MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris HaA2 chromosome

Total Repeats: 15935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_007778	GCC	2	6	3801744	3801749	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11002	NC_007778	GGCGCA	2	12	3801760	3801771	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
11003	NC_007778	C	6	6	3801840	3801845	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11004	NC_007778	GGC	2	6	3801881	3801886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11005	NC_007778	CGATC	2	10	3801897	3801906	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
11006	NC_007778	GTTC	2	8	3801908	3801915	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11007	NC_007778	ATG	2	6	3801917	3801922	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11008	NC_007778	GGATT	2	10	3801935	3801944	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
11009	NC_007778	CGC	2	6	3801979	3801984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11010	NC_007778	GCGCA	2	10	3804917	3804926	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11011	NC_007778	AATG	2	8	3804981	3804988	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
11012	NC_007778	GGC	2	6	3805033	3805038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11013	NC_007778	GGC	2	6	3805063	3805068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11014	NC_007778	TGG	2	6	3805096	3805101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11015	NC_007778	C	6	6	3805184	3805189	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11016	NC_007778	CTT	2	6	3805236	3805241	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11017	NC_007778	T	8	8	3805257	3805264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11018	NC_007778	TGG	2	6	3805275	3805280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11019	NC_007778	GCT	2	6	3805323	3805328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11020	NC_007778	GAC	2	6	3805423	3805428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11021	NC_007778	CCG	2	6	3805469	3805474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11022	NC_007778	CGG	2	6	3805481	3805486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11023	NC_007778	CCT	2	6	3806158	3806163	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11024	NC_007778	CGGG	2	8	3806188	3806195	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
11025	NC_007778	TGA	2	6	3806231	3806236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11026	NC_007778	CAA	2	6	3806277	3806282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11027	NC_007778	TCC	2	6	3808159	3808164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11028	NC_007778	GTC	2	6	3808171	3808176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11029	NC_007778	CGG	2	6	3808181	3808186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11030	NC_007778	CCG	2	6	3808203	3808208	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11031	NC_007778	ATCA	2	8	3808216	3808223	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11032	NC_007778	TC	3	6	3809240	3809245	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11033	NC_007778	CCT	2	6	3809277	3809282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11034	NC_007778	TGC	2	6	3809363	3809368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11035	NC_007778	GCG	2	6	3809382	3809387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11036	NC_007778	TGA	2	6	3809420	3809425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_007778	GGC	2	6	3809427	3809432	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11038	NC_007778	GA	3	6	3811008	3811013	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11039	NC_007778	AAGCAG	2	12	3811115	3811126	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11040	NC_007778	G	6	6	3811141	3811146	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11041	NC_007778	CGC	2	6	3811166	3811171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11042	NC_007778	TCG	2	6	3811263	3811268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11043	NC_007778	GA	3	6	3811281	3811286	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11044	NC_007778	GAC	2	6	3811330	3811335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11045	NC_007778	CGA	2	6	3811374	3811379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11046	NC_007778	ACCT	2	8	3811399	3811406	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11047	NC_007778	CG	3	6	3811423	3811428	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11048	NC_007778	TTCC	2	8	3811437	3811444	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11049	NC_007778	GAC	2	6	3811479	3811484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11050	NC_007778	ACG	2	6	3811496	3811501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11051	NC_007778	GTC	2	6	3812581	3812586	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11052	NC_007778	ACG	2	6	3812700	3812705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11053	NC_007778	GAG	2	6	3812728	3812733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11054	NC_007778	CGA	2	6	3812739	3812744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11055	NC_007778	GCTTC	2	10	3812779	3812788	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11056	NC_007778	GGC	2	6	3814584	3814589	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11057	NC_007778	GCC	2	6	3814605	3814610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11058	NC_007778	TCC	2	6	3815431	3815436	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11059	NC_007778	G	6	6	3815466	3815471	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11060	NC_007778	C	6	6	3815496	3815501	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11061	NC_007778	G	6	6	3815522	3815527	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
11062	NC_007778	TCC	2	6	3816392	3816397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11063	NC_007778	CG	3	6	3816403	3816408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11064	NC_007778	CGC	2	6	3816419	3816424	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11065	NC_007778	CG	3	6	3816454	3816459	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11066	NC_007778	GGC	2	6	3816476	3816481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11067	NC_007778	CGC	2	6	3818835	3818840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11068	NC_007778	GC	3	6	3818839	3818844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11069	NC_007778	CTC	2	6	3819817	3819822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11070	NC_007778	GC	3	6	3819823	3819828	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11071	NC_007778	CTT	2	6	3821103	3821108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11072	NC_007778	CG	3	6	3821137	3821142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11073	NC_007778	GCG	2	6	3821975	3821980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11074	NC_007778	GC	3	6	3822012	3822017	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11075	NC_007778	GAA	2	6	3822049	3822054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_007778	CGC	2	6	3822060	3822065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11077	NC_007778	CGC	2	6	3822086	3822091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11078	NC_007778	CCA	2	6	3822107	3822112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11079	NC_007778	GTC	2	6	3822120	3822125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11082	NC_007778	GCG	3	9	3822210	3822218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11083	NC_007778	CG	3	6	3822242	3822247	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11084	NC_007778	CT	3	6	3823277	3823282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11085	NC_007778	CGG	2	6	3823284	3823289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11086	NC_007778	CTG	2	6	3823303	3823308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11088	NC_007778	CGG	2	6	3823386	3823391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11089	NC_007778	CG	3	6	3824345	3824350	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11090	NC_007778	GC	4	8	3824353	3824360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11091	NC_007778	GCT	2	6	3824388	3824393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11092	NC_007778	CG	3	6	3824409	3824414	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11093	NC_007778	C	6	6	3824421	3824426	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11094	NC_007778	ACG	2	6	3824449	3824454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11097	NC_007778	CGGTC	2	10	3825028	3825037	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11098	NC_007778	ATCG	2	8	3825042	3825049	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11099	NC_007778	CAG	2	6	3825099	3825104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11101	NC_007778	GCCG	2	8	3825177	3825184	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11102	NC_007778	AGG	2	6	3825193	3825198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11103	NC_007778	TCA	2	6	3825782	3825787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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11105	NC_007778	CAGCG	2	10	3825939	3825948	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
11106	NC_007778	GGT	2	6	3827775	3827780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_007778	A	6	6	3827816	3827821	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11108	NC_007778	CCGT	2	8	3827847	3827854	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11109	NC_007778	CGG	2	6	3827880	3827885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11110	NC_007778	ACC	2	6	3828079	3828084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11111	NC_007778	CCA	2	6	3828085	3828090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11112	NC_007778	TGC	2	6	3828110	3828115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11113	NC_007778	GCA	2	6	3828139	3828144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11114	NC_007778	GGC	2	6	3828155	3828160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11115	NC_007778	TCG	2	6	3828168	3828173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11117	NC_007778	GCC	2	6	3830073	3830078	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11118	NC_007778	GC	3	6	3830087	3830092	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11119	NC_007778	CGA	2	6	3830149	3830154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11124	NC_007778	TGC	2	6	3830304	3830309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11126	NC_007778	CGT	2	6	3830367	3830372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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