MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris HaA2 chromosome

Total Repeats: 15935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_007778	AGGC	2	8	1664796	1664803	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5002	NC_007778	GCA	2	6	1665621	1665626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5003	NC_007778	TCGC	2	8	1665640	1665647	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5004	NC_007778	CGTG	2	8	1665656	1665663	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
5005	NC_007778	TCGA	2	8	1666122	1666129	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5006	NC_007778	CTTG	2	8	1666160	1666167	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5007	NC_007778	TCA	2	6	1666209	1666214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5008	NC_007778	TGG	2	6	1667043	1667048	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_007778	CCG	2	6	1667082	1667087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5010	NC_007778	GC	3	6	1670169	1670174	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5011	NC_007778	GCGA	2	8	1670187	1670194	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5012	NC_007778	TCG	2	6	1670235	1670240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5013	NC_007778	GCTC	2	8	1670252	1670259	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5014	NC_007778	GA	3	6	1670291	1670296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5015	NC_007778	GCG	2	6	1670306	1670311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5016	NC_007778	CGG	2	6	1670426	1670431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5017	NC_007778	GA	3	6	1672152	1672157	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5018	NC_007778	CCT	2	6	1673274	1673279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5019	NC_007778	ATC	2	6	1673370	1673375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5020	NC_007778	CGT	2	6	1673386	1673391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5021	NC_007778	TGG	2	6	1674813	1674818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5022	NC_007778	CGG	2	6	1675603	1675608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5023	NC_007778	TGG	2	6	1675611	1675616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5024	NC_007778	AATT	2	8	1675677	1675684	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5025	NC_007778	GCG	2	6	1675699	1675704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5026	NC_007778	CGC	2	6	1675723	1675728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5027	NC_007778	GTC	2	6	1676468	1676473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5028	NC_007778	CGG	2	6	1676530	1676535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5029	NC_007778	CCGCG	2	10	1676574	1676583	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
5030	NC_007778	GCG	2	6	1676586	1676591	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5031	NC_007778	TGC	2	6	1676592	1676597	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5032	NC_007778	GC	3	6	1676663	1676668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5033	NC_007778	GC	4	8	1677762	1677769	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5034	NC_007778	CGT	2	6	1677773	1677778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5035	NC_007778	CTC	2	6	1679973	1679978	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5036	NC_007778	GCC	2	6	1680085	1680090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5037	NC_007778	TG	3	6	1680092	1680097	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5038	NC_007778	CAG	2	6	1680106	1680111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5039	NC_007778	GC	3	6	1680163	1680168	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5040	NC_007778	CCG	2	6	1681525	1681530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5041	NC_007778	AAG	2	6	1681557	1681562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5042	NC_007778	TTCA	2	8	1683013	1683020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5043	NC_007778	CGG	2	6	1683040	1683045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5044	NC_007778	CGGA	2	8	1685422	1685429	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5045	NC_007778	CCT	2	6	1685454	1685459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5046	NC_007778	CAG	2	6	1685471	1685476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5048	NC_007778	TTG	2	6	1695134	1695139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_007778	CGG	2	6	1696139	1696144	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5050	NC_007778	GCA	2	6	1696152	1696157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_007778	G	11	11	1696176	1696186	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_007778	CGG	2	6	1696733	1696738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5053	NC_007778	CGT	2	6	1696753	1696758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_007778	CAA	2	6	1696787	1696792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5055	NC_007778	ATG	2	6	1699313	1699318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5057	NC_007778	CAG	2	6	1699371	1699376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5059	NC_007778	GAC	2	6	1699409	1699414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_007778	GGC	2	6	1699426	1699431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5061	NC_007778	CG	3	6	1700049	1700054	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5062	NC_007778	ACG	2	6	1700107	1700112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5063	NC_007778	GCC	2	6	1700169	1700174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5064	NC_007778	CCG	2	6	1700178	1700183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5065	NC_007778	CGG	2	6	1700198	1700203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5066	NC_007778	GGA	2	6	1700244	1700249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5067	NC_007778	CG	3	6	1701119	1701124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5068	NC_007778	GCC	2	6	1701134	1701139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5069	NC_007778	GA	3	6	1701146	1701151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5070	NC_007778	GCCG	2	8	1701489	1701496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5071	NC_007778	CATC	2	8	1701764	1701771	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5072	NC_007778	G	6	6	1701879	1701884	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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5074	NC_007778	TGCA	2	8	1702773	1702780	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5075	NC_007778	GC	4	8	1703545	1703552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5076	NC_007778	CG	3	6	1703560	1703565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5077	NC_007778	CGT	2	6	1703606	1703611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5078	NC_007778	TCG	2	6	1703635	1703640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5079	NC_007778	C	6	6	1703673	1703678	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5080	NC_007778	A	8	8	1703679	1703686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_007778	CAC	2	6	1703771	1703776	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5082	NC_007778	GGA	2	6	1703778	1703783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5083	NC_007778	GTCA	2	8	1703865	1703872	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
5084	NC_007778	GCG	2	6	1705804	1705809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5085	NC_007778	ATTC	2	8	1705855	1705862	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5086	NC_007778	ATC	2	6	1705948	1705953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5088	NC_007778	TCCA	2	8	1707009	1707016	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5089	NC_007778	CG	3	6	1707055	1707060	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5090	NC_007778	GCC	2	6	1707108	1707113	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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5092	NC_007778	TGC	2	6	1707139	1707144	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5093	NC_007778	GTC	2	6	1707689	1707694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5094	NC_007778	CGC	2	6	1707761	1707766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5095	NC_007778	CGT	2	6	1707817	1707822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5096	NC_007778	GC	3	6	1707841	1707846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5097	NC_007778	TGA	2	6	1707858	1707863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5098	NC_007778	CGGG	2	8	1711209	1711216	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5099	NC_007778	A	7	7	1711229	1711235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5100	NC_007778	GC	3	6	1711238	1711243	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5101	NC_007778	CG	3	6	1711247	1711252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5102	NC_007778	GC	3	6	1711284	1711289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5103	NC_007778	GCC	2	6	1711335	1711340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5104	NC_007778	GA	3	6	1711357	1711362	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5105	NC_007778	A	6	6	1711395	1711400	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5106	NC_007778	GCAG	2	8	1711508	1711515	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5107	NC_007778	CTG	2	6	1711528	1711533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_007778	CAT	2	6	1711539	1711544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5109	NC_007778	GCCC	3	12	1711672	1711683	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5110	NC_007778	CTGC	2	8	1711685	1711692	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5111	NC_007778	CCGT	2	8	1711700	1711707	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5112	NC_007778	CGGG	2	8	1712909	1712916	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5113	NC_007778	ATC	2	6	1712940	1712945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_007778	GCG	2	6	1712960	1712965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5115	NC_007778	GC	3	6	1712969	1712974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5116	NC_007778	GCCG	2	8	1712980	1712987	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5117	NC_007778	CGCCGG	2	12	1713164	1713175	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5118	NC_007778	C	6	6	1713212	1713217	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5119	NC_007778	TCCGG	2	10	1713643	1713652	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5120	NC_007778	GCTC	2	8	1713710	1713717	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5121	NC_007778	TCGTC	2	10	1714135	1714144	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5122	NC_007778	GC	3	6	1714148	1714153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5123	NC_007778	CCTG	2	8	1714210	1714217	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5124	NC_007778	TGG	2	6	1714683	1714688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5125	NC_007778	CG	3	6	1714705	1714710	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5126	NC_007778	CG	4	8	1714795	1714802	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5127	NC_007778	CCG	2	6	1714825	1714830	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5128	NC_007778	GCG	2	6	1716413	1716418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5129	NC_007778	TCG	2	6	1716427	1716432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_007778	AGGCA	2	10	1717914	1717923	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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