MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris HaA2 chromosome

Total Repeats: 15935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12502	NC_007778	CGA	2	6	4262999	4263004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12503	NC_007778	GCG	2	6	4263033	4263038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12504	NC_007778	GTCG	2	8	4263069	4263076	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12505	NC_007778	GC	3	6	4263098	4263103	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12506	NC_007778	CGGG	2	8	4263136	4263143	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
12507	NC_007778	CGGCG	2	10	4263152	4263161	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12508	NC_007778	GC	4	8	4263205	4263212	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12509	NC_007778	CGC	2	6	4263246	4263251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12510	NC_007778	GCA	2	6	4263290	4263295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12511	NC_007778	CGC	2	6	4263408	4263413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12512	NC_007778	CGG	2	6	4263439	4263444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12513	NC_007778	CGA	2	6	4263447	4263452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12514	NC_007778	CG	3	6	4263456	4263461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12515	NC_007778	CA	3	6	4263753	4263758	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12516	NC_007778	ATCGCG	2	12	4263759	4263770	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12517	NC_007778	GAC	2	6	4263795	4263800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12518	NC_007778	CTC	2	6	4263849	4263854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12519	NC_007778	GCC	2	6	4263908	4263913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12520	NC_007778	CAC	2	6	4263954	4263959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12521	NC_007778	CGG	2	6	4264010	4264015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12522	NC_007778	CGG	2	6	4264028	4264033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12523	NC_007778	CGT	2	6	4264048	4264053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12524	NC_007778	ATT	2	6	4264114	4264119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12525	NC_007778	GGC	2	6	4264131	4264136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12526	NC_007778	GAC	2	6	4264155	4264160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12527	NC_007778	CCA	2	6	4264187	4264192	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12528	NC_007778	CGC	2	6	4264245	4264250	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12529	NC_007778	C	8	8	4264684	4264691	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
12530	NC_007778	GTT	2	6	4264697	4264702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12531	NC_007778	CG	3	6	4264703	4264708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12532	NC_007778	CGC	2	6	4264715	4264720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12533	NC_007778	GC	3	6	4264738	4264743	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12534	NC_007778	GTC	2	6	4264820	4264825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12535	NC_007778	GC	3	6	4266781	4266786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12536	NC_007778	GGC	2	6	4266825	4266830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12537	NC_007778	CGG	2	6	4266833	4266838	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12538	NC_007778	GCC	2	6	4266848	4266853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12539	NC_007778	AAT	2	6	4266890	4266895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12540	NC_007778	GC	3	6	4266980	4266985	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12541	NC_007778	GCCG	2	8	4267003	4267010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12542	NC_007778	CGG	2	6	4267061	4267066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12543	NC_007778	AAG	2	6	4267126	4267131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12544	NC_007778	CG	3	6	4268373	4268378	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12545	NC_007778	GGCCC	2	10	4268406	4268415	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
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12547	NC_007778	CTT	2	6	4268501	4268506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12549	NC_007778	GAC	2	6	4270301	4270306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12552	NC_007778	TGAT	2	8	4270459	4270466	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
12553	NC_007778	ATC	2	6	4270470	4270475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12555	NC_007778	CGT	2	6	4272766	4272771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12556	NC_007778	GCG	2	6	4272772	4272777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12557	NC_007778	CGA	2	6	4272797	4272802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12558	NC_007778	CGCC	2	8	4276270	4276277	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
12559	NC_007778	CG	3	6	4276321	4276326	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12560	NC_007778	CGG	2	6	4276382	4276387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12561	NC_007778	CGA	2	6	4276388	4276393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12563	NC_007778	CG	3	6	4276560	4276565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12564	NC_007778	CCG	2	6	4276618	4276623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12565	NC_007778	AGT	2	6	4278346	4278351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12567	NC_007778	TCAG	2	8	4278381	4278388	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12568	NC_007778	GGC	2	6	4281312	4281317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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12595	NC_007778	CCAC	2	8	4284778	4284785	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
12596	NC_007778	CGTC	2	8	4284813	4284820	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
12597	NC_007778	CG	3	6	4284887	4284892	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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12600	NC_007778	CG	3	6	4285138	4285143	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12601	NC_007778	GCG	2	6	4285149	4285154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12602	NC_007778	TG	4	8	4285156	4285163	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
12603	NC_007778	GTC	2	6	4285168	4285173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12611	NC_007778	CGA	2	6	4285472	4285477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12612	NC_007778	CG	3	6	4285482	4285487	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12613	NC_007778	CGC	2	6	4285526	4285531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12614	NC_007778	CG	4	8	4285565	4285572	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12615	NC_007778	GCA	2	6	4285583	4285588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12617	NC_007778	TCG	2	6	4285611	4285616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12618	NC_007778	CG	4	8	4286055	4286062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12619	NC_007778	GC	3	6	4286126	4286131	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12620	NC_007778	TAC	2	6	4286179	4286184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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12622	NC_007778	CG	3	6	4287227	4287232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12623	NC_007778	CGC	2	6	4287243	4287248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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12625	NC_007778	A	6	6	4287275	4287280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12626	NC_007778	CG	3	6	4287306	4287311	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12627	NC_007778	CG	3	6	4287619	4287624	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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