MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris HaA2 chromosome

Total Repeats: 15935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13501	NC_007778	GCA	2	6	4597919	4597924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13502	NC_007778	CACGCT	2	12	4597929	4597940	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13503	NC_007778	CGC	2	6	4597955	4597960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13504	NC_007778	GAA	2	6	4597968	4597973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13505	NC_007778	TGA	2	6	4597975	4597980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13506	NC_007778	GCG	2	6	4598017	4598022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13507	NC_007778	GGC	2	6	4598024	4598029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13508	NC_007778	CGC	2	6	4598059	4598064	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13509	NC_007778	GCG	2	6	4598074	4598079	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13510	NC_007778	ATT	2	6	4598134	4598139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13511	NC_007778	CG	3	6	4598178	4598183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13512	NC_007778	CGG	2	6	4598190	4598195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13513	NC_007778	T	7	7	4599746	4599752	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13514	NC_007778	GCC	2	6	4599808	4599813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13515	NC_007778	GCG	2	6	4599818	4599823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13516	NC_007778	TCG	2	6	4599851	4599856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13517	NC_007778	CGC	2	6	4599857	4599862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13518	NC_007778	GC	3	6	4599866	4599871	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13519	NC_007778	GCG	2	6	4599884	4599889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13520	NC_007778	CGC	2	6	4599916	4599921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13521	NC_007778	TGC	2	6	4599928	4599933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13522	NC_007778	CGGCCG	2	12	4599955	4599966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13523	NC_007778	GA	3	6	4600961	4600966	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13524	NC_007778	GCC	2	6	4600967	4600972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13525	NC_007778	CGA	2	6	4602431	4602436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13526	NC_007778	CAC	2	6	4602462	4602467	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13527	NC_007778	GAT	2	6	4602480	4602485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13528	NC_007778	AAGC	2	8	4602528	4602535	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13529	NC_007778	CCT	2	6	4602944	4602949	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13530	NC_007778	GCT	2	6	4602998	4603003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13531	NC_007778	ATC	2	6	4603051	4603056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13532	NC_007778	CGC	2	6	4603069	4603074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13533	NC_007778	GCC	2	6	4603127	4603132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13534	NC_007778	GAT	2	6	4603172	4603177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13535	NC_007778	AC	3	6	4603182	4603187	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13536	NC_007778	G	6	6	4603213	4603218	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
13537	NC_007778	CCG	2	6	4603252	4603257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13538	NC_007778	AGCG	2	8	4606353	4606360	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13539	NC_007778	CTC	2	6	4606389	4606394	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13540	NC_007778	GC	3	6	4606418	4606423	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13541	NC_007778	CTG	2	6	4606449	4606454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13542	NC_007778	GAG	2	6	4606461	4606466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13543	NC_007778	AGA	2	6	4606469	4606474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13544	NC_007778	GTC	2	6	4606751	4606756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13545	NC_007778	GCG	2	6	4606762	4606767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13546	NC_007778	CGG	2	6	4608021	4608026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13547	NC_007778	CAC	2	6	4608925	4608930	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13548	NC_007778	CGT	2	6	4608939	4608944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13549	NC_007778	GGA	2	6	4609015	4609020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13550	NC_007778	CGC	2	6	4609031	4609036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13551	NC_007778	CCTGC	2	10	4610746	4610755	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13552	NC_007778	CG	3	6	4610771	4610776	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13553	NC_007778	GAT	2	6	4611656	4611661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13554	NC_007778	CTT	2	6	4611678	4611683	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13555	NC_007778	GCCG	2	8	4611794	4611801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13556	NC_007778	GTCA	2	8	4612233	4612240	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13557	NC_007778	GTTC	2	8	4612314	4612321	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13558	NC_007778	GTCA	2	8	4613192	4613199	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13559	NC_007778	CAT	2	6	4615903	4615908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13560	NC_007778	TTG	2	6	4615913	4615918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13561	NC_007778	CGG	2	6	4617014	4617019	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13562	NC_007778	CAG	2	6	4617054	4617059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13563	NC_007778	GGCC	2	8	4617188	4617195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13564	NC_007778	TCG	2	6	4617201	4617206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13565	NC_007778	CG	3	6	4617205	4617210	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13566	NC_007778	CGC	2	6	4617605	4617610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13567	NC_007778	CTCGG	2	10	4617727	4617736	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13568	NC_007778	GCC	2	6	4617742	4617747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13569	NC_007778	GCG	2	6	4618281	4618286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13570	NC_007778	CGG	2	6	4618327	4618332	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13571	NC_007778	GCC	2	6	4618347	4618352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13572	NC_007778	GGCC	2	8	4618367	4618374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13573	NC_007778	CGCA	2	8	4618487	4618494	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
13574	NC_007778	GCT	2	6	4618550	4618555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13576	NC_007778	GC	3	6	4620295	4620300	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13577	NC_007778	GCG	2	6	4620311	4620316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13578	NC_007778	GC	3	6	4620347	4620352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13579	NC_007778	GGC	2	6	4620359	4620364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13580	NC_007778	GC	3	6	4620363	4620368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13581	NC_007778	GCT	2	6	4622363	4622368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13582	NC_007778	CCAT	2	8	4622412	4622419	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
13583	NC_007778	CCG	2	6	4622455	4622460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
13584	NC_007778	CGG	2	6	4622470	4622475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13585	NC_007778	GAATG	2	10	4622480	4622489	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13586	NC_007778	GTC	2	6	4622497	4622502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13592	NC_007778	GC	3	6	4629139	4629144	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13593	NC_007778	AAC	2	6	4629218	4629223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13594	NC_007778	CG	3	6	4629225	4629230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13595	NC_007778	CGG	2	6	4629260	4629265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13596	NC_007778	ATG	2	6	4629272	4629277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13597	NC_007778	CG	3	6	4629278	4629283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13598	NC_007778	GC	4	8	4629299	4629306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13599	NC_007778	CTT	2	6	4629311	4629316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13600	NC_007778	TCC	2	6	4630313	4630318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
13601	NC_007778	TTG	2	6	4630339	4630344	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13602	NC_007778	GGC	2	6	4632029	4632034	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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13605	NC_007778	GTCA	2	8	4637538	4637545	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13606	NC_007778	GAT	2	6	4637552	4637557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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13608	NC_007778	AAACG	2	10	4638499	4638508	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
13609	NC_007778	GTCGGC	2	12	4638537	4638548	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13610	NC_007778	GGGC	2	8	4640471	4640478	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
13611	NC_007778	GC	3	6	4640477	4640482	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13612	NC_007778	CGACG	2	10	4640505	4640514	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13613	NC_007778	TCG	2	6	4640525	4640530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13614	NC_007778	ATGG	2	8	4640570	4640577	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
13615	NC_007778	GC	3	6	4640635	4640640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13616	NC_007778	CGCTC	2	10	4640667	4640676	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13617	NC_007778	CGA	2	6	4642815	4642820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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13623	NC_007778	GCT	2	6	4646369	4646374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13624	NC_007778	TC	3	6	4650462	4650467	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13625	NC_007778	TTA	2	6	4650490	4650495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13626	NC_007778	GGA	2	6	4651240	4651245	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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