MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris HaA2 chromosome

Total Repeats: 15935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_007778	CTG	2	6	1192646	1192651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3502	NC_007778	ATC	2	6	1196110	1196115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3503	NC_007778	TGC	2	6	1197765	1197770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_007778	CCG	3	9	1197803	1197811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3505	NC_007778	GGC	2	6	1197829	1197834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3506	NC_007778	CTG	2	6	1197851	1197856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_007778	CGG	2	6	1197887	1197892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_007778	CGC	2	6	1200770	1200775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3509	NC_007778	CGT	2	6	1200781	1200786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3510	NC_007778	CG	3	6	1200795	1200800	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3511	NC_007778	GTC	2	6	1200812	1200817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_007778	GAAC	2	8	1200822	1200829	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3513	NC_007778	AGAA	2	8	1200883	1200890	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_007778	TAGA	2	8	1200923	1200930	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3515	NC_007778	AAT	2	6	1200932	1200937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3516	NC_007778	TCC	2	6	1200947	1200952	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3517	NC_007778	GCC	2	6	1201001	1201006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3518	NC_007778	TTG	2	6	1201820	1201825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3519	NC_007778	CCT	2	6	1201838	1201843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3520	NC_007778	GAC	2	6	1201849	1201854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_007778	GTC	2	6	1201861	1201866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_007778	CGAT	2	8	1202887	1202894	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3523	NC_007778	GAT	2	6	1202902	1202907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_007778	GCA	2	6	1202915	1202920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_007778	GC	3	6	1202927	1202932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3526	NC_007778	CCCG	2	8	1202941	1202948	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
3527	NC_007778	CGC	2	6	1203023	1203028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3528	NC_007778	TC	3	6	1206800	1206805	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3529	NC_007778	GAAT	2	8	1206808	1206815	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_007778	CG	4	8	1206828	1206835	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3531	NC_007778	CG	4	8	1206847	1206854	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3532	NC_007778	TGG	2	6	1206855	1206860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3533	NC_007778	CAA	2	6	1206863	1206868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3534	NC_007778	GATC	2	8	1206904	1206911	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3535	NC_007778	CGGAG	2	10	1207399	1207408	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3536	NC_007778	CGG	2	6	1208961	1208966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3537	NC_007778	CGG	2	6	1208995	1209000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3538	NC_007778	CGCGG	2	10	1209095	1209104	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3539	NC_007778	GGC	2	6	1209109	1209114	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_007778	CGC	2	6	1209779	1209784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3541	NC_007778	TCGG	2	8	1210833	1210840	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3542	NC_007778	GCT	2	6	1210852	1210857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3543	NC_007778	CGC	2	6	1210938	1210943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3544	NC_007778	CCG	2	6	1210958	1210963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3545	NC_007778	GC	3	6	1211979	1211984	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3546	NC_007778	GC	3	6	1211993	1211998	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3547	NC_007778	GC	3	6	1212035	1212040	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3548	NC_007778	GAG	2	6	1212067	1212072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3549	NC_007778	CGC	2	6	1212083	1212088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3550	NC_007778	CG	3	6	1212093	1212098	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3551	NC_007778	CGG	2	6	1213863	1213868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_007778	CT	3	6	1213872	1213877	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3553	NC_007778	AC	3	6	1213890	1213895	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3554	NC_007778	CGG	2	6	1213901	1213906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3555	NC_007778	ACC	2	6	1213915	1213920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3556	NC_007778	CTC	2	6	1213943	1213948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3557	NC_007778	CG	3	6	1214028	1214033	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3558	NC_007778	CCGG	2	8	1214271	1214278	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3559	NC_007778	GACGC	2	10	1214323	1214332	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3560	NC_007778	GCC	2	6	1214951	1214956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3561	NC_007778	CCCGCC	2	12	1214998	1215009	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
3562	NC_007778	TCG	2	6	1216329	1216334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3563	NC_007778	CGC	2	6	1216338	1216343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3564	NC_007778	CAAC	2	8	1216351	1216358	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3565	NC_007778	AGC	2	6	1216400	1216405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_007778	GAG	2	6	1217704	1217709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_007778	CGA	2	6	1217715	1217720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_007778	GC	4	8	1217763	1217770	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3569	NC_007778	GTT	3	9	1219766	1219774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3570	NC_007778	CTG	2	6	1219779	1219784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3571	NC_007778	GGC	2	6	1219789	1219794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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3573	NC_007778	CGT	2	6	1219913	1219918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3574	NC_007778	CGC	2	6	1219955	1219960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3575	NC_007778	GCA	2	6	1219965	1219970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3578	NC_007778	CG	3	6	1220456	1220461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3579	NC_007778	GGAGGG	2	12	1221465	1221476	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
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3581	NC_007778	AGCG	2	8	1221487	1221494	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3582	NC_007778	GGGTG	2	10	1221495	1221504	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_007778	CACCC	2	10	1221535	1221544	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
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3586	NC_007778	GAGGG	2	10	1221657	1221666	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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3592	NC_007778	G	6	6	1225311	1225316	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3593	NC_007778	G	6	6	1225352	1225357	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
3594	NC_007778	CT	3	6	1225362	1225367	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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3596	NC_007778	CGA	2	6	1226549	1226554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3597	NC_007778	GC	3	6	1226643	1226648	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3598	NC_007778	CGGC	2	8	1226656	1226663	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3599	NC_007778	CG	4	8	1226700	1226707	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3600	NC_007778	CGG	2	6	1226749	1226754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3601	NC_007778	ATAGG	2	10	1226791	1226800	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_007778	TCC	2	6	1226811	1226816	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3603	NC_007778	GCT	2	6	1226906	1226911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_007778	TCT	2	6	1226934	1226939	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_007778	AAT	2	6	1227044	1227049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3606	NC_007778	TAT	2	6	1227052	1227057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3607	NC_007778	TGTCC	2	10	1227073	1227082	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
3608	NC_007778	CGT	2	6	1227103	1227108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3610	NC_007778	GGC	2	6	1227309	1227314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_007778	CCG	2	6	1227385	1227390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3612	NC_007778	GC	3	6	1227398	1227403	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3613	NC_007778	CGA	2	6	1227404	1227409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3614	NC_007778	CAC	2	6	1227449	1227454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3615	NC_007778	GC	3	6	1227469	1227474	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3616	NC_007778	CAT	2	6	1227517	1227522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_007778	AGC	2	6	1227721	1227726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_007778	CT	3	6	1227739	1227744	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3619	NC_007778	GC	4	8	1227805	1227812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3620	NC_007778	CGG	2	6	1228506	1228511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3621	NC_007778	CGC	2	6	1228515	1228520	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3622	NC_007778	GCGCG	2	10	1228535	1228544	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
3623	NC_007778	GCC	2	6	1228545	1228550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3624	NC_007778	CG	3	6	1228606	1228611	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3625	NC_007778	TCG	2	6	1228612	1228617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3629	NC_007778	GCG	2	6	1230309	1230314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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