1361281	1361286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_007778	CCT	2	6	1361293	1361298	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_007778	GTC	2	6	1361317	1361322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_007778	GGCA	2	8	1362168	1362175	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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4029	NC_007778	TCGACA	2	12	1364377	1364388	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_007778	TGT	2	6	1364498	1364503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4031	NC_007778	GC	3	6	1364527	1364532	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4032	NC_007778	GTG	2	6	1364616	1364621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4035	NC_007778	GCG	2	6	1369507	1369512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4039	NC_007778	GGC	3	9	1372904	1372912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4040	NC_007778	CGT	2	6	1373548	1373553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4041	NC_007778	CTGT	2	8	1374147	1374154	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4042	NC_007778	CGG	2	6	1374207	1374212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4043	NC_007778	GCCG	2	8	1374256	1374263	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4044	NC_007778	CGA	2	6	1376937	1376942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4051	NC_007778	CGG	2	6	1378095	1378100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4053	NC_007778	CGC	2	6	1378116	1378121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4056	NC_007778	GAG	2	6	1381167	1381172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_007778	CGA	2	6	1381178	1381183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4059	NC_007778	GCG	2	6	1381244	1381249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_007778	GCCGC	2	10	1382139	1382148	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4061	NC_007778	CGG	2	6	1382235	1382240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_007778	TGG	2	6	1382295	1382300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_007778	CAT	2	6	1382438	1382443	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4065	NC_007778	GT	3	6	1383298	1383303	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4093	NC_007778	CCGG	2	8	1385818	1385825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4096	NC_007778	CG	4	8	1388391	1388398	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4106	NC_007778	TCGC	2	8	1389982	1389989	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
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4111	NC_007778	GAAT	2	8	1396185	1396192	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_007778	TGAAA	2	10	1396242	1396251	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_007778	GAGT	2	8	1396289	1396296	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_007778	GCG	2	6	1396297	1396302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4117	NC_007778	CG	3	6	1396349	1396354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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4120	NC_007778	CG	3	6	1397995	1398000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4121	NC_007778	GGT	2	6	1398022	1398027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4125	NC_007778	GTC	2	6	1401918	1401923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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